Protein–RNA interactions for Protein: Q06139

YLR346C, Uncharacterized protein YLR346C, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR346CQ06139 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt2.12□□□□□ -2.07
YLR346CQ06139 SGS1YMR190C 4344 nt2.12□□□□□ -2.07
YLR346CQ06139 MSB1YOR188W 3414 nt2.12□□□□□ -2.07
YLR346CQ06139 UBR2YLR024C 5619 nt2.11□□□□□ -2.07
YLR346CQ06139 TDA9YML081W 3756 nt2.11□□□□□ -2.07
YLR346CQ06139 DNF1YER166W 4716 nt2.11□□□□□ -2.07
YLR346CQ06139 EST1YLR233C 2100 nt2.11□□□□□ -2.07
YLR346CQ06139 RPL41AYDL184C 78 nt2.11□□□□□ -2.07
YLR346CQ06139 FAR11YNL127W 2862 nt2.11□□□□□ -2.07
YLR346CQ06139 MSH3YCR092C 3057 nt2.11□□□□□ -2.07
YLR346CQ06139 RAD50YNL250W 3939 nt2.1□□□□□ -2.07
YLR346CQ06139 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt2.1□□□□□ -2.07
YLR346CQ06139 MBB1YJL199C 327 nt2.1□□□□□ -2.07
YLR346CQ06139 ROM2YLR371W 4071 nt2.09□□□□□ -2.07
YLR346CQ06139 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt2.09□□□□□ -2.07
YLR346CQ06139 UTP21YLR409C 2820 nt2.09□□□□□ -2.07
YLR346CQ06139 PET309YLR067C 2898 nt2.08□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 TOR2YKL203C 7425 nt2.08□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 DNA2YHR164C 4569 nt2.08□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 KAP122YGL016W 3246 nt2.08□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 EMC5YIL027C 426 nt2.07□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 TFC3YAL001C 3483 nt2.07□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 MYO4YAL029C 4416 nt2.06□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 BEM3YPL115C 3387 nt2.06□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 STH1YIL126W 4080 nt2.06□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 SLN1YIL147C 3663 nt2.05□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 snR69snR69 101 nt2.05□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt2.05□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 ULP2YIL031W 3105 nt2.05□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 CSF1YLR087C 8877 nt2.05□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 TOP2YNL088W 4287 nt2.04□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 NST1YNL091W 3723 nt2.04□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt2.03□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 SPP41YDR464W 4308 nt2.03□□□□□ -2.08
YLR346CQ06139 IRC20YLR247C 4671 nt2.02□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 YCS4YLR272C 3531 nt2.02□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 snR70snR70 164 nt2.02□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 KCS1YDR017C 3153 nt2.02□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 MSH6YDR097C 3729 nt2.01□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 KIP1YBL063W 3336 nt2.01□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 STO1YMR125W 2586 nt2.01□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 YLR422WYLR422W 5799 nt2□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 RTT101YJL047C 2529 nt2□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 PET111YMR257C 2403 nt2□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 NUP170YBL079W 4509 nt2□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 TRM732YMR259C 4263 nt2□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 KRE33YNL132W 3171 nt1.99□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 SEC3YER008C 4011 nt1.99□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 SMC4YLR086W 4257 nt1.98□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 GEA2YEL022W 4380 nt1.98□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 USO1YDL058W 5373 nt1.98□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 CSE1YGL238W 2883 nt1.97□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 YMR045CYMR045C 5268 nt1.97□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 DGR1YNL130C-A 147 nt1.97□□□□□ -2.09
YLR346CQ06139 RDS3YPR094W 324 nt1.96□□□□□ -2.1
YLR346CQ06139 FKS1YLR342W 5631 nt1.96□□□□□ -2.1
YLR346CQ06139 UTP22YGR090W 3714 nt1.94□□□□□ -2.1
YLR346CQ06139 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt1.94□□□□□ -2.1
YLR346CQ06139 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt1.94□□□□□ -2.1
YLR346CQ06139 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt1.94□□□□□ -2.1
YLR346CQ06139 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt1.94□□□□□ -2.1
YLR346CQ06139 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.91□□□□□ -2.1
YLR346CQ06139 PSD2YGR170W 3417 nt1.91□□□□□ -2.1
YLR346CQ06139 SEC8YPR055W 3198 nt1.9□□□□□ -2.1
YLR346CQ06139 EST2YLR318W 2655 nt1.9□□□□□ -2.1
YLR346CQ06139 MON2YNL297C 4911 nt1.9□□□□□ -2.11
YLR346CQ06139 MYO1YHR023W 5787 nt1.89□□□□□ -2.11
YLR346CQ06139 MSN5YDR335W 3675 nt1.89□□□□□ -2.11
YLR346CQ06139 UBP2YOR124C 3819 nt1.89□□□□□ -2.11
YLR346CQ06139 SKI3YPR189W 4299 nt1.88□□□□□ -2.11
YLR346CQ06139 YSP1YHR155W 3687 nt1.88□□□□□ -2.11
YLR346CQ06139 PRP16YKR086W 3216 nt1.87□□□□□ -2.11
YLR346CQ06139 SPC110YDR356W 2835 nt1.87□□□□□ -2.11
YLR346CQ06139 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.86□□□□□ -2.11
YLR346CQ06139 APL3YBL037W 3078 nt1.86□□□□□ -2.11
YLR346CQ06139 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt1.85□□□□□ -2.11
YLR346CQ06139 ATG9YDL149W 2994 nt1.84□□□□□ -2.11
YLR346CQ06139 BUL2YML111W 2763 nt1.84□□□□□ -2.11
YLR346CQ06139 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.84□□□□□ -2.11
YLR346CQ06139 SXM1YDR395W 2835 nt1.84□□□□□ -2.12
YLR346CQ06139 SIP4YJL089W 2490 nt1.83□□□□□ -2.12
YLR346CQ06139 PMD1YER132C 5262 nt1.83□□□□□ -2.12
YLR346CQ06139 PAU12YGR294W 363 nt1.83□□□□□ -2.12
YLR346CQ06139 HER1YOR227W 3741 nt1.8□□□□□ -2.12
YLR346CQ06139 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt1.8□□□□□ -2.12
YLR346CQ06139 SWI4YER111C 3282 nt1.79□□□□□ -2.12
YLR346CQ06139 CDC39YCR093W 6327 nt1.79□□□□□ -2.12
YLR346CQ06139 NEO1YIL048W 3456 nt1.78□□□□□ -2.13
YLR346CQ06139 HUG1YML058W-A 207 nt1.77□□□□□ -2.13
YLR346CQ06139 CDC25YLR310C 4770 nt1.77□□□□□ -2.13
YLR346CQ06139 REV3YPL167C 4515 nt1.74□□□□□ -2.13
YLR346CQ06139 NUP188YML103C 4968 nt1.73□□□□□ -2.13
YLR346CQ06139 SEC31YDL195W 3822 nt1.73□□□□□ -2.13
YLR346CQ06139 INO80YGL150C 4470 nt1.73□□□□□ -2.13
YLR346CQ06139 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.72□□□□□ -2.13
YLR346CQ06139 FAB1YFR019W 6837 nt1.71□□□□□ -2.13
YLR346CQ06139 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt1.71□□□□□ -2.14
YLR346CQ06139 NUP192YJL039C 5052 nt1.71□□□□□ -2.14
YLR346CQ06139 LAA1YJL207C 6045 nt1.7□□□□□ -2.14
YLR346CQ06139 PEP1YBL017C 4740 nt1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39 ms