Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	snR74	snR74	88 nt		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	RPL39	YJL189W	156 nt		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	YMR172C-A	YMR172C-A	384 nt		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	ORC3	YLL004W	1851 nt		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	tF(GAA)B	tF(GAA)B	73 nt		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	YDR371C-A	YDR371C-A	105 nt		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	tF(GAA)F	tF(GAA)F	73 nt		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	tF(GAA)G	tF(GAA)G	73 nt		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	tF(GAA)H1	tF(GAA)H1	73 nt		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	tF(GAA)H2	tF(GAA)H2	73 nt		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	tF(GAA)M	tF(GAA)M	73 nt		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	tF(GAA)P1	tF(GAA)P1	73 nt		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	tF(GAA)P2	tF(GAA)P2	73 nt		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	RPS26A	YGL189C	360 nt		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	NNF2	YGR089W	2811 nt		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	FMP27	YLR454W	7887 nt		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	YOR072W-B	YOR072W-B	162 nt		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	BUL2	YML111W	2763 nt		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	BLI1	YKL061W	342 nt		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	COX12	YLR038C	252 nt		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	MLP2	YIL149C	5040 nt		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	YGL052W	YGL052W	306 nt		0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	Q12045	IQG1	YPL242C	4488 nt		0.27	□□□□□ -2.37
VIK1	Q12045	NIP1	YMR309C	2439 nt		0.27	□□□□□ -2.37
VIK1	Q12045	YER053C-A	YER053C-A	114 nt		0.27	□□□□□ -2.37
VIK1	Q12045	YKL145W-A	YKL145W-A	93 nt		0.27	□□□□□ -2.37
VIK1	Q12045	YNL146W	YNL146W	303 nt		0.27	□□□□□ -2.37
VIK1	Q12045	RCO1	YMR075W	2055 nt		0.26	□□□□□ -2.37
VIK1	Q12045	YHR131W-A	YHR131W-A	246 nt		0.26	□□□□□ -2.37
VIK1	Q12045	MLP1	YKR095W	5628 nt		0.26	□□□□□ -2.37
VIK1	Q12045	AI1	Q0050	2505 nt		0.25	□□□□□ -2.37
VIK1	Q12045	BIR1	YJR089W	2865 nt		0.24	□□□□□ -2.37
VIK1	Q12045	YKL100W-A	YKL100W-A	90 nt		0.24	□□□□□ -2.37
VIK1	Q12045	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		0.24	□□□□□ -2.37
VIK1	Q12045	YPR010C-A	YPR010C-A	219 nt		0.24	□□□□□ -2.37
VIK1	Q12045	SNU13	YEL026W	381 nt		0.23	□□□□□ -2.37
VIK1	Q12045	YLL006W-A	YLL006W-A	177 nt		0.23	□□□□□ -2.37
VIK1	Q12045	YDR366C	YDR366C	399 nt		0.22	□□□□□ -2.37
VIK1	Q12045	YOR008C-A	YOR008C-A	225 nt		0.22	□□□□□ -2.37
VIK1	Q12045	TRS65	YGR166W	1683 nt		0.21	□□□□□ -2.38
VIK1	Q12045	YBL100W-B	YBL100W-B	5313 nt		0.21	□□□□□ -2.38
VIK1	Q12045	YCR038W-A	YCR038W-A	126 nt		0.2	□□□□□ -2.38
VIK1	Q12045	YIL002W-A	YIL002W-A	210 nt		0.19	□□□□□ -2.38
VIK1	Q12045	YOL013W-A	YOL013W-A	192 nt		0.19	□□□□□ -2.38
VIK1	Q12045	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	Q12045	YIR030W-A	YIR030W-A	384 nt		0.18	□□□□□ -2.38
VIK1	Q12045	YNL054W-B	YNL054W-B	5250 nt		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	Q12045	YEL073C	YEL073C	324 nt		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	Q12045	YOL014W	YOL014W	375 nt		0.16	□□□□□ -2.38
VIK1	Q12045	tF(GAA)Q	tF(GAA)Q	75 nt		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	Q12045	YBR072C-A	YBR072C-A	162 nt		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	Q12045	YKU70	YMR284W	1809 nt		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	Q12045	THO2	YNL139C	4794 nt		0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	Q12045	snR65	snR65	100 nt		0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	Q12045	QCR9	YGR183C	201 nt		0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	Q12045	APQ12	YIL040W	417 nt		0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	Q12045	YBR182C-A	YBR182C-A	195 nt		0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	Q12045	YLR232W	YLR232W	348 nt		0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	Q12045	SOV1	YMR066W	2697 nt		0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	Q12045	YOR186C-A	YOR186C-A	210 nt		0.08	□□□□□ -2.4
VIK1	Q12045	YMR158W-B	YMR158W-B	321 nt		0.07	□□□□□ -2.4
VIK1	Q12045	PRP39	YML046W	1890 nt		0.06	□□□□□ -2.4
VIK1	Q12045	SDH6	YDR379C-A	240 nt		0.06	□□□□□ -2.4
VIK1	Q12045	TAH1	YCR060W	336 nt		0.05	□□□□□ -2.4
VIK1	Q12045	YER078W-A	YER078W-A	165 nt		0.05	□□□□□ -2.4
VIK1	Q12045	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		0.05	□□□□□ -2.4
VIK1	Q12045	UTP8	YGR128C	2142 nt		0.05	□□□□□ -2.4
VIK1	Q12045	GLG1	YKR058W	1851 nt		0.04	□□□□□ -2.4
VIK1	Q12045	snR49	snR49	165 nt		0.04	□□□□□ -2.4
VIK1	Q12045	YDR544C	YDR544C	429 nt		0.03	□□□□□ -2.4
VIK1	Q12045	YER181C	YER181C	324 nt		0.03	□□□□□ -2.4
VIK1	Q12045	YGL041C	YGL041C	204 nt		0.03	□□□□□ -2.4
VIK1	Q12045	snR55	snR55	98 nt		0.02	□□□□□ -2.41
VIK1	Q12045	YBL039C-A	YBL039C-A	84 nt		0.02	□□□□□ -2.41
VIK1	Q12045	YBR131C-A	YBR131C-A	90 nt		0.02	□□□□□ -2.41
VIK1	Q12045	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		0.01	□□□□□ -2.41
VIK1	Q12045	YPL060C-A	YPL060C-A	3315 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
VIK1	Q12045	YBR099C	YBR099C	384 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
VIK1	Q12045	COG6	YNL041C	2520 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
VIK1	Q12045	YML099W-A	YML099W-A	330 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
VIK1	Q12045	CSE1	YGL238W	2883 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
VIK1	Q12045	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
VIK1	Q12045	YOL155W-A	YOL155W-A	135 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
VIK1	Q12045	YEL014C	YEL014C	306 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
VIK1	Q12045	YOR302W	YOR302W	78 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
VIK1	Q12045	YGL182C	YGL182C	324 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
VIK1	Q12045	YJL182C	YJL182C	318 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
VIK1	Q12045	YOR314W-A	YOR314W-A	111 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
VIK1	Q12045	snR45	snR45	172 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
VIK1	Q12045	Q0142	Q0142	177 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
VIK1	Q12045	EST1	YLR233C	2100 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
VIK1	Q12045	RPM2	YML091C	3609 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
VIK1	Q12045	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
VIK1	Q12045	snR128	snR128	126 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
VIK1	Q12045	YOR381W-A	YOR381W-A	168 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
VIK1	Q12045	snR80	snR80	171 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
VIK1	Q12045	snR8	snR8	190 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
VIK1	Q12045	YDR210W	YDR210W	228 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
VIK1	Q12045	YOR170W	YOR170W	306 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
VIK1	Q12045	TFB5	YDR079C-A	219 nt		-0.25	□□□□□ -2.45

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