Protein–RNA interactions for Protein: P27692

SPT5, Transcription elongation factor SPT5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT5P27692 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt2.21□□□□□ -2.06
SPT5P27692 YCS4YLR272C 3531 nt2.21□□□□□ -2.06
SPT5P27692 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt2.2□□□□□ -2.06
SPT5P27692 YLR422WYLR422W 5799 nt2.19□□□□□ -2.06
SPT5P27692 YNL266WYNL266W 420 nt2.19□□□□□ -2.06
SPT5P27692 ASE1YOR058C 2658 nt2.19□□□□□ -2.06
SPT5P27692 SEC1YDR164C 2175 nt2.19□□□□□ -2.06
SPT5P27692 IRC20YLR247C 4671 nt2.17□□□□□ -2.06
SPT5P27692 RPL26BYGR034W 384 nt2.17□□□□□ -2.06
SPT5P27692 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt2.17□□□□□ -2.06
SPT5P27692 WAR1YML076C 2835 nt2.17□□□□□ -2.06
SPT5P27692 GEA2YEL022W 4380 nt2.15□□□□□ -2.07
SPT5P27692 NEO1YIL048W 3456 nt2.14□□□□□ -2.07
SPT5P27692 TRM732YMR259C 4263 nt2.12□□□□□ -2.07
SPT5P27692 PMD1YER132C 5262 nt2.11□□□□□ -2.07
SPT5P27692 snR62snR62 100 nt2.11□□□□□ -2.07
SPT5P27692 RAD9YDR217C 3930 nt2.1□□□□□ -2.07
SPT5P27692 SEC31YDL195W 3822 nt2.1□□□□□ -2.07
SPT5P27692 APL3YBL037W 3078 nt2.09□□□□□ -2.08
SPT5P27692 TMA7YLR262C-A 195 nt2.08□□□□□ -2.08
SPT5P27692 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt2.07□□□□□ -2.08
SPT5P27692 SEC3YER008C 4011 nt2.07□□□□□ -2.08
SPT5P27692 SWI4YER111C 3282 nt2.06□□□□□ -2.08
SPT5P27692 CHS1YNL192W 3396 nt2.06□□□□□ -2.08
SPT5P27692 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2.05□□□□□ -2.08
SPT5P27692 YDL073WYDL073W 2955 nt2.05□□□□□ -2.08
SPT5P27692 ROM2YLR371W 4071 nt2.04□□□□□ -2.08
SPT5P27692 MEC1YBR136W 7107 nt2.04□□□□□ -2.08
SPT5P27692 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt2.04□□□□□ -2.08
SPT5P27692 PEP1YBL017C 4740 nt2.03□□□□□ -2.08
SPT5P27692 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt2.03□□□□□ -2.08
SPT5P27692 RPM2YML091C 3609 nt2.02□□□□□ -2.09
SPT5P27692 NUP188YML103C 4968 nt2.01□□□□□ -2.09
SPT5P27692 VPS15YBR097W 4365 nt2□□□□□ -2.09
SPT5P27692 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.99□□□□□ -2.09
SPT5P27692 SEC8YPR055W 3198 nt1.98□□□□□ -2.09
SPT5P27692 NUP145YGL092W 3954 nt1.97□□□□□ -2.09
SPT5P27692 PKH3YDR466W 2697 nt1.96□□□□□ -2.1
SPT5P27692 BST1YFL025C 3090 nt1.96□□□□□ -2.1
SPT5P27692 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.96□□□□□ -2.1
SPT5P27692 AZF1YOR113W 2745 nt1.95□□□□□ -2.1
SPT5P27692 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.95□□□□□ -2.1
SPT5P27692 CFT1YDR301W 4074 nt1.95□□□□□ -2.1
SPT5P27692 PRP16YKR086W 3216 nt1.94□□□□□ -2.1
SPT5P27692 RPS26AYGL189C 360 nt1.94□□□□□ -2.1
SPT5P27692 CDC39YCR093W 6327 nt1.94□□□□□ -2.1
SPT5P27692 CDC25YLR310C 4770 nt1.93□□□□□ -2.1
SPT5P27692 NNF2YGR089W 2811 nt1.93□□□□□ -2.1
SPT5P27692 BEM3YPL115C 3387 nt1.93□□□□□ -2.1
SPT5P27692 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.91□□□□□ -2.1
SPT5P27692 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.91□□□□□ -2.1
SPT5P27692 UBP3YER151C 2739 nt1.9□□□□□ -2.1
SPT5P27692 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt1.9□□□□□ -2.11
SPT5P27692 PIK1YNL267W 3201 nt1.9□□□□□ -2.11
SPT5P27692 NUP192YJL039C 5052 nt1.9□□□□□ -2.11
SPT5P27692 SEC10YLR166C 2616 nt1.89□□□□□ -2.11
SPT5P27692 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt1.89□□□□□ -2.11
SPT5P27692 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.89□□□□□ -2.11
SPT5P27692 EST2YLR318W 2655 nt1.87□□□□□ -2.11
SPT5P27692 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt1.85□□□□□ -2.11
SPT5P27692 SSK2YNR031C 4740 nt1.84□□□□□ -2.11
SPT5P27692 IRA1YBR140C 9279 nt1.84□□□□□ -2.12
SPT5P27692 YSP1YHR155W 3687 nt1.83□□□□□ -2.12
SPT5P27692 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt1.82□□□□□ -2.12
SPT5P27692 GLG1YKR058W 1851 nt1.8□□□□□ -2.12
SPT5P27692 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt1.8□□□□□ -2.12
SPT5P27692 BRR2YER172C 6492 nt1.8□□□□□ -2.12
SPT5P27692 ULP2YIL031W 3105 nt1.79□□□□□ -2.12
SPT5P27692 SXM1YDR395W 2835 nt1.76□□□□□ -2.13
SPT5P27692 MSH3YCR092C 3057 nt1.76□□□□□ -2.13
SPT5P27692 MSN5YDR335W 3675 nt1.76□□□□□ -2.13
SPT5P27692 ANS1YHR126C 480 nt1.74□□□□□ -2.13
SPT5P27692 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.73□□□□□ -2.13
SPT5P27692 snR47snR47 99 nt1.72□□□□□ -2.13
SPT5P27692 CAT8YMR280C 4302 nt1.71□□□□□ -2.14
SPT5P27692 EST1YLR233C 2100 nt1.7□□□□□ -2.14
SPT5P27692 ORC3YLL004W 1851 nt1.7□□□□□ -2.14
SPT5P27692 PET127YOR017W 2403 nt1.7□□□□□ -2.14
SPT5P27692 LAA1YJL207C 6045 nt1.68□□□□□ -2.14
SPT5P27692 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.67□□□□□ -2.14
SPT5P27692 FYV8YGR196C 2454 nt1.66□□□□□ -2.14
SPT5P27692 CLU1YMR012W 3834 nt1.66□□□□□ -2.14
SPT5P27692 CCH1YGR217W 6120 nt1.65□□□□□ -2.15
SPT5P27692 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.65□□□□□ -2.15
SPT5P27692 CSE1YGL238W 2883 nt1.64□□□□□ -2.15
SPT5P27692 snR69snR69 101 nt1.64□□□□□ -2.15
SPT5P27692 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.62□□□□□ -2.15
SPT5P27692 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.61□□□□□ -2.15
SPT5P27692 SPT7YBR081C 3999 nt1.61□□□□□ -2.15
SPT5P27692 HUG1YML058W-A 207 nt1.6□□□□□ -2.15
SPT5P27692 YGR130CYGR130C 2451 nt1.6□□□□□ -2.15
SPT5P27692 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.59□□□□□ -2.15
SPT5P27692 SPC110YDR356W 2835 nt1.58□□□□□ -2.16
SPT5P27692 RDS3YPR094W 324 nt1.55□□□□□ -2.16
SPT5P27692 snR53snR53 91 nt1.55□□□□□ -2.16
SPT5P27692 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.54□□□□□ -2.16
SPT5P27692 NIP1YMR309C 2439 nt1.54□□□□□ -2.16
SPT5P27692 snR64snR64 101 nt1.52□□□□□ -2.17
SPT5P27692 NST1YNL091W 3723 nt1.52□□□□□ -2.17
SPT5P27692 HKR1YDR420W 5409 nt1.51□□□□□ -2.17
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