Protein–RNA interactions for Protein: Q12211

PUS1, tRNA pseudouridine synthase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS1Q12211 VMR1YHL035C 4779 nt2.58□□□□□ -2
PUS1Q12211 DGR2YKL121W 2559 nt2.58□□□□□ -2
PUS1Q12211 PTP2YOR208W 2253 nt2.58□□□□□ -2
PUS1Q12211 TUS1YLR425W 3924 nt2.58□□□□□ -2
PUS1Q12211 YOL098CYOL098C 3114 nt2.57□□□□□ -2
PUS1Q12211 TOF1YNL273W 3717 nt2.57□□□□□ -2
PUS1Q12211 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.57□□□□□ -2
PUS1Q12211 PHO91YNR013C 2685 nt2.57□□□□□ -2
PUS1Q12211 ALK1YGL021W 2283 nt2.57□□□□□ -2
PUS1Q12211 SMC6YLR383W 3345 nt2.56□□□□□ -2
PUS1Q12211 IRA2YOL081W 9240 nt2.56□□□□□ -2
PUS1Q12211 YOR055WYOR055W 435 nt2.56□□□□□ -2
PUS1Q12211 YJR039WYJR039W 3366 nt2.56□□□□□ -2
PUS1Q12211 RPL37BYDR500C 267 nt2.55□□□□□ -2
PUS1Q12211 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.55□□□□□ -2
PUS1Q12211 MNL2YLR057W 2550 nt2.55□□□□□ -2
PUS1Q12211 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt2.54□□□□□ -2
PUS1Q12211 SAP190YKR028W 3102 nt2.54□□□□□ -2
PUS1Q12211 MSB1YOR188W 3414 nt2.54□□□□□ -2
PUS1Q12211 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.53□□□□□ -2
PUS1Q12211 SWR1YDR334W 4545 nt2.53□□□□□ -2
PUS1Q12211 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.53□□□□□ -2
PUS1Q12211 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.53□□□□□ -2
PUS1Q12211 SAP185YJL098W 3177 nt2.53□□□□□ -2
PUS1Q12211 VPS13YLL040C 9435 nt2.52□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 TAE2YPL009C 3117 nt2.52□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 VPS16YPL045W 2397 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 COG4YPR105C 2586 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 YLR041WYLR041W 321 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 MMS22YLR320W 4365 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 UBP3YER151C 2739 nt2.5□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 STH1YIL126W 4080 nt2.5□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 SAS3YBL052C 2496 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 MGA2YIR033W 3342 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 DNF1YER166W 4716 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 NOP14YDL148C 2433 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 IST2YBR086C 2841 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 RTP1YMR185W 2946 nt2.48□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 UFD2YDL190C 2886 nt2.48□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 SCD5YOR329C 2619 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 UBR1YGR184C 5853 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 MET18YIL128W 3099 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 ZRG8YER033C 3231 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS1Q12211 RAV1YJR033C 4074 nt2.46□□□□□ -2.02
PUS1Q12211 BNI1YNL271C 5862 nt2.46□□□□□ -2.02
PUS1Q12211 MGM1YOR211C 2646 nt2.46□□□□□ -2.02
PUS1Q12211 KAP123YER110C 3342 nt2.45□□□□□ -2.02
PUS1Q12211 POL5YEL055C 3069 nt2.43□□□□□ -2.02
PUS1Q12211 HSL1YKL101W 4557 nt2.43□□□□□ -2.02
PUS1Q12211 SAC3YDR159W 3906 nt2.43□□□□□ -2.02
PUS1Q12211 BUD2YKL092C 3315 nt2.42□□□□□ -2.02
PUS1Q12211 PKH2YOL100W 3246 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS1Q12211 AZF1YOR113W 2745 nt2.4□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 SPP41YDR464W 4308 nt2.39□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 ATG9YDL149W 2994 nt2.39□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 BRE1YDL074C 2103 nt2.38□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 SEC10YLR166C 2616 nt2.38□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 SEC16YPL085W 6588 nt2.37□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 AI1Q0050 2505 nt2.37□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 YDL073WYDL073W 2955 nt2.37□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 CDC53YDL132W 2448 nt2.37□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 PIK1YNL267W 3201 nt2.36□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 TBS1YBR150C 3285 nt2.36□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 snR38snR38 95 nt2.36□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 MSH5YDL154W 2706 nt2.36□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 UBP2YOR124C 3819 nt2.35□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 USO1YDL058W 5373 nt2.35□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt2.35□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 UTP22YGR090W 3714 nt2.35□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt2.34□□□□□ -2.03
PUS1Q12211 SSD1YDR293C 3753 nt2.33□□□□□ -2.04
PUS1Q12211 SKI7YOR076C 2244 nt2.33□□□□□ -2.04
PUS1Q12211 INO80YGL150C 4470 nt2.32□□□□□ -2.04
PUS1Q12211 VPS8YAL002W 3825 nt2.32□□□□□ -2.04
PUS1Q12211 RTT101YJL047C 2529 nt2.32□□□□□ -2.04
PUS1Q12211 GIP3YPL137C 3831 nt2.32□□□□□ -2.04
PUS1Q12211 SEC21YNL287W 2808 nt2.31□□□□□ -2.04
PUS1Q12211 RPM2YML091C 3609 nt2.3□□□□□ -2.04
PUS1Q12211 WAR1YML076C 2835 nt2.3□□□□□ -2.04
PUS1Q12211 NEO1YIL048W 3456 nt2.3□□□□□ -2.04
PUS1Q12211 DCP2YNL118C 2913 nt2.29□□□□□ -2.04
PUS1Q12211 AGC1YPR021C 2709 nt2.29□□□□□ -2.04
PUS1Q12211 DGR1YNL130C-A 147 nt2.29□□□□□ -2.04
PUS1Q12211 TFC3YAL001C 3483 nt2.29□□□□□ -2.04
PUS1Q12211 COA6YMR244C-A 315 nt2.28□□□□□ -2.04
PUS1Q12211 RAD9YDR217C 3930 nt2.27□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 SLI15YBR156C 2097 nt2.27□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 NNF2YGR089W 2811 nt2.27□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 SMC1YFL008W 3678 nt2.26□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 TRL1YJL087C 2484 nt2.26□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 PET127YOR017W 2403 nt2.26□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 SFB2YNL049C 2631 nt2.26□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 RSM22YKL155C 1887 nt2.26□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 UFD4YKL010C 4452 nt2.26□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 RPL26BYGR034W 384 nt2.25□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.25□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt2.25□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 FRK1YPL141C 2598 nt2.25□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 GYP5YPL249C 2685 nt2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.4 ms