Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAD1O00515 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAD1O00515 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAD1O00515 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAD1O00515 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAD1O00515 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAD1O00515 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LAD1O00515 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAD1O00515 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAD1O00515 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAD1O00515 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAD1O00515 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAD1O00515 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAD1O00515 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LAD1O00515 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAD1O00515 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAD1O00515 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAD1O00515 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAD1O00515 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAD1O00515 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAD1O00515 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAD1O00515 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAD1O00515 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LAD1O00515 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAD1O00515 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAD1O00515 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAD1O00515 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAD1O00515 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAD1O00515 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAD1O00515 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAD1O00515 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms