Protein–RNA interactions for Protein: Q12383

TRM13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13, yeastyeast

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Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM13Q12383 NUP170YBL079W 4509 nt1.85□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 UTP22YGR090W 3714 nt1.84□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 YPP1YGR198W 2454 nt1.84□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 SBH1YER087C-B 249 nt1.84□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.84□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 SEC63YOR254C 1992 nt1.84□□□□□ -2.11
TRM13Q12383 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.84□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 NAB6YML117W 3405 nt1.84□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 HSL1YKL101W 4557 nt1.83□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.82□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 UTP21YLR409C 2820 nt1.82□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 MYO4YAL029C 4416 nt1.82□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 RSM22YKL155C 1887 nt1.82□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 SMC1YFL008W 3678 nt1.81□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 MSH6YDR097C 3729 nt1.81□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 TDA9YML081W 3756 nt1.81□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 YLL020CYLL020C 306 nt1.81□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.81□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 YLL054CYLL054C 2532 nt1.81□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 NEO1YIL048W 3456 nt1.8□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 YGL182CYGL182C 324 nt1.8□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 SPO24YPR036W-A 204 nt1.8□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 TRM3YDL112W 4311 nt1.8□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 LHS1YKL073W 2646 nt1.8□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.79□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.78□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 STF2YGR008C 255 nt1.78□□□□□ -2.12
TRM13Q12383 UFD2YDL190C 2886 nt1.77□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 HIR3YJR140C 4947 nt1.77□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 snR70snR70 164 nt1.77□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 INO80YGL150C 4470 nt1.77□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 MMS4YBR098W 2076 nt1.76□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 MGA2YIR033W 3342 nt1.76□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 YMR045CYMR045C 5268 nt1.75□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 PDR8YLR266C 2106 nt1.75□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 TBS1YBR150C 3285 nt1.75□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 QCR9YGR183C 201 nt1.75□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 BFR2YDR299W 1605 nt1.75□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 SEC31YDL195W 3822 nt1.75□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 YJR039WYJR039W 3366 nt1.75□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 RAD50YNL250W 3939 nt1.74□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.74□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 ATG9YDL149W 2994 nt1.74□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 GYP5YPL249C 2685 nt1.73□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt1.73□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 KIP1YBL063W 3336 nt1.73□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 IRC20YLR247C 4671 nt1.73□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 COX5BYIL111W 456 nt1.72□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 NUT1YGL151W 3399 nt1.72□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 PAN2YGL094C 3348 nt1.72□□□□□ -2.13
TRM13Q12383 SIR4YDR227W 4077 nt1.71□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 EMC5YIL027C 426 nt1.71□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.71□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 COA6YMR244C-A 315 nt1.71□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.7□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 TMA7YLR262C-A 195 nt1.7□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 MYO2YOR326W 4725 nt1.69□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 ALY2YJL084C 3141 nt1.69□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 MDS3YGL197W 4464 nt1.68□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 TAH1YCR060W 336 nt1.68□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 POL5YEL055C 3069 nt1.68□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 YML002WYML002W 2214 nt1.68□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 BPH1YCR032W 6504 nt1.68□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.67□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.67□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 RTP1YMR185W 2946 nt1.67□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 EAF1YDR359C 2949 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 VPS15YBR097W 4365 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 PEP1YBL017C 4740 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 YAR009CYAR009C 3591 nt1.65□□□□□ -2.14
TRM13Q12383 SLX4YLR135W 2247 nt1.65□□□□□ -2.15
TRM13Q12383 YLR419WYLR419W 4308 nt1.65□□□□□ -2.15
TRM13Q12383 STB6YKL072W 2301 nt1.65□□□□□ -2.15
TRM13Q12383 FIG2YCR089W 4830 nt1.64□□□□□ -2.15
TRM13Q12383 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.63□□□□□ -2.15
TRM13Q12383 snR39BsnR39B 96 nt1.63□□□□□ -2.15
TRM13Q12383 SEC21YNL287W 2808 nt1.62□□□□□ -2.15
TRM13Q12383 FAB1YFR019W 6837 nt1.62□□□□□ -2.15
TRM13Q12383 SMC4YLR086W 4257 nt1.61□□□□□ -2.15
TRM13Q12383 YLR232WYLR232W 348 nt1.6□□□□□ -2.15
TRM13Q12383 CHS1YNL192W 3396 nt1.6□□□□□ -2.15
TRM13Q12383 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.59□□□□□ -2.15
TRM13Q12383 SKI3YPR189W 4299 nt1.59□□□□□ -2.16
TRM13Q12383 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.58□□□□□ -2.16
TRM13Q12383 FYV10YIL097W 1551 nt1.58□□□□□ -2.16
TRM13Q12383 NOP9YJL010C 2001 nt1.57□□□□□ -2.16
TRM13Q12383 YOR093CYOR093C 4947 nt1.57□□□□□ -2.16
TRM13Q12383 RPL26BYGR034W 384 nt1.57□□□□□ -2.16
TRM13Q12383 YLR422WYLR422W 5799 nt1.57□□□□□ -2.16
TRM13Q12383 PKH3YDR466W 2697 nt1.56□□□□□ -2.16
TRM13Q12383 APL3YBL037W 3078 nt1.56□□□□□ -2.16
TRM13Q12383 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.56□□□□□ -2.16
TRM13Q12383 WAR1YML076C 2835 nt1.55□□□□□ -2.16
TRM13Q12383 snR14snR14 160 nt1.55□□□□□ -2.16
TRM13Q12383 STO1YMR125W 2586 nt1.55□□□□□ -2.16
TRM13Q12383 ROM2YLR371W 4071 nt1.54□□□□□ -2.16
TRM13Q12383 snR190snR190 190 nt1.54□□□□□ -2.16
TRM13Q12383 YLR041WYLR041W 321 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 YCS4YLR272C 3531 nt1.52□□□□□ -2.17
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