Protein–RNA interactions for Protein: P38722

YHL049C, Uncharacterized protein YHL049C, yeastyeast

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL049CP38722 YAR053WYAR053W 297 nt0.41□□□□□ -2.34
YHL049CP38722 SGF11YPL047W 300 nt0.41□□□□□ -2.34
YHL049CP38722 YPL225WYPL225W 441 nt0.41□□□□□ -2.34
YHL049CP38722 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.4□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.4□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 YJL120WYJL120W 324 nt0.39□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.39□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 HTB2YBL002W 396 nt0.39□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 LEE1YPL054W 906 nt0.39□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.39□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 ULP2YIL031W 3105 nt0.38□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 TAR1YLR154W-C 375 nt0.38□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.38□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 PET111YMR257C 2403 nt0.37□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 COX5BYIL111W 456 nt0.37□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 BIL1YOR304C-A 231 nt0.37□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 MLP1YKR095W 5628 nt0.36□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 BEM3YPL115C 3387 nt0.36□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 RPL35AYDL191W 363 nt0.36□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 SBH1YER087C-B 249 nt0.35□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.35□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 YMR321CYMR321C 318 nt0.35□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 PRP5YBR237W 2550 nt0.34□□□□□ -2.35
YHL049CP38722 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.34□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 Q0144Q0144 330 nt0.34□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 YSP1YHR155W 3687 nt0.34□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.34□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.34□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.34□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 VIK1YPL253C 1944 nt0.34□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 HAL9YOL089C 3093 nt0.34□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt0.33□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 PRP42YDR235W 1635 nt0.32□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 OST4YDL232W 111 nt0.32□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 YGR035CYGR035C 351 nt0.32□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 PAU12YGR294W 363 nt0.32□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.32□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.32□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 snR190snR190 190 nt0.32□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 SSS1YDR086C 243 nt0.31□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.31□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 UTP20YBL004W 7482 nt0.31□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 YDR048CYDR048C 315 nt0.3□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.29□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.29□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.29□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.29□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.29□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.29□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.29□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.29□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 ABF2YMR072W 552 nt0.29□□□□□ -2.36
YHL049CP38722 CSE2YNR010W 450 nt0.27□□□□□ -2.37
YHL049CP38722 YOR345CYOR345C 351 nt0.27□□□□□ -2.37
YHL049CP38722 YDR157WYDR157W 402 nt0.26□□□□□ -2.37
YHL049CP38722 RPS27BYHR021C 249 nt0.26□□□□□ -2.37
YHL049CP38722 COG8YML071C 1824 nt0.26□□□□□ -2.37
YHL049CP38722 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.25□□□□□ -2.37
YHL049CP38722 MLP2YIL149C 5040 nt0.24□□□□□ -2.37
YHL049CP38722 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.24□□□□□ -2.37
YHL049CP38722 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.24□□□□□ -2.37
YHL049CP38722 YKL136WYKL136W 399 nt0.24□□□□□ -2.37
YHL049CP38722 VAR1Q0140 1197 nt0.23□□□□□ -2.37
YHL049CP38722 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.22□□□□□ -2.37
YHL049CP38722 IQG1YPL242C 4488 nt0.22□□□□□ -2.37
YHL049CP38722 NNF2YGR089W 2811 nt0.21□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.21□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 YLR282CYLR282C 342 nt0.21□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 YPR092WYPR092W 306 nt0.21□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 AI1Q0050 2505 nt0.21□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 ORC3YLL004W 1851 nt0.2□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 TRS65YGR166W 1683 nt0.2□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 BIR1YJR089W 2865 nt0.19□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.18□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.18□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 ULI1YFR026C 510 nt0.18□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.18□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 YCR022CYCR022C 345 nt0.17□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 RPS26AYGL189C 360 nt0.17□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 ESP1YGR098C 4893 nt0.17□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 COY1YKL179C 2040 nt0.17□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.17□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 snR60snR60 104 nt0.16□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 YNL146WYNL146W 303 nt0.16□□□□□ -2.38
YHL049CP38722 BLI1YKL061W 342 nt0.15□□□□□ -2.39
YHL049CP38722 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.15□□□□□ -2.39
YHL049CP38722 RCO1YMR075W 2055 nt0.15□□□□□ -2.39
YHL049CP38722 YOL014WYOL014W 375 nt0.14□□□□□ -2.39
YHL049CP38722 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.14□□□□□ -2.39
YHL049CP38722 HTL1YCR020W-B 237 nt0.13□□□□□ -2.39
YHL049CP38722 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.13□□□□□ -2.39
YHL049CP38722 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.13□□□□□ -2.39
YHL049CP38722 NIP1YMR309C 2439 nt0.13□□□□□ -2.39
YHL049CP38722 QCR9YGR183C 201 nt0.12□□□□□ -2.39
YHL049CP38722 YIL032CYIL032C 357 nt0.12□□□□□ -2.39
YHL049CP38722 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.12□□□□□ -2.39
YHL049CP38722 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.11□□□□□ -2.39
YHL049CP38722 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.1□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.8 ms