Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNIKQ9UKE5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.1 ms