Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
ARFGEF2Q9Y6D5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGEF2Q9Y6D5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms