Protein–RNA interactions for Protein: P53146

USE1, Protein transport protein USE1, yeastyeast

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USE1P53146 YPL225WYPL225W 441 nt0.26□□□□□ -2.37
USE1P53146 TAR1YLR154W-C 375 nt0.25□□□□□ -2.37
USE1P53146 YJL120WYJL120W 324 nt0.24□□□□□ -2.37
USE1P53146 YKL063CYKL063C 504 nt0.24□□□□□ -2.37
USE1P53146 RPS25BYLR333C 327 nt0.24□□□□□ -2.37
USE1P53146 IQG1YPL242C 4488 nt0.24□□□□□ -2.37
USE1P53146 PRP42YDR235W 1635 nt0.24□□□□□ -2.37
USE1P53146 SGF11YPL047W 300 nt0.23□□□□□ -2.37
USE1P53146 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.22□□□□□ -2.37
USE1P53146 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.22□□□□□ -2.37
USE1P53146 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.22□□□□□ -2.37
USE1P53146 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.22□□□□□ -2.37
USE1P53146 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.22□□□□□ -2.37
USE1P53146 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.22□□□□□ -2.37
USE1P53146 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.22□□□□□ -2.37
USE1P53146 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.22□□□□□ -2.37
USE1P53146 YMR321CYMR321C 318 nt0.22□□□□□ -2.37
USE1P53146 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.22□□□□□ -2.37
USE1P53146 MLP2YIL149C 5040 nt0.21□□□□□ -2.38
USE1P53146 UTP20YBL004W 7482 nt0.2□□□□□ -2.38
USE1P53146 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.2□□□□□ -2.38
USE1P53146 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.2□□□□□ -2.38
USE1P53146 CSN9YDR179C 489 nt0.19□□□□□ -2.38
USE1P53146 snR190snR190 190 nt0.19□□□□□ -2.38
USE1P53146 YPL205CYPL205C 345 nt0.18□□□□□ -2.38
USE1P53146 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.17□□□□□ -2.38
USE1P53146 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.17□□□□□ -2.38
USE1P53146 YOR345CYOR345C 351 nt0.17□□□□□ -2.38
USE1P53146 TRS65YGR166W 1683 nt0.17□□□□□ -2.38
USE1P53146 AI1Q0050 2505 nt0.16□□□□□ -2.38
USE1P53146 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.16□□□□□ -2.38
USE1P53146 YHR138CYHR138C 345 nt0.16□□□□□ -2.38
USE1P53146 YAR029WYAR029W 225 nt0.16□□□□□ -2.38
USE1P53146 YLR202CYLR202C 327 nt0.15□□□□□ -2.39
USE1P53146 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.14□□□□□ -2.39
USE1P53146 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.13□□□□□ -2.39
USE1P53146 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.13□□□□□ -2.39
USE1P53146 RPS26AYGL189C 360 nt0.12□□□□□ -2.39
USE1P53146 YBR285WYBR285W 435 nt0.12□□□□□ -2.39
USE1P53146 ORC3YLL004W 1851 nt0.12□□□□□ -2.39
USE1P53146 NNF2YGR089W 2811 nt0.11□□□□□ -2.39
USE1P53146 BIR1YJR089W 2865 nt0.11□□□□□ -2.39
USE1P53146 RCO1YMR075W 2055 nt0.11□□□□□ -2.39
USE1P53146 YER079WYER079W 633 nt0.11□□□□□ -2.39
USE1P53146 LEE1YPL054W 906 nt0.11□□□□□ -2.39
USE1P53146 PRM3YPL192C 402 nt0.11□□□□□ -2.39
USE1P53146 YOR121CYOR121C 306 nt0.1□□□□□ -2.39
USE1P53146 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.09□□□□□ -2.4
USE1P53146 HTB2YBL002W 396 nt0.09□□□□□ -2.4
USE1P53146 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.09□□□□□ -2.4
USE1P53146 YNL324WYNL324W 396 nt0.08□□□□□ -2.4
USE1P53146 YOL014WYOL014W 375 nt0.08□□□□□ -2.4
USE1P53146 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.07□□□□□ -2.4
USE1P53146 YNL146WYNL146W 303 nt0.07□□□□□ -2.4
USE1P53146 NIP1YMR309C 2439 nt0.06□□□□□ -2.4
USE1P53146 YCR022CYCR022C 345 nt0.06□□□□□ -2.4
USE1P53146 RPL35AYDL191W 363 nt0.06□□□□□ -2.4
USE1P53146 SSS1YDR086C 243 nt0.06□□□□□ -2.4
USE1P53146 AGA2YGL032C 264 nt0.06□□□□□ -2.4
USE1P53146 YAR053WYAR053W 297 nt0.05□□□□□ -2.4
USE1P53146 YLR282CYLR282C 342 nt0.05□□□□□ -2.4
USE1P53146 Q0017Q0017 162 nt0.05□□□□□ -2.4
USE1P53146 ULI1YFR026C 510 nt0.04□□□□□ -2.4
USE1P53146 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.04□□□□□ -2.4
USE1P53146 YKL136WYKL136W 399 nt0.04□□□□□ -2.4
USE1P53146 COG8YML071C 1824 nt0.03□□□□□ -2.4
USE1P53146 COX12YLR038C 252 nt0.03□□□□□ -2.4
USE1P53146 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.02□□□□□ -2.41
USE1P53146 YPR092WYPR092W 306 nt0.02□□□□□ -2.41
USE1P53146 BUL2YML111W 2763 nt0.01□□□□□ -2.41
USE1P53146 QCR9YGR183C 201 nt0.01□□□□□ -2.41
USE1P53146 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.01□□□□□ -2.41
USE1P53146 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.01□□□□□ -2.41
USE1P53146 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0□□□□□ -2.41
USE1P53146 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0□□□□□ -2.41
USE1P53146 COY1YKL179C 2040 nt-0.01□□□□□ -2.41
USE1P53146 RPS27BYHR021C 249 nt-0.01□□□□□ -2.41
USE1P53146 YJR157WYJR157W 363 nt-0.01□□□□□ -2.41
USE1P53146 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-0.01□□□□□ -2.41
USE1P53146 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.02□□□□□ -2.41
USE1P53146 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.03□□□□□ -2.41
USE1P53146 YDR048CYDR048C 315 nt-0.04□□□□□ -2.42
USE1P53146 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-0.04□□□□□ -2.42
USE1P53146 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-0.04□□□□□ -2.42
USE1P53146 BIL1YOR304C-A 231 nt-0.04□□□□□ -2.42
USE1P53146 YKU70YMR284W 1809 nt-0.04□□□□□ -2.42
USE1P53146 CSE2YNR010W 450 nt-0.05□□□□□ -2.42
USE1P53146 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-0.05□□□□□ -2.42
USE1P53146 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.06□□□□□ -2.42
USE1P53146 YLR041WYLR041W 321 nt-0.06□□□□□ -2.42
USE1P53146 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-0.07□□□□□ -2.42
USE1P53146 YEL073CYEL073C 324 nt-0.08□□□□□ -2.42
USE1P53146 SOV1YMR066W 2697 nt-0.1□□□□□ -2.42
USE1P53146 BLI1YKL061W 342 nt-0.1□□□□□ -2.43
USE1P53146 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-0.1□□□□□ -2.43
USE1P53146 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-0.1□□□□□ -2.43
USE1P53146 YFL063WYFL063W 456 nt-0.11□□□□□ -2.43
USE1P53146 YGR035CYGR035C 351 nt-0.11□□□□□ -2.43
USE1P53146 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt-0.11□□□□□ -2.43
USE1P53146 STE5YDR103W 2754 nt-0.12□□□□□ -2.43
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