Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTP4A2Q12974 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTP4A2Q12974 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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PTP4A2Q12974 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTP4A2Q12974 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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