Protein–RNA interactions for Protein: P0C2J7

TY4B-H, Transposon Ty4-H Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY4B-HP0C2J7 YFL063WYFL063W 456 nt-0.92□□□□□ -2.56
TY4B-HP0C2J7 CBS1YDL069C 690 nt-0.93□□□□□ -2.56
TY4B-HP0C2J7 RPS27BYHR021C 249 nt-0.93□□□□□ -2.56
TY4B-HP0C2J7 YER053C-AYER053C-A 114 nt-0.94□□□□□ -2.56
TY4B-HP0C2J7 YER084W-AYER084W-A 513 nt-0.94□□□□□ -2.56
TY4B-HP0C2J7 snR161snR161 161 nt-0.94□□□□□ -2.56
TY4B-HP0C2J7 VPS20YMR077C 666 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY4B-HP0C2J7 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-0.97□□□□□ -2.56
TY4B-HP0C2J7 YGR069WYGR069W 336 nt-0.99□□□□□ -2.57
TY4B-HP0C2J7 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-0.99□□□□□ -2.57
TY4B-HP0C2J7 PRM3YPL192C 402 nt-0.99□□□□□ -2.57
TY4B-HP0C2J7 YER006C-AYER006C-A 318 nt-0.99□□□□□ -2.57
TY4B-HP0C2J7 CSE2YNR010W 450 nt-1□□□□□ -2.57
TY4B-HP0C2J7 MPC1YGL080W 393 nt-1.01□□□□□ -2.57
TY4B-HP0C2J7 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt-1.01□□□□□ -2.57
TY4B-HP0C2J7 EAF6YJR082C 342 nt-1.02□□□□□ -2.57
TY4B-HP0C2J7 TOM22YNL131W 459 nt-1.02□□□□□ -2.57
TY4B-HP0C2J7 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-1.05□□□□□ -2.58
TY4B-HP0C2J7 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt-1.05□□□□□ -2.58
TY4B-HP0C2J7 YGL182CYGL182C 324 nt-1.08□□□□□ -2.58
TY4B-HP0C2J7 YJL182CYJL182C 318 nt-1.08□□□□□ -2.58
TY4B-HP0C2J7 snR49snR49 165 nt-1.09□□□□□ -2.58
TY4B-HP0C2J7 APQ12YIL040W 417 nt-1.1□□□□□ -2.59
TY4B-HP0C2J7 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-1.1□□□□□ -2.59
TY4B-HP0C2J7 Q0255Q0255 1419 nt-1.1□□□□□ -2.59
TY4B-HP0C2J7 YDR544CYDR544C 429 nt-1.12□□□□□ -2.59
TY4B-HP0C2J7 YGL052WYGL052W 306 nt-1.12□□□□□ -2.59
TY4B-HP0C2J7 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-1.13□□□□□ -2.59
TY4B-HP0C2J7 STE18YJR086W 333 nt-1.14□□□□□ -2.59
TY4B-HP0C2J7 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-1.14□□□□□ -2.59
TY4B-HP0C2J7 CSN9YDR179C 489 nt-1.15□□□□□ -2.59
TY4B-HP0C2J7 BI2Q0110 1272 nt-1.15□□□□□ -2.59
TY4B-HP0C2J7 YGL149WYGL149W 306 nt-1.15□□□□□ -2.59
TY4B-HP0C2J7 YOR015WYOR015W 360 nt-1.15□□□□□ -2.59
TY4B-HP0C2J7 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-1.19□□□□□ -2.6
TY4B-HP0C2J7 YOR170WYOR170W 306 nt-1.19□□□□□ -2.6
TY4B-HP0C2J7 YBR285WYBR285W 435 nt-1.2□□□□□ -2.6
TY4B-HP0C2J7 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-1.22□□□□□ -2.6
TY4B-HP0C2J7 YAF9YNL107W 681 nt-1.22□□□□□ -2.61
TY4B-HP0C2J7 YER137W-AYER137W-A 306 nt-1.23□□□□□ -2.61
TY4B-HP0C2J7 YIL032CYIL032C 357 nt-1.23□□□□□ -2.61
TY4B-HP0C2J7 YKL123WYKL123W 381 nt-1.23□□□□□ -2.61
TY4B-HP0C2J7 snR41snR41 95 nt-1.23□□□□□ -2.61
TY4B-HP0C2J7 YER090C-AYER090C-A 90 nt-1.24□□□□□ -2.61
TY4B-HP0C2J7 YOR121CYOR121C 306 nt-1.24□□□□□ -2.61
TY4B-HP0C2J7 YLR434CYLR434C 384 nt-1.25□□□□□ -2.61
TY4B-HP0C2J7 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-1.26□□□□□ -2.61
TY4B-HP0C2J7 snR189snR189 189 nt-1.26□□□□□ -2.61
TY4B-HP0C2J7 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.28□□□□□ -2.61
TY4B-HP0C2J7 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-1.28□□□□□ -2.61
TY4B-HP0C2J7 YNL122CYNL122C 348 nt-1.28□□□□□ -2.61
TY4B-HP0C2J7 HMRA1YCR097W 381 nt-1.29□□□□□ -2.62
TY4B-HP0C2J7 YDL158CYDL158C 309 nt-1.29□□□□□ -2.62
TY4B-HP0C2J7 YNL266WYNL266W 420 nt-1.29□□□□□ -2.62
TY4B-HP0C2J7 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-1.31□□□□□ -2.62
TY4B-HP0C2J7 JLP2YMR132C 627 nt-1.31□□□□□ -2.62
TY4B-HP0C2J7 snR60snR60 104 nt-1.32□□□□□ -2.62
TY4B-HP0C2J7 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-1.32□□□□□ -2.62
TY4B-HP0C2J7 YDR048CYDR048C 315 nt-1.33□□□□□ -2.62
TY4B-HP0C2J7 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-1.33□□□□□ -2.62
TY4B-HP0C2J7 snR74snR74 88 nt-1.37□□□□□ -2.63
TY4B-HP0C2J7 YNL028WYNL028W 318 nt-1.37□□□□□ -2.63
TY4B-HP0C2J7 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-1.4□□□□□ -2.63
TY4B-HP0C2J7 YML099W-AYML099W-A 330 nt-1.41□□□□□ -2.64
TY4B-HP0C2J7 SKI7YOR076C 2244 nt-1.41□□□□□ -2.64
TY4B-HP0C2J7 YNL324WYNL324W 396 nt-1.43□□□□□ -2.64
TY4B-HP0C2J7 snR50snR50 90 nt-1.43□□□□□ -2.64
TY4B-HP0C2J7 YDR102CYDR102C 333 nt-1.44□□□□□ -2.64
TY4B-HP0C2J7 snR69snR69 101 nt-1.45□□□□□ -2.64
TY4B-HP0C2J7 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.45□□□□□ -2.64
TY4B-HP0C2J7 RDS3YPR094W 324 nt-1.45□□□□□ -2.64
TY4B-HP0C2J7 ATP6Q0085 780 nt-1.46□□□□□ -2.64
TY4B-HP0C2J7 YFL032WYFL032W 321 nt-1.46□□□□□ -2.64
TY4B-HP0C2J7 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-1.47□□□□□ -2.64
TY4B-HP0C2J7 YKL063CYKL063C 504 nt-1.48□□□□□ -2.65
TY4B-HP0C2J7 YNR025CYNR025C 360 nt-1.48□□□□□ -2.65
TY4B-HP0C2J7 YFL019CYFL019C 354 nt-1.5□□□□□ -2.65
TY4B-HP0C2J7 YER097WYER097W 330 nt-1.5□□□□□ -2.65
TY4B-HP0C2J7 snR77snR77 88 nt-1.52□□□□□ -2.65
TY4B-HP0C2J7 BIL1YOR304C-A 231 nt-1.52□□□□□ -2.65
TY4B-HP0C2J7 snR81snR81 201 nt-1.52□□□□□ -2.65
TY4B-HP0C2J7 YLR202CYLR202C 327 nt-1.52□□□□□ -2.65
TY4B-HP0C2J7 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-1.53□□□□□ -2.65
TY4B-HP0C2J7 HTL1YCR020W-B 237 nt-1.54□□□□□ -2.66
TY4B-HP0C2J7 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.54□□□□□ -2.66
TY4B-HP0C2J7 PMP2YEL017C-A 132 nt-1.54□□□□□ -2.66
TY4B-HP0C2J7 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt-1.56□□□□□ -2.66
TY4B-HP0C2J7 snR67snR67 82 nt-1.56□□□□□ -2.66
TY4B-HP0C2J7 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-1.56□□□□□ -2.66
TY4B-HP0C2J7 YNL205CYNL205C 423 nt-1.56□□□□□ -2.66
TY4B-HP0C2J7 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-1.57□□□□□ -2.66
TY4B-HP0C2J7 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-1.58□□□□□ -2.66
TY4B-HP0C2J7 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-1.61□□□□□ -2.67
TY4B-HP0C2J7 snR39BsnR39B 96 nt-1.61□□□□□ -2.67
TY4B-HP0C2J7 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-1.62□□□□□ -2.67
TY4B-HP0C2J7 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.62□□□□□ -2.67
TY4B-HP0C2J7 YEL014CYEL014C 306 nt-1.63□□□□□ -2.67
TY4B-HP0C2J7 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.63□□□□□ -2.67
TY4B-HP0C2J7 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.66□□□□□ -2.67
TY4B-HP0C2J7 YGR035CYGR035C 351 nt-1.68□□□□□ -2.68
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