Protein–RNA interactions for Protein: Q12254

SVS1, Protein SVS1, yeastyeast

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SVS1Q12254 SEY1YOR165W 2331 nt2.02□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 SFB2YNL049C 2631 nt2.02□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 HER1YOR227W 3741 nt2.01□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.01□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 SPO24YPR036W-A 204 nt2.01□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 SIR4YDR227W 4077 nt2.01□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 SPP41YDR464W 4308 nt2.01□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 POL5YEL055C 3069 nt2.01□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 snR61snR61 90 nt2□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 YLR282CYLR282C 342 nt2□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 NUT1YGL151W 3399 nt2□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 CHS6YJL099W 2241 nt1.99□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 HSL1YKL101W 4557 nt1.99□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 UBP2YOR124C 3819 nt1.99□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 LHS1YKL073W 2646 nt1.99□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 UFD2YDL190C 2886 nt1.98□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 SEC63YOR254C 1992 nt1.98□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 GCN2YDR283C 4980 nt1.98□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 YGL182CYGL182C 324 nt1.98□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 YJR039WYJR039W 3366 nt1.98□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 MSH6YDR097C 3729 nt1.98□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.98□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt1.97□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 TOR1YJR066W 7413 nt1.97□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 UTP21YLR409C 2820 nt1.97□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 ALY2YJL084C 3141 nt1.95□□□□□ -2.1
SVS1Q12254 SOM1YEL059C-A 225 nt1.95□□□□□ -2.1
SVS1Q12254 SBH1YER087C-B 249 nt1.95□□□□□ -2.1
SVS1Q12254 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.95□□□□□ -2.1
SVS1Q12254 YLL020CYLL020C 306 nt1.94□□□□□ -2.1
SVS1Q12254 BFR2YDR299W 1605 nt1.94□□□□□ -2.1
SVS1Q12254 PAN2YGL094C 3348 nt1.93□□□□□ -2.1
SVS1Q12254 STB6YKL072W 2301 nt1.93□□□□□ -2.1
SVS1Q12254 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.93□□□□□ -2.1
SVS1Q12254 RGA1YOR127W 3024 nt1.93□□□□□ -2.1
SVS1Q12254 SEC31YDL195W 3822 nt1.92□□□□□ -2.1
SVS1Q12254 UTP8YGR128C 2142 nt1.91□□□□□ -2.1
SVS1Q12254 MGA2YIR033W 3342 nt1.91□□□□□ -2.1
SVS1Q12254 EMC5YIL027C 426 nt1.91□□□□□ -2.1
SVS1Q12254 COA6YMR244C-A 315 nt1.91□□□□□ -2.1
SVS1Q12254 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.9□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.9□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 RSM22YKL155C 1887 nt1.9□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 UBR2YLR024C 5619 nt1.9□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 PEP1YBL017C 4740 nt1.9□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 YOR093CYOR093C 4947 nt1.9□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 EAF1YDR359C 2949 nt1.89□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 KIP1YBL063W 3336 nt1.89□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 STF2YGR008C 255 nt1.89□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.89□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.89□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 RAD50YNL250W 3939 nt1.89□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 ATG9YDL149W 2994 nt1.89□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 TBS1YBR150C 3285 nt1.88□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 PDR8YLR266C 2106 nt1.88□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 NEO1YIL048W 3456 nt1.88□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 COX5BYIL111W 456 nt1.88□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 MMS4YBR098W 2076 nt1.87□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 YLR419WYLR419W 4308 nt1.87□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 USO1YDL058W 5373 nt1.87□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 QCR9YGR183C 201 nt1.86□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 TMA7YLR262C-A 195 nt1.86□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 MYO4YAL029C 4416 nt1.86□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 MYO2YOR326W 4725 nt1.85□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 YAR009CYAR009C 3591 nt1.85□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 YCS4YLR272C 3531 nt1.84□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 snR39BsnR39B 96 nt1.84□□□□□ -2.11
SVS1Q12254 KCS1YDR017C 3153 nt1.84□□□□□ -2.12
SVS1Q12254 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.83□□□□□ -2.12
SVS1Q12254 SLX4YLR135W 2247 nt1.83□□□□□ -2.12
SVS1Q12254 TAH1YCR060W 336 nt1.82□□□□□ -2.12
SVS1Q12254 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt1.82□□□□□ -2.12
SVS1Q12254 DNF3YMR162C 4971 nt1.82□□□□□ -2.12
SVS1Q12254 SKI3YPR189W 4299 nt1.82□□□□□ -2.12
SVS1Q12254 snR14snR14 160 nt1.81□□□□□ -2.12
SVS1Q12254 YLR422WYLR422W 5799 nt1.79□□□□□ -2.12
SVS1Q12254 YML002WYML002W 2214 nt1.79□□□□□ -2.12
SVS1Q12254 RTP1YMR185W 2946 nt1.79□□□□□ -2.12
SVS1Q12254 SMC4YLR086W 4257 nt1.78□□□□□ -2.12
SVS1Q12254 NUP157YER105C 4176 nt1.77□□□□□ -2.13
SVS1Q12254 KAP122YGL016W 3246 nt1.77□□□□□ -2.13
SVS1Q12254 ANS1YHR126C 480 nt1.77□□□□□ -2.13
SVS1Q12254 YLR041WYLR041W 321 nt1.77□□□□□ -2.13
SVS1Q12254 BPH1YCR032W 6504 nt1.77□□□□□ -2.13
SVS1Q12254 SMC1YFL008W 3678 nt1.77□□□□□ -2.13
SVS1Q12254 CFT1YDR301W 4074 nt1.76□□□□□ -2.13
SVS1Q12254 RCO1YMR075W 2055 nt1.75□□□□□ -2.13
SVS1Q12254 NOP9YJL010C 2001 nt1.74□□□□□ -2.13
SVS1Q12254 YMR045CYMR045C 5268 nt1.74□□□□□ -2.13
SVS1Q12254 NUP192YJL039C 5052 nt1.74□□□□□ -2.13
SVS1Q12254 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.73□□□□□ -2.13
SVS1Q12254 SEC21YNL287W 2808 nt1.73□□□□□ -2.13
SVS1Q12254 COG6YNL041C 2520 nt1.73□□□□□ -2.13
SVS1Q12254 SET3YKR029C 2256 nt1.73□□□□□ -2.13
SVS1Q12254 STO1YMR125W 2586 nt1.72□□□□□ -2.13
SVS1Q12254 FYV10YIL097W 1551 nt1.72□□□□□ -2.13
SVS1Q12254 YLR232WYLR232W 348 nt1.7□□□□□ -2.14
SVS1Q12254 MON2YNL297C 4911 nt1.7□□□□□ -2.14
SVS1Q12254 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.69□□□□□ -2.14
SVS1Q12254 snR190snR190 190 nt1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.3 ms