Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms