Protein–RNA interactions for Protein: Q08119

ESC8, Protein ESC8, yeastyeast

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ESC8Q08119 snR75snR75 89 nt1.92□□□□□ -2.1
ESC8Q08119 PKH3YDR466W 2697 nt1.92□□□□□ -2.1
ESC8Q08119 PEP1YBL017C 4740 nt1.91□□□□□ -2.1
ESC8Q08119 FIG2YCR089W 4830 nt1.91□□□□□ -2.1
ESC8Q08119 FRK1YPL141C 2598 nt1.9□□□□□ -2.11
ESC8Q08119 DNF3YMR162C 4971 nt1.9□□□□□ -2.11
ESC8Q08119 SEY1YOR165W 2331 nt1.88□□□□□ -2.11
ESC8Q08119 CTR9YOL145C 3234 nt1.87□□□□□ -2.11
ESC8Q08119 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt1.87□□□□□ -2.11
ESC8Q08119 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.85□□□□□ -2.11
ESC8Q08119 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt1.85□□□□□ -2.11
ESC8Q08119 MYO2YOR326W 4725 nt1.85□□□□□ -2.11
ESC8Q08119 YLR419WYLR419W 4308 nt1.85□□□□□ -2.11
ESC8Q08119 MMS4YBR098W 2076 nt1.84□□□□□ -2.11
ESC8Q08119 TRM3YDL112W 4311 nt1.84□□□□□ -2.11
ESC8Q08119 GCN2YDR283C 4980 nt1.84□□□□□ -2.11
ESC8Q08119 YKL225WYKL225W 348 nt1.84□□□□□ -2.11
ESC8Q08119 YLR041WYLR041W 321 nt1.84□□□□□ -2.11
ESC8Q08119 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.84□□□□□ -2.11
ESC8Q08119 NUP192YJL039C 5052 nt1.84□□□□□ -2.12
ESC8Q08119 SFB2YNL049C 2631 nt1.84□□□□□ -2.12
ESC8Q08119 HIR3YJR140C 4947 nt1.83□□□□□ -2.12
ESC8Q08119 PIK1YNL267W 3201 nt1.83□□□□□ -2.12
ESC8Q08119 SEC10YLR166C 2616 nt1.83□□□□□ -2.12
ESC8Q08119 AZF1YOR113W 2745 nt1.82□□□□□ -2.12
ESC8Q08119 SPO24YPR036W-A 204 nt1.81□□□□□ -2.12
ESC8Q08119 ALY2YJL084C 3141 nt1.81□□□□□ -2.12
ESC8Q08119 UBP3YER151C 2739 nt1.8□□□□□ -2.12
ESC8Q08119 RPL26BYGR034W 384 nt1.8□□□□□ -2.12
ESC8Q08119 IRC20YLR247C 4671 nt1.8□□□□□ -2.12
ESC8Q08119 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.79□□□□□ -2.12
ESC8Q08119 CFT1YDR301W 4074 nt1.78□□□□□ -2.12
ESC8Q08119 WAR1YML076C 2835 nt1.78□□□□□ -2.12
ESC8Q08119 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt1.77□□□□□ -2.13
ESC8Q08119 SMC1YFL008W 3678 nt1.76□□□□□ -2.13
ESC8Q08119 RPM2YML091C 3609 nt1.76□□□□□ -2.13
ESC8Q08119 snR190snR190 190 nt1.75□□□□□ -2.13
ESC8Q08119 YDL073WYDL073W 2955 nt1.75□□□□□ -2.13
ESC8Q08119 MEC1YBR136W 7107 nt1.75□□□□□ -2.13
ESC8Q08119 NNF2YGR089W 2811 nt1.74□□□□□ -2.13
ESC8Q08119 YLR422WYLR422W 5799 nt1.74□□□□□ -2.13
ESC8Q08119 YAR009CYAR009C 3591 nt1.74□□□□□ -2.13
ESC8Q08119 UTP21YLR409C 2820 nt1.73□□□□□ -2.13
ESC8Q08119 BRR2YER172C 6492 nt1.73□□□□□ -2.13
ESC8Q08119 KCS1YDR017C 3153 nt1.73□□□□□ -2.13
ESC8Q08119 PMD1YER132C 5262 nt1.72□□□□□ -2.13
ESC8Q08119 NUT1YGL151W 3399 nt1.72□□□□□ -2.13
ESC8Q08119 SKI3YPR189W 4299 nt1.71□□□□□ -2.13
ESC8Q08119 PAN2YGL094C 3348 nt1.71□□□□□ -2.14
ESC8Q08119 VPS15YBR097W 4365 nt1.71□□□□□ -2.14
ESC8Q08119 BEM3YPL115C 3387 nt1.71□□□□□ -2.14
ESC8Q08119 RAD50YNL250W 3939 nt1.71□□□□□ -2.14
ESC8Q08119 RAD9YDR217C 3930 nt1.71□□□□□ -2.14
ESC8Q08119 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.69□□□□□ -2.14
ESC8Q08119 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.69□□□□□ -2.14
ESC8Q08119 CHS1YNL192W 3396 nt1.69□□□□□ -2.14
ESC8Q08119 snR14snR14 160 nt1.68□□□□□ -2.14
ESC8Q08119 MON2YNL297C 4911 nt1.65□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 GEA2YEL022W 4380 nt1.65□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 CAT8YMR280C 4302 nt1.64□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 BST1YFL025C 3090 nt1.64□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 SXM1YDR395W 2835 nt1.63□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 RPL41AYDL184C 78 nt1.63□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 snR38snR38 95 nt1.63□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 SKI7YOR076C 2244 nt1.63□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 AI1Q0050 2505 nt1.63□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 EST1YLR233C 2100 nt1.62□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 SMC4YLR086W 4257 nt1.62□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 MSH3YCR092C 3057 nt1.61□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.61□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt1.61□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 EMC5YIL027C 426 nt1.61□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt1.6□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 YML054C-AYML054C-A 159 nt1.6□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.6□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 SPC110YDR356W 2835 nt1.6□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 STO1YMR125W 2586 nt1.59□□□□□ -2.15
ESC8Q08119 PET127YOR017W 2403 nt1.59□□□□□ -2.16
ESC8Q08119 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt1.57□□□□□ -2.16
ESC8Q08119 KAP122YGL016W 3246 nt1.57□□□□□ -2.16
ESC8Q08119 SSK2YNR031C 4740 nt1.57□□□□□ -2.16
ESC8Q08119 CLU1YMR012W 3834 nt1.57□□□□□ -2.16
ESC8Q08119 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.56□□□□□ -2.16
ESC8Q08119 MSN5YDR335W 3675 nt1.55□□□□□ -2.16
ESC8Q08119 snR69snR69 101 nt1.55□□□□□ -2.16
ESC8Q08119 PRP16YKR086W 3216 nt1.55□□□□□ -2.16
ESC8Q08119 MYO1YHR023W 5787 nt1.54□□□□□ -2.16
ESC8Q08119 YGR130CYGR130C 2451 nt1.53□□□□□ -2.16
ESC8Q08119 NIP1YMR309C 2439 nt1.53□□□□□ -2.16
ESC8Q08119 IRA1YBR140C 9279 nt1.52□□□□□ -2.17
ESC8Q08119 YCS4YLR272C 3531 nt1.52□□□□□ -2.17
ESC8Q08119 TRM732YMR259C 4263 nt1.52□□□□□ -2.17
ESC8Q08119 EST2YLR318W 2655 nt1.52□□□□□ -2.17
ESC8Q08119 CSE1YGL238W 2883 nt1.5□□□□□ -2.17
ESC8Q08119 HUG1YML058W-A 207 nt1.49□□□□□ -2.17
ESC8Q08119 RDS3YPR094W 324 nt1.49□□□□□ -2.17
ESC8Q08119 ROM2YLR371W 4071 nt1.47□□□□□ -2.17
ESC8Q08119 LAA1YJL207C 6045 nt1.47□□□□□ -2.17
ESC8Q08119 SEC8YPR055W 3198 nt1.47□□□□□ -2.17
ESC8Q08119 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.7 ms