Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3C1V9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3C1V9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3C1V9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3C1V9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3C1V9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3C1V9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3C1V9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3C1V9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3C1V9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3C1V9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3C1V9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3C1V9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3C1V9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3C1V9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3C1V9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3C1V9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3C1V9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3C1V9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3C1V9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3C1V9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3C1V9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3C1V9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3C1V9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3C1V9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3C1V9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3C1V9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3C1V9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3C1V9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3C1V9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3C1V9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3C1V9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3C1V9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3C1V9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3C1V9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3C1V9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms