Protein–RNA interactions for Protein: P38844

DSE2, Protein DSE2, yeastyeast

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE2P38844 RPL39YJL189W 156 nt0.24□□□□□ -2.37
DSE2P38844 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.24□□□□□ -2.37
DSE2P38844 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.23□□□□□ -2.37
DSE2P38844 COX12YLR038C 252 nt0.23□□□□□ -2.37
DSE2P38844 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.22□□□□□ -2.37
DSE2P38844 IQG1YPL242C 4488 nt0.22□□□□□ -2.37
DSE2P38844 NNF2YGR089W 2811 nt0.21□□□□□ -2.38
DSE2P38844 RPS26AYGL189C 360 nt0.21□□□□□ -2.38
DSE2P38844 BLI1YKL061W 342 nt0.21□□□□□ -2.38
DSE2P38844 YLR041WYLR041W 321 nt0.21□□□□□ -2.38
DSE2P38844 YMR160WYMR160W 2451 nt0.21□□□□□ -2.38
DSE2P38844 BEM3YPL115C 3387 nt0.2□□□□□ -2.38
DSE2P38844 YNL146WYNL146W 303 nt0.2□□□□□ -2.38
DSE2P38844 SNU13YEL026W 381 nt0.18□□□□□ -2.38
DSE2P38844 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.18□□□□□ -2.38
DSE2P38844 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.18□□□□□ -2.38
DSE2P38844 NIP1YMR309C 2439 nt0.17□□□□□ -2.38
DSE2P38844 RCO1YMR075W 2055 nt0.17□□□□□ -2.38
DSE2P38844 YDR366CYDR366C 399 nt0.17□□□□□ -2.38
DSE2P38844 YGL041CYGL041C 204 nt0.17□□□□□ -2.38
DSE2P38844 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.17□□□□□ -2.38
DSE2P38844 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.17□□□□□ -2.38
DSE2P38844 BUL2YML111W 2763 nt0.16□□□□□ -2.38
DSE2P38844 snR65snR65 100 nt0.16□□□□□ -2.38
DSE2P38844 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.16□□□□□ -2.38
DSE2P38844 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.15□□□□□ -2.39
DSE2P38844 APQ12YIL040W 417 nt0.15□□□□□ -2.39
DSE2P38844 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.15□□□□□ -2.39
DSE2P38844 FMP27YLR454W 7887 nt0.14□□□□□ -2.39
DSE2P38844 YEL073CYEL073C 324 nt0.14□□□□□ -2.39
DSE2P38844 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.14□□□□□ -2.39
DSE2P38844 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt0.14□□□□□ -2.39
DSE2P38844 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.14□□□□□ -2.39
DSE2P38844 YDR544CYDR544C 429 nt0.13□□□□□ -2.39
DSE2P38844 Q0142Q0142 177 nt0.13□□□□□ -2.39
DSE2P38844 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.13□□□□□ -2.39
DSE2P38844 TRS65YGR166W 1683 nt0.13□□□□□ -2.39
DSE2P38844 YKU70YMR284W 1809 nt0.13□□□□□ -2.39
DSE2P38844 BIR1YJR089W 2865 nt0.12□□□□□ -2.39
DSE2P38844 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.12□□□□□ -2.39
DSE2P38844 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.12□□□□□ -2.39
DSE2P38844 snR49snR49 165 nt0.12□□□□□ -2.39
DSE2P38844 UTP20YBL004W 7482 nt0.12□□□□□ -2.39
DSE2P38844 ULP2YIL031W 3105 nt0.11□□□□□ -2.39
DSE2P38844 ESP1YGR098C 4893 nt0.11□□□□□ -2.39
DSE2P38844 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.11□□□□□ -2.39
DSE2P38844 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.1□□□□□ -2.39
DSE2P38844 snR55snR55 98 nt0.1□□□□□ -2.39
DSE2P38844 TAH1YCR060W 336 nt0.1□□□□□ -2.39
DSE2P38844 SDH6YDR379C-A 240 nt0.1□□□□□ -2.39
DSE2P38844 YEL014CYEL014C 306 nt0.1□□□□□ -2.39
DSE2P38844 YLR232WYLR232W 348 nt0.1□□□□□ -2.39
DSE2P38844 UTP8YGR128C 2142 nt0.09□□□□□ -2.4
DSE2P38844 YOR302WYOR302W 78 nt0.09□□□□□ -2.4
DSE2P38844 PRP39YML046W 1890 nt0.09□□□□□ -2.4
DSE2P38844 MLP1YKR095W 5628 nt0.08□□□□□ -2.4
DSE2P38844 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt0.08□□□□□ -2.4
DSE2P38844 snR80snR80 171 nt0.07□□□□□ -2.4
DSE2P38844 YER181CYER181C 324 nt0.07□□□□□ -2.4
DSE2P38844 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.07□□□□□ -2.4
DSE2P38844 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.07□□□□□ -2.4
DSE2P38844 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.06□□□□□ -2.4
DSE2P38844 CSE1YGL238W 2883 nt0.06□□□□□ -2.4
DSE2P38844 YJL182CYJL182C 318 nt0.05□□□□□ -2.4
DSE2P38844 SOV1YMR066W 2697 nt0.05□□□□□ -2.4
DSE2P38844 COG6YNL041C 2520 nt0.03□□□□□ -2.4
DSE2P38844 YGL182CYGL182C 324 nt0.03□□□□□ -2.4
DSE2P38844 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.03□□□□□ -2.4
DSE2P38844 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.03□□□□□ -2.4
DSE2P38844 GLG1YKR058W 1851 nt0.03□□□□□ -2.41
DSE2P38844 AI1Q0050 2505 nt0.02□□□□□ -2.41
DSE2P38844 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.02□□□□□ -2.41
DSE2P38844 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.02□□□□□ -2.41
DSE2P38844 THO2YNL139C 4794 nt0.02□□□□□ -2.41
DSE2P38844 YBR099CYBR099C 384 nt0.01□□□□□ -2.41
DSE2P38844 EST1YLR233C 2100 nt-0.01□□□□□ -2.41
DSE2P38844 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-0.02□□□□□ -2.41
DSE2P38844 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-0.02□□□□□ -2.41
DSE2P38844 MLP2YIL149C 5040 nt-0.03□□□□□ -2.41
DSE2P38844 HUG1YML058W-A 207 nt-0.03□□□□□ -2.41
DSE2P38844 YDR210WYDR210W 228 nt-0.04□□□□□ -2.42
DSE2P38844 STF2YGR008C 255 nt-0.06□□□□□ -2.42
DSE2P38844 snR128snR128 126 nt-0.06□□□□□ -2.42
DSE2P38844 snR52snR52 92 nt-0.06□□□□□ -2.42
DSE2P38844 snR8snR8 190 nt-0.08□□□□□ -2.42
DSE2P38844 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt-0.08□□□□□ -2.42
DSE2P38844 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt-0.08□□□□□ -2.42
DSE2P38844 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt-0.08□□□□□ -2.42
DSE2P38844 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt-0.08□□□□□ -2.42
DSE2P38844 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt-0.08□□□□□ -2.42
DSE2P38844 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt-0.08□□□□□ -2.42
DSE2P38844 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt-0.08□□□□□ -2.42
DSE2P38844 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt-0.08□□□□□ -2.42
DSE2P38844 snR39BsnR39B 96 nt-0.08□□□□□ -2.42
DSE2P38844 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.09□□□□□ -2.42
DSE2P38844 snR46snR46 197 nt-0.09□□□□□ -2.42
DSE2P38844 YOR170WYOR170W 306 nt-0.1□□□□□ -2.43
DSE2P38844 YGR164WYGR164W 336 nt-0.11□□□□□ -2.43
DSE2P38844 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.12□□□□□ -2.43
DSE2P38844 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.13□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.2 ms