Protein–RNA interactions for Protein: P39981

AVT2, Vacuolar amino acid transporter 2, yeastyeast

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT2P39981 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.46□□□□□ -2.34
AVT2P39981 YOR121CYOR121C 306 nt0.46□□□□□ -2.34
AVT2P39981 AI1Q0050 2505 nt0.46□□□□□ -2.34
AVT2P39981 NOP9YJL010C 2001 nt0.45□□□□□ -2.34
AVT2P39981 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.45□□□□□ -2.34
AVT2P39981 YOR282WYOR282W 321 nt0.45□□□□□ -2.34
AVT2P39981 NPR2YEL062W 1848 nt0.45□□□□□ -2.34
AVT2P39981 PTP2YOR208W 2253 nt0.44□□□□□ -2.34
AVT2P39981 CHS6YJL099W 2241 nt0.44□□□□□ -2.34
AVT2P39981 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt0.44□□□□□ -2.34
AVT2P39981 YPL044CYPL044C 549 nt0.44□□□□□ -2.34
AVT2P39981 SGF11YPL047W 300 nt0.44□□□□□ -2.34
AVT2P39981 PMP1YCR024C-A 123 nt0.43□□□□□ -2.34
AVT2P39981 RPL35AYDL191W 363 nt0.43□□□□□ -2.34
AVT2P39981 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.43□□□□□ -2.34
AVT2P39981 YNL211CYNL211C 261 nt0.43□□□□□ -2.34
AVT2P39981 ASE1YOR058C 2658 nt0.42□□□□□ -2.34
AVT2P39981 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.42□□□□□ -2.34
AVT2P39981 VAR1Q0140 1197 nt0.41□□□□□ -2.34
AVT2P39981 HMRA2YCR096C 360 nt0.4□□□□□ -2.35
AVT2P39981 SSS1YDR086C 243 nt0.4□□□□□ -2.35
AVT2P39981 RPL26BYGR034W 384 nt0.4□□□□□ -2.35
AVT2P39981 TAR1YLR154W-C 375 nt0.4□□□□□ -2.35
AVT2P39981 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.4□□□□□ -2.35
AVT2P39981 RPS25BYLR333C 327 nt0.4□□□□□ -2.35
AVT2P39981 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.4□□□□□ -2.35
AVT2P39981 SPO21YOL091W 1830 nt0.39□□□□□ -2.35
AVT2P39981 YDR048CYDR048C 315 nt0.39□□□□□ -2.35
AVT2P39981 HTB2YBL002W 396 nt0.39□□□□□ -2.35
AVT2P39981 YPL225WYPL225W 441 nt0.39□□□□□ -2.35
AVT2P39981 YJL120WYJL120W 324 nt0.38□□□□□ -2.35
AVT2P39981 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.36□□□□□ -2.35
AVT2P39981 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.36□□□□□ -2.35
AVT2P39981 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.36□□□□□ -2.35
AVT2P39981 BIL1YOR304C-A 231 nt0.36□□□□□ -2.35
AVT2P39981 PAA1YDR071C 576 nt0.35□□□□□ -2.35
AVT2P39981 FYV10YIL097W 1551 nt0.35□□□□□ -2.35
AVT2P39981 YDR157WYDR157W 402 nt0.34□□□□□ -2.36
AVT2P39981 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.34□□□□□ -2.36
AVT2P39981 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.34□□□□□ -2.36
AVT2P39981 IQG1YPL242C 4488 nt0.34□□□□□ -2.36
AVT2P39981 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.33□□□□□ -2.36
AVT2P39981 YGR035CYGR035C 351 nt0.33□□□□□ -2.36
AVT2P39981 COX5BYIL111W 456 nt0.33□□□□□ -2.36
AVT2P39981 ABF2YMR072W 552 nt0.33□□□□□ -2.36
AVT2P39981 BIR1YJR089W 2865 nt0.33□□□□□ -2.36
AVT2P39981 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.32□□□□□ -2.36
AVT2P39981 PRP5YBR237W 2550 nt0.32□□□□□ -2.36
AVT2P39981 COG8YML071C 1824 nt0.31□□□□□ -2.36
AVT2P39981 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.31□□□□□ -2.36
AVT2P39981 SBH1YER087C-B 249 nt0.31□□□□□ -2.36
AVT2P39981 ESP1YGR098C 4893 nt0.31□□□□□ -2.36
AVT2P39981 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.3□□□□□ -2.36
AVT2P39981 snR190snR190 190 nt0.3□□□□□ -2.36
AVT2P39981 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.3□□□□□ -2.36
AVT2P39981 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.29□□□□□ -2.36
AVT2P39981 PET111YMR257C 2403 nt0.29□□□□□ -2.36
AVT2P39981 snR60snR60 104 nt0.28□□□□□ -2.36
AVT2P39981 OST4YDL232W 111 nt0.28□□□□□ -2.36
AVT2P39981 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.28□□□□□ -2.36
AVT2P39981 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.28□□□□□ -2.36
AVT2P39981 YOR345CYOR345C 351 nt0.28□□□□□ -2.36
AVT2P39981 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.27□□□□□ -2.37
AVT2P39981 YAF9YNL107W 681 nt0.27□□□□□ -2.37
AVT2P39981 SEC8YPR055W 3198 nt0.27□□□□□ -2.37
AVT2P39981 RPS27BYHR021C 249 nt0.26□□□□□ -2.37
AVT2P39981 YPR092WYPR092W 306 nt0.26□□□□□ -2.37
AVT2P39981 PRP42YDR235W 1635 nt0.26□□□□□ -2.37
AVT2P39981 MLP2YIL149C 5040 nt0.26□□□□□ -2.37
AVT2P39981 COY1YKL179C 2040 nt0.26□□□□□ -2.37
AVT2P39981 BEM3YPL115C 3387 nt0.26□□□□□ -2.37
AVT2P39981 YKL136WYKL136W 399 nt0.25□□□□□ -2.37
AVT2P39981 ORC3YLL004W 1851 nt0.24□□□□□ -2.37
AVT2P39981 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.24□□□□□ -2.37
AVT2P39981 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.24□□□□□ -2.37
AVT2P39981 VIK1YPL253C 1944 nt0.24□□□□□ -2.37
AVT2P39981 ULI1YFR026C 510 nt0.23□□□□□ -2.37
AVT2P39981 YIL032CYIL032C 357 nt0.23□□□□□ -2.37
AVT2P39981 YLR282CYLR282C 342 nt0.23□□□□□ -2.37
AVT2P39981 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.23□□□□□ -2.37
AVT2P39981 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.23□□□□□ -2.37
AVT2P39981 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.23□□□□□ -2.37
AVT2P39981 YDR102CYDR102C 333 nt0.22□□□□□ -2.37
AVT2P39981 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.22□□□□□ -2.37
AVT2P39981 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.22□□□□□ -2.37
AVT2P39981 HAL9YOL089C 3093 nt0.22□□□□□ -2.37
AVT2P39981 BUL2YML111W 2763 nt0.21□□□□□ -2.38
AVT2P39981 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.21□□□□□ -2.38
AVT2P39981 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.21□□□□□ -2.38
AVT2P39981 CSE2YNR010W 450 nt0.2□□□□□ -2.38
AVT2P39981 YFL019CYFL019C 354 nt0.19□□□□□ -2.38
AVT2P39981 snR36snR36 182 nt0.19□□□□□ -2.38
AVT2P39981 NNF2YGR089W 2811 nt0.19□□□□□ -2.38
AVT2P39981 RPS26AYGL189C 360 nt0.18□□□□□ -2.38
AVT2P39981 YPR197CYPR197C 564 nt0.18□□□□□ -2.38
AVT2P39981 UTP8YGR128C 2142 nt0.17□□□□□ -2.38
AVT2P39981 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.17□□□□□ -2.38
AVT2P39981 HTL1YCR020W-B 237 nt0.16□□□□□ -2.38
AVT2P39981 YNL146WYNL146W 303 nt0.16□□□□□ -2.38
AVT2P39981 YOR015WYOR015W 360 nt0.16□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 94.2 ms