Protein–RNA interactions for Protein: Q03390

VPS60, Vacuolar protein-sorting-associated protein 60, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS60Q03390 UTP10YJL109C 5310 nt0.53□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt0.52□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.52□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 LTE1YAL024C 4308 nt0.52□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 ASE1YOR058C 2658 nt0.51□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 YNL211CYNL211C 261 nt0.51□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 RPL26BYGR034W 384 nt0.5□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 RPS25BYLR333C 327 nt0.5□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 YOR218CYOR218C 420 nt0.5□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 ULP2YIL031W 3105 nt0.5□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 STE5YDR103W 2754 nt0.5□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.49□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 YJL120WYJL120W 324 nt0.49□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.49□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 HTB2YBL002W 396 nt0.49□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 YPL225WYPL225W 441 nt0.49□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 BIR1YJR089W 2865 nt0.48□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 RPL35AYDL191W 363 nt0.48□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.48□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 SGF11YPL047W 300 nt0.48□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 TAR1YLR154W-C 375 nt0.47□□□□□ -2.33
VPS60Q03390 FYV10YIL097W 1551 nt0.46□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 BIL1YOR304C-A 231 nt0.46□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.45□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.45□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.45□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 YGR035CYGR035C 351 nt0.44□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 AI1Q0050 2505 nt0.44□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 SEC8YPR055W 3198 nt0.44□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 VAR1Q0140 1197 nt0.43□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.43□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.43□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.43□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 SSS1YDR086C 243 nt0.42□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 COX5BYIL111W 456 nt0.42□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 THO2YNL139C 4794 nt0.42□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 YDR157WYDR157W 402 nt0.41□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.41□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 YMR321CYMR321C 318 nt0.41□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 IQG1YPL242C 4488 nt0.4□□□□□ -2.34
VPS60Q03390 PRP5YBR237W 2550 nt0.4□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 YDR048CYDR048C 315 nt0.4□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.4□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 HAL9YOL089C 3093 nt0.39□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.38□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.38□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 PET111YMR257C 2403 nt0.38□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.37□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 OST4YDL232W 111 nt0.37□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.37□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 snR190snR190 190 nt0.37□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 YSP1YHR155W 3687 nt0.37□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 SBH1YER087C-B 249 nt0.36□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 QCR9YGR183C 201 nt0.36□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 PAU12YGR294W 363 nt0.36□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.36□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 YOL014WYOL014W 375 nt0.36□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 BEM3YPL115C 3387 nt0.36□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 COG8YML071C 1824 nt0.36□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 PRP42YDR235W 1635 nt0.35□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 TRS65YGR166W 1683 nt0.34□□□□□ -2.35
VPS60Q03390 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.34□□□□□ -2.36
VPS60Q03390 VIK1YPL253C 1944 nt0.34□□□□□ -2.36
VPS60Q03390 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.33□□□□□ -2.36
VPS60Q03390 RPS27BYHR021C 249 nt0.33□□□□□ -2.36
VPS60Q03390 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.33□□□□□ -2.36
VPS60Q03390 CSE2YNR010W 450 nt0.31□□□□□ -2.36
VPS60Q03390 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.3□□□□□ -2.36
VPS60Q03390 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.3□□□□□ -2.36
VPS60Q03390 ABF2YMR072W 552 nt0.3□□□□□ -2.36
VPS60Q03390 YOR345CYOR345C 351 nt0.3□□□□□ -2.36
VPS60Q03390 MLP1YKR095W 5628 nt0.3□□□□□ -2.36
VPS60Q03390 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.29□□□□□ -2.36
VPS60Q03390 YKL136WYKL136W 399 nt0.29□□□□□ -2.36
VPS60Q03390 YLR282CYLR282C 342 nt0.28□□□□□ -2.36
VPS60Q03390 snR60snR60 104 nt0.26□□□□□ -2.37
VPS60Q03390 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.25□□□□□ -2.37
VPS60Q03390 COY1YKL179C 2040 nt0.25□□□□□ -2.37
VPS60Q03390 HTL1YCR020W-B 237 nt0.24□□□□□ -2.37
VPS60Q03390 ULI1YFR026C 510 nt0.24□□□□□ -2.37
VPS60Q03390 YAF9YNL107W 681 nt0.24□□□□□ -2.37
VPS60Q03390 YPR092WYPR092W 306 nt0.24□□□□□ -2.37
VPS60Q03390 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.24□□□□□ -2.37
VPS60Q03390 NNF2YGR089W 2811 nt0.24□□□□□ -2.37
VPS60Q03390 YCR022CYCR022C 345 nt0.23□□□□□ -2.37
VPS60Q03390 YDR102CYDR102C 333 nt0.23□□□□□ -2.37
VPS60Q03390 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.23□□□□□ -2.37
VPS60Q03390 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.23□□□□□ -2.37
VPS60Q03390 YFL019CYFL019C 354 nt0.23□□□□□ -2.37
VPS60Q03390 YIL032CYIL032C 357 nt0.23□□□□□ -2.37
VPS60Q03390 RPS26AYGL189C 360 nt0.22□□□□□ -2.37
VPS60Q03390 ORC3YLL004W 1851 nt0.21□□□□□ -2.38
VPS60Q03390 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.2□□□□□ -2.38
VPS60Q03390 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.2□□□□□ -2.38
VPS60Q03390 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.2□□□□□ -2.38
VPS60Q03390 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.19□□□□□ -2.38
VPS60Q03390 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.19□□□□□ -2.38
VPS60Q03390 YPR012WYPR012W 255 nt0.19□□□□□ -2.38
VPS60Q03390 BLI1YKL061W 342 nt0.18□□□□□ -2.38
VPS60Q03390 YNL146WYNL146W 303 nt0.18□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.6 ms