Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1CQ15572 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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