Protein–RNA interactions for Protein: P0CX55

RPS18A, 40S ribosomal protein S18-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS18AP0CX55 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
RPS18AP0CX55 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.56□□□□□ -2.32
RPS18AP0CX55 YOR345CYOR345C 351 nt0.56□□□□□ -2.32
RPS18AP0CX55 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.56□□□□□ -2.32
RPS18AP0CX55 YKU70YMR284W 1809 nt0.55□□□□□ -2.32
RPS18AP0CX55 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.55□□□□□ -2.32
RPS18AP0CX55 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.54□□□□□ -2.32
RPS18AP0CX55 UTP10YJL109C 5310 nt0.53□□□□□ -2.32
RPS18AP0CX55 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.53□□□□□ -2.32
RPS18AP0CX55 YGL041CYGL041C 204 nt0.53□□□□□ -2.32
RPS18AP0CX55 YLR041WYLR041W 321 nt0.53□□□□□ -2.32
RPS18AP0CX55 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.53□□□□□ -2.32
RPS18AP0CX55 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.52□□□□□ -2.33
RPS18AP0CX55 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.51□□□□□ -2.33
RPS18AP0CX55 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.5□□□□□ -2.33
RPS18AP0CX55 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.5□□□□□ -2.33
RPS18AP0CX55 PAM16YJL104W 450 nt0.5□□□□□ -2.33
RPS18AP0CX55 ABF2YMR072W 552 nt0.5□□□□□ -2.33
RPS18AP0CX55 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.5□□□□□ -2.33
RPS18AP0CX55 PET111YMR257C 2403 nt0.49□□□□□ -2.33
RPS18AP0CX55 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.48□□□□□ -2.33
RPS18AP0CX55 PAU12YGR294W 363 nt0.47□□□□□ -2.33
RPS18AP0CX55 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.47□□□□□ -2.33
RPS18AP0CX55 BEM3YPL115C 3387 nt0.46□□□□□ -2.34
RPS18AP0CX55 YDR366CYDR366C 399 nt0.46□□□□□ -2.34
RPS18AP0CX55 APQ12YIL040W 417 nt0.46□□□□□ -2.34
RPS18AP0CX55 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.46□□□□□ -2.34
RPS18AP0CX55 FMP27YLR454W 7887 nt0.45□□□□□ -2.34
RPS18AP0CX55 snR80snR80 171 nt0.45□□□□□ -2.34
RPS18AP0CX55 SNU13YEL026W 381 nt0.45□□□□□ -2.34
RPS18AP0CX55 YOR302WYOR302W 78 nt0.45□□□□□ -2.34
RPS18AP0CX55 YSP1YHR155W 3687 nt0.45□□□□□ -2.34
RPS18AP0CX55 NNF2YGR089W 2811 nt0.44□□□□□ -2.34
RPS18AP0CX55 SBH1YER087C-B 249 nt0.44□□□□□ -2.34
RPS18AP0CX55 TRS65YGR166W 1683 nt0.43□□□□□ -2.34
RPS18AP0CX55 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.42□□□□□ -2.34
RPS18AP0CX55 UTP8YGR128C 2142 nt0.41□□□□□ -2.34
RPS18AP0CX55 snR8snR8 190 nt0.4□□□□□ -2.35
RPS18AP0CX55 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.39□□□□□ -2.35
RPS18AP0CX55 RPS26AYGL189C 360 nt0.39□□□□□ -2.35
RPS18AP0CX55 ORC3YLL004W 1851 nt0.38□□□□□ -2.35
RPS18AP0CX55 NIP1YMR309C 2439 nt0.38□□□□□ -2.35
RPS18AP0CX55 IQG1YPL242C 4488 nt0.38□□□□□ -2.35
RPS18AP0CX55 PRP39YML046W 1890 nt0.37□□□□□ -2.35
RPS18AP0CX55 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.37□□□□□ -2.35
RPS18AP0CX55 YLR232WYLR232W 348 nt0.37□□□□□ -2.35
RPS18AP0CX55 TAH1YCR060W 336 nt0.35□□□□□ -2.35
RPS18AP0CX55 YEL014CYEL014C 306 nt0.35□□□□□ -2.35
RPS18AP0CX55 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.35□□□□□ -2.35
RPS18AP0CX55 BUL2YML111W 2763 nt0.35□□□□□ -2.35
RPS18AP0CX55 MLP1YKR095W 5628 nt0.35□□□□□ -2.35
RPS18AP0CX55 YJL182CYJL182C 318 nt0.33□□□□□ -2.36
RPS18AP0CX55 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.32□□□□□ -2.36
RPS18AP0CX55 YMR160WYMR160W 2451 nt0.32□□□□□ -2.36
RPS18AP0CX55 YDR544CYDR544C 429 nt0.31□□□□□ -2.36
RPS18AP0CX55 RCO1YMR075W 2055 nt0.29□□□□□ -2.36
RPS18AP0CX55 UTP20YBL004W 7482 nt0.29□□□□□ -2.36
RPS18AP0CX55 SDH6YDR379C-A 240 nt0.28□□□□□ -2.36
RPS18AP0CX55 YGL182CYGL182C 324 nt0.28□□□□□ -2.36
RPS18AP0CX55 ULP2YIL031W 3105 nt0.28□□□□□ -2.37
RPS18AP0CX55 ESP1YGR098C 4893 nt0.27□□□□□ -2.37
RPS18AP0CX55 GLG1YKR058W 1851 nt0.27□□□□□ -2.37
RPS18AP0CX55 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt0.27□□□□□ -2.37
RPS18AP0CX55 BIR1YJR089W 2865 nt0.27□□□□□ -2.37
RPS18AP0CX55 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.26□□□□□ -2.37
RPS18AP0CX55 YEL073CYEL073C 324 nt0.26□□□□□ -2.37
RPS18AP0CX55 COG6YNL041C 2520 nt0.25□□□□□ -2.37
RPS18AP0CX55 snR46snR46 197 nt0.25□□□□□ -2.37
RPS18AP0CX55 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.25□□□□□ -2.37
RPS18AP0CX55 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.22□□□□□ -2.37
RPS18AP0CX55 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.21□□□□□ -2.38
RPS18AP0CX55 CSE1YGL238W 2883 nt0.21□□□□□ -2.38
RPS18AP0CX55 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.2□□□□□ -2.38
RPS18AP0CX55 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.2□□□□□ -2.38
RPS18AP0CX55 snR52snR52 92 nt0.2□□□□□ -2.38
RPS18AP0CX55 YOR170WYOR170W 306 nt0.18□□□□□ -2.38
RPS18AP0CX55 MLP2YIL149C 5040 nt0.16□□□□□ -2.38
RPS18AP0CX55 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.16□□□□□ -2.38
RPS18AP0CX55 YBR099CYBR099C 384 nt0.15□□□□□ -2.39
RPS18AP0CX55 AI1Q0050 2505 nt0.15□□□□□ -2.39
RPS18AP0CX55 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.14□□□□□ -2.39
RPS18AP0CX55 SOV1YMR066W 2697 nt0.13□□□□□ -2.39
RPS18AP0CX55 THO2YNL139C 4794 nt0.13□□□□□ -2.39
RPS18AP0CX55 SPG3YDR504C 384 nt0.12□□□□□ -2.39
RPS18AP0CX55 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.12□□□□□ -2.39
RPS18AP0CX55 HUG1YML058W-A 207 nt0.12□□□□□ -2.39
RPS18AP0CX55 RPM2YML091C 3609 nt0.12□□□□□ -2.39
RPS18AP0CX55 YDR210WYDR210W 228 nt0.11□□□□□ -2.39
RPS18AP0CX55 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.11□□□□□ -2.39
RPS18AP0CX55 JLP2YMR132C 627 nt0.1□□□□□ -2.39
RPS18AP0CX55 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.09□□□□□ -2.4
RPS18AP0CX55 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.08□□□□□ -2.4
RPS18AP0CX55 YJL150WYJL150W 303 nt0.07□□□□□ -2.4
RPS18AP0CX55 EST1YLR233C 2100 nt0.07□□□□□ -2.4
RPS18AP0CX55 snR48snR48 113 nt0.06□□□□□ -2.4
RPS18AP0CX55 snR39BsnR39B 96 nt0.05□□□□□ -2.4
RPS18AP0CX55 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.03□□□□□ -2.4
RPS18AP0CX55 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.03□□□□□ -2.4
RPS18AP0CX55 STF2YGR008C 255 nt0.03□□□□□ -2.4
RPS18AP0CX55 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.4 ms