Protein–RNA interactions for Protein: P32048

MSK1, Lysine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSK1P32048 SBH1YER087C-B 249 nt0.43□□□□□ -2.34
MSK1P32048 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.43□□□□□ -2.34
MSK1P32048 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.43□□□□□ -2.34
MSK1P32048 YPR092WYPR092W 306 nt0.43□□□□□ -2.34
MSK1P32048 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.42□□□□□ -2.34
MSK1P32048 RAD61YDR014W 1944 nt0.42□□□□□ -2.34
MSK1P32048 YGR069WYGR069W 336 nt0.41□□□□□ -2.34
MSK1P32048 BLI1YKL061W 342 nt0.41□□□□□ -2.34
MSK1P32048 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.41□□□□□ -2.34
MSK1P32048 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.4□□□□□ -2.35
MSK1P32048 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.4□□□□□ -2.35
MSK1P32048 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.4□□□□□ -2.35
MSK1P32048 MLP1YKR095W 5628 nt0.4□□□□□ -2.35
MSK1P32048 YLR041WYLR041W 321 nt0.38□□□□□ -2.35
MSK1P32048 NNF2YGR089W 2811 nt0.37□□□□□ -2.35
MSK1P32048 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.37□□□□□ -2.35
MSK1P32048 AI1Q0050 2505 nt0.35□□□□□ -2.35
MSK1P32048 YGL052WYGL052W 306 nt0.35□□□□□ -2.35
MSK1P32048 ABF2YMR072W 552 nt0.35□□□□□ -2.35
MSK1P32048 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.35□□□□□ -2.35
MSK1P32048 snR74snR74 88 nt0.34□□□□□ -2.36
MSK1P32048 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.33□□□□□ -2.36
MSK1P32048 RPS26AYGL189C 360 nt0.33□□□□□ -2.36
MSK1P32048 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.33□□□□□ -2.36
MSK1P32048 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.33□□□□□ -2.36
MSK1P32048 COX12YLR038C 252 nt0.33□□□□□ -2.36
MSK1P32048 YOL014WYOL014W 375 nt0.33□□□□□ -2.36
MSK1P32048 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.32□□□□□ -2.36
MSK1P32048 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt0.31□□□□□ -2.36
MSK1P32048 YDR366CYDR366C 399 nt0.3□□□□□ -2.36
MSK1P32048 YNL146WYNL146W 303 nt0.3□□□□□ -2.36
MSK1P32048 NIP1YMR309C 2439 nt0.3□□□□□ -2.36
MSK1P32048 ORC3YLL004W 1851 nt0.3□□□□□ -2.36
MSK1P32048 IQG1YPL242C 4488 nt0.29□□□□□ -2.36
MSK1P32048 SNU13YEL026W 381 nt0.29□□□□□ -2.36
MSK1P32048 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.29□□□□□ -2.36
MSK1P32048 QCR9YGR183C 201 nt0.29□□□□□ -2.36
MSK1P32048 ULP2YIL031W 3105 nt0.29□□□□□ -2.36
MSK1P32048 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.27□□□□□ -2.37
MSK1P32048 TRS65YGR166W 1683 nt0.27□□□□□ -2.37
MSK1P32048 MLP2YIL149C 5040 nt0.25□□□□□ -2.37
MSK1P32048 BUL2YML111W 2763 nt0.25□□□□□ -2.37
MSK1P32048 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.25□□□□□ -2.37
MSK1P32048 RCO1YMR075W 2055 nt0.25□□□□□ -2.37
MSK1P32048 snR65snR65 100 nt0.23□□□□□ -2.37
MSK1P32048 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.23□□□□□ -2.37
MSK1P32048 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.23□□□□□ -2.37
MSK1P32048 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.22□□□□□ -2.37
MSK1P32048 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.22□□□□□ -2.37
MSK1P32048 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.19□□□□□ -2.38
MSK1P32048 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.18□□□□□ -2.38
MSK1P32048 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.18□□□□□ -2.38
MSK1P32048 ESP1YGR098C 4893 nt0.18□□□□□ -2.38
MSK1P32048 YKU70YMR284W 1809 nt0.17□□□□□ -2.38
MSK1P32048 UTP8YGR128C 2142 nt0.17□□□□□ -2.38
MSK1P32048 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.17□□□□□ -2.38
MSK1P32048 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.17□□□□□ -2.38
MSK1P32048 YLR232WYLR232W 348 nt0.17□□□□□ -2.38
MSK1P32048 YEL073CYEL073C 324 nt0.15□□□□□ -2.39
MSK1P32048 APQ12YIL040W 417 nt0.14□□□□□ -2.39
MSK1P32048 snR49snR49 165 nt0.13□□□□□ -2.39
MSK1P32048 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.12□□□□□ -2.39
MSK1P32048 snR55snR55 98 nt0.12□□□□□ -2.39
MSK1P32048 GLG1YKR058W 1851 nt0.12□□□□□ -2.39
MSK1P32048 PRP39YML046W 1890 nt0.12□□□□□ -2.39
MSK1P32048 YER181CYER181C 324 nt0.11□□□□□ -2.39
MSK1P32048 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt0.11□□□□□ -2.39
MSK1P32048 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.1□□□□□ -2.39
MSK1P32048 TAH1YCR060W 336 nt0.09□□□□□ -2.4
MSK1P32048 SDH6YDR379C-A 240 nt0.08□□□□□ -2.4
MSK1P32048 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.08□□□□□ -2.4
MSK1P32048 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt0.07□□□□□ -2.4
MSK1P32048 YGL041CYGL041C 204 nt0.06□□□□□ -2.4
MSK1P32048 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.05□□□□□ -2.4
MSK1P32048 CSE1YGL238W 2883 nt0.05□□□□□ -2.4
MSK1P32048 YDR544CYDR544C 429 nt0.03□□□□□ -2.4
MSK1P32048 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.03□□□□□ -2.4
MSK1P32048 SOV1YMR066W 2697 nt0.03□□□□□ -2.4
MSK1P32048 Q0142Q0142 177 nt0.02□□□□□ -2.41
MSK1P32048 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.02□□□□□ -2.41
MSK1P32048 COG6YNL041C 2520 nt0.01□□□□□ -2.41
MSK1P32048 YBR099CYBR099C 384 nt0.01□□□□□ -2.41
MSK1P32048 snR45snR45 172 nt0□□□□□ -2.41
MSK1P32048 RPM2YML091C 3609 nt-0.02□□□□□ -2.41
MSK1P32048 YGL182CYGL182C 324 nt-0.03□□□□□ -2.41
MSK1P32048 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.04□□□□□ -2.42
MSK1P32048 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.05□□□□□ -2.42
MSK1P32048 YJL182CYJL182C 318 nt-0.06□□□□□ -2.42
MSK1P32048 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-0.06□□□□□ -2.42
MSK1P32048 YEL014CYEL014C 306 nt-0.07□□□□□ -2.42
MSK1P32048 YOR302WYOR302W 78 nt-0.07□□□□□ -2.42
MSK1P32048 YDR210WYDR210W 228 nt-0.08□□□□□ -2.42
MSK1P32048 EST1YLR233C 2100 nt-0.08□□□□□ -2.42
MSK1P32048 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.09□□□□□ -2.42
MSK1P32048 snR128snR128 126 nt-0.11□□□□□ -2.43
MSK1P32048 snR46snR46 197 nt-0.12□□□□□ -2.43
MSK1P32048 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-0.13□□□□□ -2.43
MSK1P32048 snR8snR8 190 nt-0.15□□□□□ -2.43
MSK1P32048 YOR170WYOR170W 306 nt-0.16□□□□□ -2.44
MSK1P32048 YGR164WYGR164W 336 nt-0.17□□□□□ -2.44
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