Protein–RNA interactions for Protein: Q08969

GRE1, Protein GRE1, yeastyeast

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GRE1Q08969 COG6YNL041C 2520 nt-0.66□□□□□ -2.51
GRE1Q08969 STE18YJR086W 333 nt-0.66□□□□□ -2.52
GRE1Q08969 VPS20YMR077C 666 nt-0.67□□□□□ -2.52
GRE1Q08969 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-0.68□□□□□ -2.52
GRE1Q08969 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-0.69□□□□□ -2.52
GRE1Q08969 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.69□□□□□ -2.52
GRE1Q08969 PRM3YPL192C 402 nt-0.69□□□□□ -2.52
GRE1Q08969 YER053C-AYER053C-A 114 nt-0.71□□□□□ -2.52
GRE1Q08969 snR36snR36 182 nt-0.71□□□□□ -2.52
GRE1Q08969 TAH1YCR060W 336 nt-0.72□□□□□ -2.52
GRE1Q08969 YFL063WYFL063W 456 nt-0.72□□□□□ -2.52
GRE1Q08969 YDR544CYDR544C 429 nt-0.73□□□□□ -2.53
GRE1Q08969 YNL122CYNL122C 348 nt-0.73□□□□□ -2.53
GRE1Q08969 YJL182CYJL182C 318 nt-0.74□□□□□ -2.53
GRE1Q08969 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-0.74□□□□□ -2.53
GRE1Q08969 APQ12YIL040W 417 nt-0.75□□□□□ -2.53
GRE1Q08969 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-0.75□□□□□ -2.53
GRE1Q08969 CSN9YDR179C 489 nt-0.76□□□□□ -2.53
GRE1Q08969 snR49snR49 165 nt-0.76□□□□□ -2.53
GRE1Q08969 YGL052WYGL052W 306 nt-0.77□□□□□ -2.53
GRE1Q08969 RPS27BYHR021C 249 nt-0.77□□□□□ -2.53
GRE1Q08969 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-0.77□□□□□ -2.53
GRE1Q08969 CSE2YNR010W 450 nt-0.77□□□□□ -2.53
GRE1Q08969 snR161snR161 161 nt-0.77□□□□□ -2.53
GRE1Q08969 YGR069WYGR069W 336 nt-0.78□□□□□ -2.53
GRE1Q08969 YOR170WYOR170W 306 nt-0.79□□□□□ -2.54
GRE1Q08969 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-0.79□□□□□ -2.54
GRE1Q08969 YGL182CYGL182C 324 nt-0.8□□□□□ -2.54
GRE1Q08969 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-0.8□□□□□ -2.54
GRE1Q08969 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.81□□□□□ -2.54
GRE1Q08969 TOM22YNL131W 459 nt-0.81□□□□□ -2.54
GRE1Q08969 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-0.82□□□□□ -2.54
GRE1Q08969 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.83□□□□□ -2.54
GRE1Q08969 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.84□□□□□ -2.54
GRE1Q08969 snR78snR78 87 nt-0.84□□□□□ -2.54
GRE1Q08969 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-0.84□□□□□ -2.54
GRE1Q08969 YNR025CYNR025C 360 nt-0.87□□□□□ -2.55
GRE1Q08969 snR41snR41 95 nt-0.87□□□□□ -2.55
GRE1Q08969 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.88□□□□□ -2.55
GRE1Q08969 HMRA1YCR097W 381 nt-0.89□□□□□ -2.55
GRE1Q08969 YDR048CYDR048C 315 nt-0.89□□□□□ -2.55
GRE1Q08969 YML099W-AYML099W-A 330 nt-0.89□□□□□ -2.55
GRE1Q08969 YAF9YNL107W 681 nt-0.89□□□□□ -2.55
GRE1Q08969 YOR015WYOR015W 360 nt-0.89□□□□□ -2.55
GRE1Q08969 snR74snR74 88 nt-0.9□□□□□ -2.55
GRE1Q08969 YER137W-AYER137W-A 306 nt-0.9□□□□□ -2.55
GRE1Q08969 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.9□□□□□ -2.55
GRE1Q08969 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-0.9□□□□□ -2.55
GRE1Q08969 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-0.9□□□□□ -2.55
GRE1Q08969 snR60snR60 104 nt-0.93□□□□□ -2.56
GRE1Q08969 YLR434CYLR434C 384 nt-0.93□□□□□ -2.56
GRE1Q08969 YDL158CYDL158C 309 nt-0.94□□□□□ -2.56
GRE1Q08969 YIL032CYIL032C 357 nt-0.94□□□□□ -2.56
GRE1Q08969 JLP2YMR132C 627 nt-0.94□□□□□ -2.56
GRE1Q08969 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-0.94□□□□□ -2.56
GRE1Q08969 snR50snR50 90 nt-0.94□□□□□ -2.56
GRE1Q08969 YNL266WYNL266W 420 nt-0.95□□□□□ -2.56
GRE1Q08969 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-0.96□□□□□ -2.56
GRE1Q08969 snR69snR69 101 nt-0.97□□□□□ -2.56
GRE1Q08969 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.97□□□□□ -2.56
GRE1Q08969 YGL149WYGL149W 306 nt-0.97□□□□□ -2.56
GRE1Q08969 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-0.97□□□□□ -2.56
GRE1Q08969 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt-0.98□□□□□ -2.57
GRE1Q08969 YDR102CYDR102C 333 nt-0.99□□□□□ -2.57
GRE1Q08969 YNR077CYNR077C 255 nt-0.99□□□□□ -2.57
GRE1Q08969 YKL063CYKL063C 504 nt-1□□□□□ -2.57
GRE1Q08969 snR189snR189 189 nt-1□□□□□ -2.57
GRE1Q08969 SKI7YOR076C 2244 nt-1.01□□□□□ -2.57
GRE1Q08969 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-1.01□□□□□ -2.57
GRE1Q08969 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-1.02□□□□□ -2.57
GRE1Q08969 YOR121CYOR121C 306 nt-1.04□□□□□ -2.58
GRE1Q08969 RDS3YPR094W 324 nt-1.04□□□□□ -2.58
GRE1Q08969 YFL032WYFL032W 321 nt-1.06□□□□□ -2.58
GRE1Q08969 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.06□□□□□ -2.58
GRE1Q08969 YLR202CYLR202C 327 nt-1.06□□□□□ -2.58
GRE1Q08969 YNL324WYNL324W 396 nt-1.06□□□□□ -2.58
GRE1Q08969 YBR285WYBR285W 435 nt-1.06□□□□□ -2.58
GRE1Q08969 YNL028WYNL028W 318 nt-1.07□□□□□ -2.58
GRE1Q08969 snR67snR67 82 nt-1.08□□□□□ -2.58
GRE1Q08969 ATP6Q0085 780 nt-1.08□□□□□ -2.58
GRE1Q08969 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-1.08□□□□□ -2.58
GRE1Q08969 PMP2YEL017C-A 132 nt-1.1□□□□□ -2.59
GRE1Q08969 YER097WYER097W 330 nt-1.1□□□□□ -2.59
GRE1Q08969 BIL1YOR304C-A 231 nt-1.1□□□□□ -2.59
GRE1Q08969 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-1.11□□□□□ -2.59
GRE1Q08969 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-1.11□□□□□ -2.59
GRE1Q08969 YFL019CYFL019C 354 nt-1.13□□□□□ -2.59
GRE1Q08969 YGL041CYGL041C 204 nt-1.13□□□□□ -2.59
GRE1Q08969 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.13□□□□□ -2.59
GRE1Q08969 YNL205CYNL205C 423 nt-1.13□□□□□ -2.59
GRE1Q08969 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-1.14□□□□□ -2.59
GRE1Q08969 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.15□□□□□ -2.59
GRE1Q08969 snR39BsnR39B 96 nt-1.16□□□□□ -2.6
GRE1Q08969 snR77snR77 88 nt-1.17□□□□□ -2.6
GRE1Q08969 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.17□□□□□ -2.6
GRE1Q08969 HTL1YCR020W-B 237 nt-1.18□□□□□ -2.6
GRE1Q08969 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-1.18□□□□□ -2.6
GRE1Q08969 YEL014CYEL014C 306 nt-1.18□□□□□ -2.6
GRE1Q08969 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-1.18□□□□□ -2.6
GRE1Q08969 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-1.18□□□□□ -2.6
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