Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMC4	Q12267	snR9	snR9	187 nt		-1.98	□□□□□ -2.73
SMC4	Q12267	YPR016W-A	YPR016W-A	261 nt		-1.98	□□□□□ -2.73
SMC4	Q12267	YHR125W	YHR125W	306 nt		-1.99	□□□□□ -2.73
SMC4	Q12267	YLR456W	YLR456W	615 nt		-1.99	□□□□□ -2.73
SMC4	Q12267	JLP2	YMR132C	627 nt		-1.99	□□□□□ -2.73
SMC4	Q12267	PMP2	YEL017C-A	132 nt		-2	□□□□□ -2.73
SMC4	Q12267	VPS20	YMR077C	666 nt		-2	□□□□□ -2.73
SMC4	Q12267	CBS1	YDL069C	690 nt		-2.01	□□□□□ -2.73
SMC4	Q12267	YBL071C	YBL071C	309 nt		-2.01	□□□□□ -2.73
SMC4	Q12267	snR34	snR34	203 nt		-2.01	□□□□□ -2.73
SMC4	Q12267	YER175W-A	YER175W-A	165 nt		-2.02	□□□□□ -2.73
SMC4	Q12267	YFL012W	YFL012W	447 nt		-2.02	□□□□□ -2.73
SMC4	Q12267	YBL039C-A	YBL039C-A	84 nt		-2.03	□□□□□ -2.73
SMC4	Q12267	tQ(UUG)Q	tQ(UUG)Q	76 nt		-2.04	□□□□□ -2.74
SMC4	Q12267	CSE2	YNR010W	450 nt		-2.05	□□□□□ -2.74
SMC4	Q12267	YMR193C-A	YMR193C-A	387 nt		-2.07	□□□□□ -2.74
SMC4	Q12267	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-2.07	□□□□□ -2.74
SMC4	Q12267	YDR544C	YDR544C	429 nt		-2.08	□□□□□ -2.74
SMC4	Q12267	YAF9	YNL107W	681 nt		-2.08	□□□□□ -2.74
SMC4	Q12267	YKL044W	YKL044W	321 nt		-2.08	□□□□□ -2.74
SMC4	Q12267	PCC1	YKR095W-A	267 nt		-2.08	□□□□□ -2.74
SMC4	Q12267	GPI15	YNL038W	690 nt		-2.09	□□□□□ -2.74
SMC4	Q12267	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-2.1	□□□□□ -2.75
SMC4	Q12267	TOM22	YNL131W	459 nt		-2.11	□□□□□ -2.75
SMC4	Q12267	YOR121C	YOR121C	306 nt		-2.13	□□□□□ -2.75
SMC4	Q12267	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		-2.14	□□□□□ -2.75
SMC4	Q12267	PRM3	YPL192C	402 nt		-2.14	□□□□□ -2.75
SMC4	Q12267	YDL016C	YDL016C	303 nt		-2.15	□□□□□ -2.75
SMC4	Q12267	YGR069W	YGR069W	336 nt		-2.15	□□□□□ -2.75
SMC4	Q12267	YGR174W-A	YGR174W-A	87 nt		-2.15	□□□□□ -2.75
SMC4	Q12267	YIL029C	YIL029C	429 nt		-2.15	□□□□□ -2.75
SMC4	Q12267	YBR285W	YBR285W	435 nt		-2.16	□□□□□ -2.75
SMC4	Q12267	BI2	Q0110	1272 nt		-2.17	□□□□□ -2.76
SMC4	Q12267	YNL266W	YNL266W	420 nt		-2.17	□□□□□ -2.76
SMC4	Q12267	snR81	snR81	201 nt		-2.18	□□□□□ -2.76
SMC4	Q12267	snR50	snR50	90 nt		-2.2	□□□□□ -2.76
SMC4	Q12267	snR77	snR77	88 nt		-2.23	□□□□□ -2.77
SMC4	Q12267	YDR543C	YDR543C	300 nt		-2.23	□□□□□ -2.77
SMC4	Q12267	YAL068W-A	YAL068W-A	255 nt		-2.23	□□□□□ -2.77
SMC4	Q12267	YNL205C	YNL205C	423 nt		-2.24	□□□□□ -2.77
SMC4	Q12267	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-2.25	□□□□□ -2.77
SMC4	Q12267	snR39B	snR39B	96 nt		-2.25	□□□□□ -2.77
SMC4	Q12267	RPS27B	YHR021C	249 nt		-2.26	□□□□□ -2.77
SMC4	Q12267	YLL019W-A	YLL019W-A	93 nt		-2.26	□□□□□ -2.77
SMC4	Q12267	Q0142	Q0142	177 nt		-2.27	□□□□□ -2.77
SMC4	Q12267	YML099W-A	YML099W-A	330 nt		-2.28	□□□□□ -2.77
SMC4	Q12267	YAR047C	YAR047C	321 nt		-2.29	□□□□□ -2.78
SMC4	Q12267	YLR269C	YLR269C	351 nt		-2.29	□□□□□ -2.78
SMC4	Q12267	YOR314W-A	YOR314W-A	111 nt		-2.29	□□□□□ -2.78
SMC4	Q12267	snR69	snR69	101 nt		-2.32	□□□□□ -2.78
SMC4	Q12267	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-2.33	□□□□□ -2.78
SMC4	Q12267	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-2.34	□□□□□ -2.78
SMC4	Q12267	YJL197C-A	YJL197C-A	282 nt		-2.34	□□□□□ -2.78
SMC4	Q12267	HMRA1	YCR097W	381 nt		-2.35	□□□□□ -2.79
SMC4	Q12267	YGL149W	YGL149W	306 nt		-2.41	□□□□□ -2.79
SMC4	Q12267	YLR202C	YLR202C	327 nt		-2.41	□□□□□ -2.79
SMC4	Q12267	snR67	snR67	82 nt		-2.42	□□□□□ -2.8
SMC4	Q12267	YIL115W-A	YIL115W-A	372 nt		-2.42	□□□□□ -2.8
SMC4	Q12267	RDS3	YPR094W	324 nt		-2.42	□□□□□ -2.8
SMC4	Q12267	YDR102C	YDR102C	333 nt		-2.43	□□□□□ -2.8
SMC4	Q12267	YIR021W-A	YIR021W-A	213 nt		-2.45	□□□□□ -2.8
SMC4	Q12267	YDR048C	YDR048C	315 nt		-2.49	□□□□□ -2.81
SMC4	Q12267	CSN9	YDR179C	489 nt		-2.49	□□□□□ -2.81
SMC4	Q12267	YOR008C-A	YOR008C-A	225 nt		-2.5	□□□□□ -2.81
SMC4	Q12267	YOR293C-A	YOR293C-A	150 nt		-2.5	□□□□□ -2.81
SMC4	Q12267	YER137W-A	YER137W-A	306 nt		-2.54	□□□□□ -2.82
SMC4	Q12267	YOR072W-B	YOR072W-B	162 nt		-2.55	□□□□□ -2.82
SMC4	Q12267	EAF6	YJR082C	342 nt		-2.56	□□□□□ -2.82
SMC4	Q12267	YOR309C	YOR309C	381 nt		-2.62	□□□□□ -2.83
SMC4	Q12267	MPC1	YGL080W	393 nt		-2.63	□□□□□ -2.83
SMC4	Q12267	YDL158C	YDL158C	309 nt		-2.67	□□□□□ -2.84
SMC4	Q12267	YER097W	YER097W	330 nt		-2.68	□□□□□ -2.84
SMC4	Q12267	YLR412C-A	YLR412C-A	207 nt		-2.69	□□□□□ -2.84
SMC4	Q12267	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-2.71	□□□□□ -2.84
SMC4	Q12267	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-2.73	□□□□□ -2.85
SMC4	Q12267	YFL032W	YFL032W	321 nt		-2.75	□□□□□ -2.85
SMC4	Q12267	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		-2.76	□□□□□ -2.85
SMC4	Q12267	YMR172C-A	YMR172C-A	384 nt		-2.76	□□□□□ -2.85
SMC4	Q12267	snR54	snR54	86 nt		-2.76	□□□□□ -2.85
SMC4	Q12267	YFL019C	YFL019C	354 nt		-2.8	□□□□□ -2.86
SMC4	Q12267	YBR182C-A	YBR182C-A	195 nt		-2.8	□□□□□ -2.86
SMC4	Q12267	tM(CAU)Q2	tM(CAU)Q2	78 nt		-2.81	□□□□□ -2.86
SMC4	Q12267	snR60	snR60	104 nt		-2.83	□□□□□ -2.86
SMC4	Q12267	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-2.83	□□□□□ -2.86
SMC4	Q12267	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-2.84	□□□□□ -2.86
SMC4	Q12267	YAL066W	YAL066W	309 nt		-2.86	□□□□□ -2.87
SMC4	Q12267	YBR178W	YBR178W	375 nt		-2.89	□□□□□ -2.87
SMC4	Q12267	YER006C-A	YER006C-A	318 nt		-2.9	□□□□□ -2.87
SMC4	Q12267	YKL063C	YKL063C	504 nt		-2.93	□□□□□ -2.88
SMC4	Q12267	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-2.93	□□□□□ -2.88
SMC4	Q12267	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		-2.93	□□□□□ -2.88
SMC4	Q12267	YNL324W	YNL324W	396 nt		-2.94	□□□□□ -2.88
SMC4	Q12267	YOR381W-A	YOR381W-A	168 nt		-2.94	□□□□□ -2.88
SMC4	Q12267	ATP6	Q0085	780 nt		-2.95	□□□□□ -2.88
SMC4	Q12267	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-2.96	□□□□□ -2.88
SMC4	Q12267	YNL028W	YNL028W	318 nt		-2.97	□□□□□ -2.88
SMC4	Q12267	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-2.98	□□□□□ -2.89
SMC4	Q12267	YLR406C-A	YLR406C-A	150 nt		-3	□□□□□ -2.89
SMC4	Q12267	YLR434C	YLR434C	384 nt		-3	□□□□□ -2.89
SMC4	Q12267	YMR001C-A	YMR001C-A	231 nt		-3	□□□□□ -2.89

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