Protein–RNA interactions for Protein: P27692

SPT5, Transcription elongation factor SPT5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT5P27692 UTP8YGR128C 2142 nt2.57□□□□□ -2
SPT5P27692 TOR2YKL203C 7425 nt2.56□□□□□ -2
SPT5P27692 YPR097WYPR097W 3222 nt2.56□□□□□ -2
SPT5P27692 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.56□□□□□ -2
SPT5P27692 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt2.56□□□□□ -2
SPT5P27692 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.56□□□□□ -2
SPT5P27692 TRM3YDL112W 4311 nt2.55□□□□□ -2
SPT5P27692 TOF1YNL273W 3717 nt2.55□□□□□ -2
SPT5P27692 YLR419WYLR419W 4308 nt2.54□□□□□ -2
SPT5P27692 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt2.54□□□□□ -2
SPT5P27692 YOR055WYOR055W 435 nt2.54□□□□□ -2
SPT5P27692 SEY1YOR165W 2331 nt2.53□□□□□ -2
SPT5P27692 snR39BsnR39B 96 nt2.53□□□□□ -2
SPT5P27692 YOL098CYOL098C 3114 nt2.53□□□□□ -2.01
SPT5P27692 BPH1YCR032W 6504 nt2.52□□□□□ -2.01
SPT5P27692 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.52□□□□□ -2.01
SPT5P27692 NUT1YGL151W 3399 nt2.52□□□□□ -2.01
SPT5P27692 EAF1YDR359C 2949 nt2.52□□□□□ -2.01
SPT5P27692 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.51□□□□□ -2.01
SPT5P27692 COA6YMR244C-A 315 nt2.51□□□□□ -2.01
SPT5P27692 NUP157YER105C 4176 nt2.5□□□□□ -2.01
SPT5P27692 UTP21YLR409C 2820 nt2.5□□□□□ -2.01
SPT5P27692 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.5□□□□□ -2.01
SPT5P27692 YJR039WYJR039W 3366 nt2.49□□□□□ -2.01
SPT5P27692 SEC63YOR254C 1992 nt2.49□□□□□ -2.01
SPT5P27692 RSM22YKL155C 1887 nt2.49□□□□□ -2.01
SPT5P27692 RCO1YMR075W 2055 nt2.49□□□□□ -2.01
SPT5P27692 GCN2YDR283C 4980 nt2.49□□□□□ -2.01
SPT5P27692 DNF1YER166W 4716 nt2.49□□□□□ -2.01
SPT5P27692 SLN1YIL147C 3663 nt2.49□□□□□ -2.01
SPT5P27692 MSH6YDR097C 3729 nt2.48□□□□□ -2.01
SPT5P27692 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt2.48□□□□□ -2.01
SPT5P27692 TDA9YML081W 3756 nt2.48□□□□□ -2.01
SPT5P27692 USO1YDL058W 5373 nt2.48□□□□□ -2.01
SPT5P27692 UBR2YLR024C 5619 nt2.47□□□□□ -2.01
SPT5P27692 TAH1YCR060W 336 nt2.47□□□□□ -2.01
SPT5P27692 COX5BYIL111W 456 nt2.47□□□□□ -2.01
SPT5P27692 ALY2YJL084C 3141 nt2.46□□□□□ -2.01
SPT5P27692 MSB1YOR188W 3414 nt2.45□□□□□ -2.02
SPT5P27692 TBS1YBR150C 3285 nt2.45□□□□□ -2.02
SPT5P27692 CSF1YLR087C 8877 nt2.45□□□□□ -2.02
SPT5P27692 RAD50YNL250W 3939 nt2.45□□□□□ -2.02
SPT5P27692 HER1YOR227W 3741 nt2.44□□□□□ -2.02
SPT5P27692 PAN2YGL094C 3348 nt2.44□□□□□ -2.02
SPT5P27692 YMR045CYMR045C 5268 nt2.42□□□□□ -2.02
SPT5P27692 FKS1YLR342W 5631 nt2.42□□□□□ -2.02
SPT5P27692 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.42□□□□□ -2.02
SPT5P27692 EMC5YIL027C 426 nt2.42□□□□□ -2.02
SPT5P27692 FAB1YFR019W 6837 nt2.41□□□□□ -2.02
SPT5P27692 MYO2YOR326W 4725 nt2.41□□□□□ -2.02
SPT5P27692 MYO4YAL029C 4416 nt2.4□□□□□ -2.03
SPT5P27692 MMS4YBR098W 2076 nt2.4□□□□□ -2.03
SPT5P27692 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.39□□□□□ -2.03
SPT5P27692 YAR009CYAR009C 3591 nt2.39□□□□□ -2.03
SPT5P27692 COG6YNL041C 2520 nt2.37□□□□□ -2.03
SPT5P27692 RTP1YMR185W 2946 nt2.37□□□□□ -2.03
SPT5P27692 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt2.37□□□□□ -2.03
SPT5P27692 GYP5YPL249C 2685 nt2.37□□□□□ -2.03
SPT5P27692 YML002WYML002W 2214 nt2.37□□□□□ -2.03
SPT5P27692 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt2.36□□□□□ -2.03
SPT5P27692 UBP2YOR124C 3819 nt2.36□□□□□ -2.03
SPT5P27692 SLX4YLR135W 2247 nt2.36□□□□□ -2.03
SPT5P27692 KIP1YBL063W 3336 nt2.35□□□□□ -2.03
SPT5P27692 snR14snR14 160 nt2.35□□□□□ -2.03
SPT5P27692 SPP41YDR464W 4308 nt2.35□□□□□ -2.03
SPT5P27692 UTP22YGR090W 3714 nt2.34□□□□□ -2.03
SPT5P27692 SIR4YDR227W 4077 nt2.34□□□□□ -2.03
SPT5P27692 INO80YGL150C 4470 nt2.34□□□□□ -2.04
SPT5P27692 SEC21YNL287W 2808 nt2.33□□□□□ -2.04
SPT5P27692 BRE1YDL074C 2103 nt2.33□□□□□ -2.04
SPT5P27692 SMC1YFL008W 3678 nt2.33□□□□□ -2.04
SPT5P27692 SMC4YLR086W 4257 nt2.32□□□□□ -2.04
SPT5P27692 RGA1YOR127W 3024 nt2.32□□□□□ -2.04
SPT5P27692 snR45snR45 172 nt2.32□□□□□ -2.04
SPT5P27692 snR81snR81 201 nt2.31□□□□□ -2.04
SPT5P27692 YLR041WYLR041W 321 nt2.31□□□□□ -2.04
SPT5P27692 PDR8YLR266C 2106 nt2.31□□□□□ -2.04
SPT5P27692 ATG9YDL149W 2994 nt2.31□□□□□ -2.04
SPT5P27692 FIG2YCR089W 4830 nt2.3□□□□□ -2.04
SPT5P27692 UFD4YKL010C 4452 nt2.3□□□□□ -2.04
SPT5P27692 FYV10YIL097W 1551 nt2.29□□□□□ -2.04
SPT5P27692 DNF3YMR162C 4971 nt2.28□□□□□ -2.04
SPT5P27692 KAP120YPL125W 3099 nt2.28□□□□□ -2.04
SPT5P27692 YDR210WYDR210W 228 nt2.28□□□□□ -2.04
SPT5P27692 YLR232WYLR232W 348 nt2.28□□□□□ -2.04
SPT5P27692 NOP9YJL010C 2001 nt2.28□□□□□ -2.04
SPT5P27692 KCS1YDR017C 3153 nt2.28□□□□□ -2.04
SPT5P27692 SKI3YPR189W 4299 nt2.28□□□□□ -2.05
SPT5P27692 DGR1YNL130C-A 147 nt2.27□□□□□ -2.05
SPT5P27692 TFC3YAL001C 3483 nt2.27□□□□□ -2.05
SPT5P27692 KAP122YGL016W 3246 nt2.26□□□□□ -2.05
SPT5P27692 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt2.25□□□□□ -2.05
SPT5P27692 YOR093CYOR093C 4947 nt2.25□□□□□ -2.05
SPT5P27692 MON2YNL297C 4911 nt2.24□□□□□ -2.05
SPT5P27692 BIR1YJR089W 2865 nt2.24□□□□□ -2.05
SPT5P27692 STO1YMR125W 2586 nt2.23□□□□□ -2.05
SPT5P27692 snR190snR190 190 nt2.23□□□□□ -2.05
SPT5P27692 MGA2YIR033W 3342 nt2.22□□□□□ -2.05
SPT5P27692 SET3YKR029C 2256 nt2.22□□□□□ -2.05
SPT5P27692 SAC3YDR159W 3906 nt2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 92.4 ms