Protein–RNA interactions for Protein: Q01766

HAL1, Halotolerance protein HAL1, yeastyeast

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL1Q01766 PRP42YDR235W 1635 nt0.87□□□□□ -2.27
HAL1Q01766 KAP120YPL125W 3099 nt0.87□□□□□ -2.27
HAL1Q01766 RPL26BYGR034W 384 nt0.87□□□□□ -2.27
HAL1Q01766 snR190snR190 190 nt0.87□□□□□ -2.27
HAL1Q01766 PRP5YBR237W 2550 nt0.86□□□□□ -2.27
HAL1Q01766 SIP4YJL089W 2490 nt0.86□□□□□ -2.27
HAL1Q01766 ROM2YLR371W 4071 nt0.85□□□□□ -2.27
HAL1Q01766 YML002WYML002W 2214 nt0.84□□□□□ -2.27
HAL1Q01766 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.84□□□□□ -2.27
HAL1Q01766 YLR041WYLR041W 321 nt0.84□□□□□ -2.27
HAL1Q01766 SPT7YBR081C 3999 nt0.83□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 FYV10YIL097W 1551 nt0.83□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.83□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.83□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.83□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.83□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.83□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 BUD3YCL014W 4911 nt0.82□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 YGL182CYGL182C 324 nt0.81□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 UTP8YGR128C 2142 nt0.81□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.81□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 PRP16YKR086W 3216 nt0.8□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 SEC8YPR055W 3198 nt0.79□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 TAH1YCR060W 336 nt0.79□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.79□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 CLU1YMR012W 3834 nt0.79□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.78□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 snR48snR48 113 nt0.78□□□□□ -2.28
HAL1Q01766 Q0092Q0092 141 nt0.77□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.77□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 YOR102WYOR102W 351 nt0.77□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 RKR1YMR247C 4689 nt0.76□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 ATP8Q0080 147 nt0.76□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.76□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 YOR170WYOR170W 306 nt0.76□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 STF2YGR008C 255 nt0.75□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.75□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 YDL073WYDL073W 2955 nt0.75□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 BEM2YER155C 6504 nt0.74□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 YGR164WYGR164W 336 nt0.74□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 SCC2YDR180W 4482 nt0.74□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 YDR544CYDR544C 429 nt0.73□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.73□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 YLR232WYLR232W 348 nt0.73□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 HUG1YML058W-A 207 nt0.73□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 CHS6YJL099W 2241 nt0.72□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 UBP3YER151C 2739 nt0.72□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 SNU13YEL026W 381 nt0.72□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 YNL170WYNL170W 396 nt0.72□□□□□ -2.29
HAL1Q01766 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.71□□□□□ -2.3
HAL1Q01766 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.71□□□□□ -2.3
HAL1Q01766 DOP1YDR141C 5097 nt0.7□□□□□ -2.3
HAL1Q01766 SDH6YDR379C-A 240 nt0.7□□□□□ -2.3
HAL1Q01766 OST4YDL232W 111 nt0.69□□□□□ -2.3
HAL1Q01766 snR39BsnR39B 96 nt0.69□□□□□ -2.3
HAL1Q01766 MYO1YHR023W 5787 nt0.67□□□□□ -2.3
HAL1Q01766 QCR9YGR183C 201 nt0.66□□□□□ -2.3
HAL1Q01766 YSP1YHR155W 3687 nt0.65□□□□□ -2.31
HAL1Q01766 COG6YNL041C 2520 nt0.65□□□□□ -2.31
HAL1Q01766 YPR117WYPR117W 7470 nt0.65□□□□□ -2.31
HAL1Q01766 BEM3YPL115C 3387 nt0.65□□□□□ -2.31
HAL1Q01766 SEC1YDR164C 2175 nt0.64□□□□□ -2.31
HAL1Q01766 PAU24YBR301W 363 nt0.64□□□□□ -2.31
HAL1Q01766 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.63□□□□□ -2.31
HAL1Q01766 YDR210WYDR210W 228 nt0.62□□□□□ -2.31
HAL1Q01766 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.62□□□□□ -2.31
HAL1Q01766 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.61□□□□□ -2.31
HAL1Q01766 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.61□□□□□ -2.31
HAL1Q01766 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.61□□□□□ -2.31
HAL1Q01766 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.6□□□□□ -2.31
HAL1Q01766 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.59□□□□□ -2.31
HAL1Q01766 NNF2YGR089W 2811 nt0.58□□□□□ -2.32
HAL1Q01766 ULP2YIL031W 3105 nt0.58□□□□□ -2.32
HAL1Q01766 GLG1YKR058W 1851 nt0.57□□□□□ -2.32
HAL1Q01766 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.57□□□□□ -2.32
HAL1Q01766 LTE1YAL024C 4308 nt0.57□□□□□ -2.32
HAL1Q01766 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.56□□□□□ -2.32
HAL1Q01766 BUL2YML111W 2763 nt0.55□□□□□ -2.32
HAL1Q01766 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.55□□□□□ -2.32
HAL1Q01766 RPM2YML091C 3609 nt0.55□□□□□ -2.32
HAL1Q01766 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.54□□□□□ -2.32
HAL1Q01766 UTP20YBL004W 7482 nt0.54□□□□□ -2.32
HAL1Q01766 SOM1YEL059C-A 225 nt0.53□□□□□ -2.32
HAL1Q01766 NIP1YMR309C 2439 nt0.53□□□□□ -2.33
HAL1Q01766 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.52□□□□□ -2.33
HAL1Q01766 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.52□□□□□ -2.33
HAL1Q01766 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.52□□□□□ -2.33
HAL1Q01766 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.52□□□□□ -2.33
HAL1Q01766 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
HAL1Q01766 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
HAL1Q01766 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.52□□□□□ -2.33
HAL1Q01766 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
HAL1Q01766 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
HAL1Q01766 PAU12YGR294W 363 nt0.52□□□□□ -2.33
HAL1Q01766 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.52□□□□□ -2.33
HAL1Q01766 PET111YMR257C 2403 nt0.52□□□□□ -2.33
HAL1Q01766 RPS26AYGL189C 360 nt0.51□□□□□ -2.33
HAL1Q01766 YMR160WYMR160W 2451 nt0.5□□□□□ -2.33
HAL1Q01766 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.5□□□□□ -2.33
HAL1Q01766 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 51.5 ms