Protein–RNA interactions for Protein: P38073

EDS1, Transcriptional regulatory protein EDS1, yeastyeast

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EDS1P38073 MBB1YJL199C 327 nt2.48□□□□□ -2.01
EDS1P38073 ULP2YIL031W 3105 nt2.48□□□□□ -2.01
EDS1P38073 YSP1YHR155W 3687 nt2.47□□□□□ -2.01
EDS1P38073 SAC3YDR159W 3906 nt2.47□□□□□ -2.01
EDS1P38073 APL3YBL037W 3078 nt2.47□□□□□ -2.01
EDS1P38073 snR14snR14 160 nt2.47□□□□□ -2.01
EDS1P38073 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt2.46□□□□□ -2.02
EDS1P38073 SMC4YLR086W 4257 nt2.46□□□□□ -2.02
EDS1P38073 SXM1YDR395W 2835 nt2.46□□□□□ -2.02
EDS1P38073 UTP22YGR090W 3714 nt2.45□□□□□ -2.02
EDS1P38073 KAP122YGL016W 3246 nt2.45□□□□□ -2.02
EDS1P38073 EST1YLR233C 2100 nt2.45□□□□□ -2.02
EDS1P38073 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt2.44□□□□□ -2.02
EDS1P38073 MSN5YDR335W 3675 nt2.44□□□□□ -2.02
EDS1P38073 DNA2YHR164C 4569 nt2.43□□□□□ -2.02
EDS1P38073 GEA2YEL022W 4380 nt2.43□□□□□ -2.02
EDS1P38073 ARP8YOR141C 2646 nt2.43□□□□□ -2.02
EDS1P38073 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt2.42□□□□□ -2.02
EDS1P38073 snR69snR69 101 nt2.41□□□□□ -2.02
EDS1P38073 UBP2YOR124C 3819 nt2.41□□□□□ -2.02
EDS1P38073 AXL1YPR122W 3627 nt2.41□□□□□ -2.02
EDS1P38073 SKI3YPR189W 4299 nt2.4□□□□□ -2.03
EDS1P38073 RDS3YPR094W 324 nt2.4□□□□□ -2.03
EDS1P38073 SEC31YDL195W 3822 nt2.4□□□□□ -2.03
EDS1P38073 PET127YOR017W 2403 nt2.39□□□□□ -2.03
EDS1P38073 YML054C-AYML054C-A 159 nt2.39□□□□□ -2.03
EDS1P38073 SEC3YER008C 4011 nt2.39□□□□□ -2.03
EDS1P38073 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt2.38□□□□□ -2.03
EDS1P38073 PDR11YIL013C 4236 nt2.37□□□□□ -2.03
EDS1P38073 UBR2YLR024C 5619 nt2.36□□□□□ -2.03
EDS1P38073 KCS1YDR017C 3153 nt2.35□□□□□ -2.03
EDS1P38073 TFC3YAL001C 3483 nt2.35□□□□□ -2.03
EDS1P38073 CSE1YGL238W 2883 nt2.34□□□□□ -2.04
EDS1P38073 PKH3YDR466W 2697 nt2.34□□□□□ -2.04
EDS1P38073 AI1Q0050 2505 nt2.33□□□□□ -2.04
EDS1P38073 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt2.33□□□□□ -2.04
EDS1P38073 CSF1YLR087C 8877 nt2.32□□□□□ -2.04
EDS1P38073 YPL216WYPL216W 3309 nt2.32□□□□□ -2.04
EDS1P38073 HUG1YML058W-A 207 nt2.31□□□□□ -2.04
EDS1P38073 TRA1YHR099W 11235 nt2.3□□□□□ -2.04
EDS1P38073 snR38snR38 95 nt2.3□□□□□ -2.04
EDS1P38073 ATG9YDL149W 2994 nt2.3□□□□□ -2.04
EDS1P38073 CAT8YMR280C 4302 nt2.29□□□□□ -2.04
EDS1P38073 IRA2YOL081W 9240 nt2.29□□□□□ -2.04
EDS1P38073 YOR055WYOR055W 435 nt2.29□□□□□ -2.04
EDS1P38073 NIP1YMR309C 2439 nt2.29□□□□□ -2.04
EDS1P38073 NUP145YGL092W 3954 nt2.28□□□□□ -2.04
EDS1P38073 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt2.28□□□□□ -2.04
EDS1P38073 SWI4YER111C 3282 nt2.28□□□□□ -2.04
EDS1P38073 IRC20YLR247C 4671 nt2.27□□□□□ -2.05
EDS1P38073 NST1YNL091W 3723 nt2.27□□□□□ -2.05
EDS1P38073 MSH3YCR092C 3057 nt2.23□□□□□ -2.05
EDS1P38073 BCK1YJL095W 4437 nt2.22□□□□□ -2.05
EDS1P38073 YOL098CYOL098C 3114 nt2.21□□□□□ -2.06
EDS1P38073 SIP4YJL089W 2490 nt2.2□□□□□ -2.06
EDS1P38073 snR70snR70 164 nt2.2□□□□□ -2.06
EDS1P38073 SCD5YOR329C 2619 nt2.2□□□□□ -2.06
EDS1P38073 BNI1YNL271C 5862 nt2.19□□□□□ -2.06
EDS1P38073 USO1YDL058W 5373 nt2.18□□□□□ -2.06
EDS1P38073 CLU1YMR012W 3834 nt2.17□□□□□ -2.06
EDS1P38073 SGS1YMR190C 4344 nt2.15□□□□□ -2.06
EDS1P38073 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.15□□□□□ -2.07
EDS1P38073 PDR1YGL013C 3207 nt2.15□□□□□ -2.07
EDS1P38073 YMR045CYMR045C 5268 nt2.15□□□□□ -2.07
EDS1P38073 YLR419WYLR419W 4308 nt2.15□□□□□ -2.07
EDS1P38073 BUL2YML111W 2763 nt2.15□□□□□ -2.07
EDS1P38073 PAU12YGR294W 363 nt2.14□□□□□ -2.07
EDS1P38073 FKS3YMR306W 5358 nt2.14□□□□□ -2.07
EDS1P38073 FYV8YGR196C 2454 nt2.14□□□□□ -2.07
EDS1P38073 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.13□□□□□ -2.07
EDS1P38073 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.13□□□□□ -2.07
EDS1P38073 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.13□□□□□ -2.07
EDS1P38073 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.13□□□□□ -2.07
EDS1P38073 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.13□□□□□ -2.07
EDS1P38073 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.13□□□□□ -2.07
EDS1P38073 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt2.12□□□□□ -2.07
EDS1P38073 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt2.12□□□□□ -2.07
EDS1P38073 VPS13YLL040C 9435 nt2.12□□□□□ -2.07
EDS1P38073 BPH1YCR032W 6504 nt2.11□□□□□ -2.07
EDS1P38073 SEC16YPL085W 6588 nt2.1□□□□□ -2.07
EDS1P38073 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt2.09□□□□□ -2.07
EDS1P38073 TMA7YLR262C-A 195 nt2.09□□□□□ -2.07
EDS1P38073 MSB1YOR188W 3414 nt2.09□□□□□ -2.08
EDS1P38073 REV3YPL167C 4515 nt2.05□□□□□ -2.08
EDS1P38073 BST1YFL025C 3090 nt2.05□□□□□ -2.08
EDS1P38073 PET111YMR257C 2403 nt2.05□□□□□ -2.08
EDS1P38073 EST2YLR318W 2655 nt2.02□□□□□ -2.09
EDS1P38073 DNF1YER166W 4716 nt2.02□□□□□ -2.09
EDS1P38073 MLP2YIL149C 5040 nt2.01□□□□□ -2.09
EDS1P38073 NUP188YML103C 4968 nt2.01□□□□□ -2.09
EDS1P38073 MON2YNL297C 4911 nt1.99□□□□□ -2.09
EDS1P38073 NEO1YIL048W 3456 nt1.97□□□□□ -2.09
EDS1P38073 SPP41YDR464W 4308 nt1.97□□□□□ -2.09
EDS1P38073 NUP170YBL079W 4509 nt1.96□□□□□ -2.1
EDS1P38073 TOR2YKL203C 7425 nt1.96□□□□□ -2.1
EDS1P38073 PMD1YER132C 5262 nt1.95□□□□□ -2.1
EDS1P38073 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.94□□□□□ -2.1
EDS1P38073 TRM732YMR259C 4263 nt1.91□□□□□ -2.1
EDS1P38073 DGR1YNL130C-A 147 nt1.85□□□□□ -2.11
EDS1P38073 LAA1YJL207C 6045 nt1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.7 ms