Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.6 ms