Protein–RNA interactions for Protein: P38799

YHR078W, Uncharacterized protein YHR078W, yeastyeast

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR078WP38799 SEC21YNL287W 2808 nt1.53□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 FYV10YIL097W 1551 nt1.52□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 YDR544CYDR544C 429 nt1.52□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 snR39BsnR39B 96 nt1.52□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 GEA2YEL022W 4380 nt1.52□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 SEC3YER008C 4011 nt1.51□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 TFB5YDR079C-A 219 nt1.51□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.51□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 NUP188YML103C 4968 nt1.51□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 NUP145YGL092W 3954 nt1.51□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 MSH3YCR092C 3057 nt1.51□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 SSK2YNR031C 4740 nt1.5□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 CCH1YGR217W 6120 nt1.5□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.5□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 IRA1YBR140C 9279 nt1.5□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 SPC110YDR356W 2835 nt1.48□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 YLR232WYLR232W 348 nt1.48□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 AZF1YOR113W 2745 nt1.48□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 CDC25YLR310C 4770 nt1.48□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.47□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 YMR326CYMR326C 309 nt1.47□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 PET127YOR017W 2403 nt1.47□□□□□ -2.17
YHR078WP38799 EST2YLR318W 2655 nt1.46□□□□□ -2.18
YHR078WP38799 ROM2YLR371W 4071 nt1.46□□□□□ -2.18
YHR078WP38799 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.46□□□□□ -2.18
YHR078WP38799 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.45□□□□□ -2.18
YHR078WP38799 YGR130CYGR130C 2451 nt1.45□□□□□ -2.18
YHR078WP38799 snR61snR61 90 nt1.44□□□□□ -2.18
YHR078WP38799 PIK1YNL267W 3201 nt1.44□□□□□ -2.18
YHR078WP38799 STF2YGR008C 255 nt1.43□□□□□ -2.18
YHR078WP38799 CDC39YCR093W 6327 nt1.43□□□□□ -2.18
YHR078WP38799 FYV8YGR196C 2454 nt1.41□□□□□ -2.18
YHR078WP38799 RAD9YDR217C 3930 nt1.41□□□□□ -2.18
YHR078WP38799 SXM1YDR395W 2835 nt1.4□□□□□ -2.18
YHR078WP38799 SEC8YPR055W 3198 nt1.39□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 HUG1YML058W-A 207 nt1.39□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 MSN5YDR335W 3675 nt1.39□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 COG6YNL041C 2520 nt1.38□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 YHR217CYHR217C 462 nt1.38□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 KAP120YPL125W 3099 nt1.38□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 HKR1YDR420W 5409 nt1.37□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 YDR210WYDR210W 228 nt1.37□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 CLU1YMR012W 3834 nt1.37□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 RPM2YML091C 3609 nt1.36□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.36□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.36□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.36□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.36□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.36□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.36□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.36□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 PRP16YKR086W 3216 nt1.35□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.35□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.34□□□□□ -2.19
YHR078WP38799 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.33□□□□□ -2.2
YHR078WP38799 LAA1YJL207C 6045 nt1.33□□□□□ -2.2
YHR078WP38799 IML1YJR138W 4755 nt1.33□□□□□ -2.2
YHR078WP38799 RCO1YMR075W 2055 nt1.32□□□□□ -2.2
YHR078WP38799 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.32□□□□□ -2.2
YHR078WP38799 SBH1YER087C-B 249 nt1.31□□□□□ -2.2
YHR078WP38799 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.31□□□□□ -2.2
YHR078WP38799 SEC1YDR164C 2175 nt1.31□□□□□ -2.2
YHR078WP38799 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt1.3□□□□□ -2.2
YHR078WP38799 YDL073WYDL073W 2955 nt1.29□□□□□ -2.2
YHR078WP38799 BEM3YPL115C 3387 nt1.28□□□□□ -2.2
YHR078WP38799 BIR1YJR089W 2865 nt1.28□□□□□ -2.2
YHR078WP38799 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.27□□□□□ -2.21
YHR078WP38799 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.27□□□□□ -2.21
YHR078WP38799 YSP1YHR155W 3687 nt1.26□□□□□ -2.21
YHR078WP38799 YNL266WYNL266W 420 nt1.23□□□□□ -2.21
YHR078WP38799 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.22□□□□□ -2.21
YHR078WP38799 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt1.22□□□□□ -2.21
YHR078WP38799 UBP3YER151C 2739 nt1.2□□□□□ -2.22
YHR078WP38799 SIP4YJL089W 2490 nt1.2□□□□□ -2.22
YHR078WP38799 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1.19□□□□□ -2.22
YHR078WP38799 ULP2YIL031W 3105 nt1.18□□□□□ -2.22
YHR078WP38799 SPT7YBR081C 3999 nt1.18□□□□□ -2.22
YHR078WP38799 GLG1YKR058W 1851 nt1.18□□□□□ -2.22
YHR078WP38799 NNF2YGR089W 2811 nt1.16□□□□□ -2.22
YHR078WP38799 snR81snR81 201 nt1.14□□□□□ -2.23
YHR078WP38799 NST1YNL091W 3723 nt1.12□□□□□ -2.23
YHR078WP38799 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt1.11□□□□□ -2.23
YHR078WP38799 YJR029WYJR029W 5268 nt1.09□□□□□ -2.23
YHR078WP38799 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.09□□□□□ -2.23
YHR078WP38799 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt1.08□□□□□ -2.24
YHR078WP38799 SEC10YLR166C 2616 nt1.08□□□□□ -2.24
YHR078WP38799 BUD3YCL014W 4911 nt1.07□□□□□ -2.24
YHR078WP38799 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.07□□□□□ -2.24
YHR078WP38799 RKR1YMR247C 4689 nt1.06□□□□□ -2.24
YHR078WP38799 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.06□□□□□ -2.24
YHR078WP38799 VAM6YDL077C 3150 nt1.04□□□□□ -2.24
YHR078WP38799 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.03□□□□□ -2.24
YHR078WP38799 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt1.03□□□□□ -2.24
YHR078WP38799 SCC2YDR180W 4482 nt1.01□□□□□ -2.25
YHR078WP38799 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1□□□□□ -2.25
YHR078WP38799 YPR117WYPR117W 7470 nt1□□□□□ -2.25
YHR078WP38799 PAU12YGR294W 363 nt0.99□□□□□ -2.25
YHR078WP38799 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.99□□□□□ -2.25
YHR078WP38799 PAU24YBR301W 363 nt0.99□□□□□ -2.25
YHR078WP38799 CSE1YGL238W 2883 nt0.99□□□□□ -2.25
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