Protein–RNA interactions for Protein: Q08972

NEW1, [NU+] prion formation protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEW1Q08972 KAP122YGL016W 3246 nt1.74□□□□□ -2.13
NEW1Q08972 BST1YFL025C 3090 nt1.74□□□□□ -2.13
NEW1Q08972 HAL9YOL089C 3093 nt1.74□□□□□ -2.13
NEW1Q08972 ALK1YGL021W 2283 nt1.72□□□□□ -2.13
NEW1Q08972 NCA2YPR155C 1851 nt1.72□□□□□ -2.13
NEW1Q08972 FIG4YNL325C 2640 nt1.72□□□□□ -2.13
NEW1Q08972 NOC3YLR002C 1992 nt1.72□□□□□ -2.13
NEW1Q08972 APL2YKL135C 2181 nt1.71□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 YOR102WYOR102W 351 nt1.71□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 YPL044CYPL044C 549 nt1.71□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 TRM3YDL112W 4311 nt1.71□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 MDS3YGL197W 4464 nt1.71□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 SBE22YHR103W 2559 nt1.71□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 UFD2YDL190C 2886 nt1.71□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 YLR422WYLR422W 5799 nt1.7□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 PMP2YEL017C-A 132 nt1.7□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.7□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 YMR326CYMR326C 309 nt1.7□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.7□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 RAD34YDR314C 2079 nt1.7□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 PAA1YDR071C 576 nt1.69□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.69□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 YHR217CYHR217C 462 nt1.69□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 COA6YMR244C-A 315 nt1.69□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 NUT1YGL151W 3399 nt1.69□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 CAT8YMR280C 4302 nt1.68□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.68□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.68□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 ZIP2YGL249W 2115 nt1.67□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.67□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 RAD50YNL250W 3939 nt1.67□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 SXM1YDR395W 2835 nt1.67□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 NUP157YER105C 4176 nt1.66□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.66□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.66□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 AIM44YPL158C 2277 nt1.66□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 YLL054CYLL054C 2532 nt1.66□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 SMC4YLR086W 4257 nt1.66□□□□□ -2.14
NEW1Q08972 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.65□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 RPS30BYOR182C 192 nt1.65□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.65□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 MAD1YGL086W 2250 nt1.65□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 PMD1YER132C 5262 nt1.63□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.63□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 YBR099CYBR099C 384 nt1.63□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 YBR206WYBR206W 324 nt1.63□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 PIP2YOR363C 2991 nt1.63□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 SLX4YLR135W 2247 nt1.63□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 EST2YLR318W 2655 nt1.63□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.62□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 COX12YLR038C 252 nt1.62□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 YDR521WYDR521W 336 nt1.61□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 MSN5YDR335W 3675 nt1.61□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 SPC110YDR356W 2835 nt1.61□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 SLD3YGL113W 2007 nt1.61□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 IFH1YLR223C 3258 nt1.6□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt1.6□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.6□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 PBY1YBR094W 2262 nt1.59□□□□□ -2.15
NEW1Q08972 SLI15YBR156C 2097 nt1.59□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 LAA1YJL207C 6045 nt1.58□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 snR61snR61 90 nt1.58□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.58□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.58□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 CLU1YMR012W 3834 nt1.58□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 CCH1YGR217W 6120 nt1.58□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 TRM732YMR259C 4263 nt1.57□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 SSK2YNR031C 4740 nt1.57□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 CHS1YNL192W 3396 nt1.57□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 snR14snR14 160 nt1.57□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 AZF1YOR113W 2745 nt1.56□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 OST4YDL232W 111 nt1.56□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 POL5YEL055C 3069 nt1.55□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 ALY2YJL084C 3141 nt1.55□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 YNL211CYNL211C 261 nt1.55□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 CMC4YMR194C-B 222 nt1.54□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 NUP192YJL039C 5052 nt1.54□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 SWI4YER111C 3282 nt1.53□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 STB6YKL072W 2301 nt1.53□□□□□ -2.16
NEW1Q08972 COG4YPR105C 2586 nt1.52□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt1.52□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 YLR282CYLR282C 342 nt1.52□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 RCO1YMR075W 2055 nt1.52□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 PTP2YOR208W 2253 nt1.51□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 SBH1YER087C-B 249 nt1.51□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.51□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 MMS4YBR098W 2076 nt1.51□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 PRP5YBR237W 2550 nt1.51□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 MSH3YCR092C 3057 nt1.5□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 PET127YOR017W 2403 nt1.49□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 snR39BsnR39B 96 nt1.49□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 SEC21YNL287W 2808 nt1.49□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 NUP188YML103C 4968 nt1.49□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 TTI1YKL033W 3117 nt1.49□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 PKH2YOL100W 3246 nt1.48□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 SOM1YEL059C-A 225 nt1.48□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.48□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 SEC3YER008C 4011 nt1.48□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 PIK1YNL267W 3201 nt1.48□□□□□ -2.17
NEW1Q08972 CHS6YJL099W 2241 nt1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.2 ms