Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

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Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.48□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 PAU2YEL049W 363 nt1.48□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 INA22YIR024C 651 nt1.48□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 YNL028WYNL028W 318 nt1.47□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 CSE2YNR010W 450 nt1.47□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 MAD1YGL086W 2250 nt1.47□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 POL5YEL055C 3069 nt1.47□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 YCK3YER123W 1575 nt1.47□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 MSN5YDR335W 3675 nt1.46□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 EST2YLR318W 2655 nt1.46□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 NUT1YGL151W 3399 nt1.46□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.46□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 YLR140WYLR140W 327 nt1.46□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 snR49snR49 165 nt1.46□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 RAD34YDR314C 2079 nt1.46□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 RPL34BYIL052C 366 nt1.45□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 YOR376WYOR376W 369 nt1.45□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 YGR130CYGR130C 2451 nt1.44□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.44□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 YBR064WYBR064W 429 nt1.44□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 YLR419WYLR419W 4308 nt1.44□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 CLU1YMR012W 3834 nt1.43□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 IRA1YBR140C 9279 nt1.43□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.43□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 YBR174CYBR174C 315 nt1.43□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 LAA1YJL207C 6045 nt1.43□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 NOC3YLR002C 1992 nt1.42□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 snR80snR80 171 nt1.42□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 YGL041CYGL041C 204 nt1.42□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.42□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 YOR015WYOR015W 360 nt1.42□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 PDE2YOR360C 1581 nt1.42□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.41□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.41□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.41□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.41□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.41□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.41□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.41□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 YGL052WYGL052W 306 nt1.41□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 YGL217CYGL217C 342 nt1.41□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.41□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.41□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 NUP145YGL092W 3954 nt1.41□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 SEC5YDR166C 2916 nt1.41□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 RAD50YNL250W 3939 nt1.41□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 SMC4YLR086W 4257 nt1.4□□□□□ -2.18
CTF3Q12748 VPS54YDR027C 2670 nt1.4□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.4□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 TRM732YMR259C 4263 nt1.4□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 CCH1YGR217W 6120 nt1.39□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 CUL3YGR003W 2235 nt1.39□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 RPS27BYHR021C 249 nt1.39□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 YIR044CYIR044C 186 nt1.39□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 ABF2YMR072W 552 nt1.39□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.39□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 YMR321CYMR321C 318 nt1.39□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 YOR218CYOR218C 420 nt1.39□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 SLX4YLR135W 2247 nt1.39□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 SPO75YLL005C 2607 nt1.38□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 YLL054CYLL054C 2532 nt1.38□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 SLI15YBR156C 2097 nt1.38□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 CDC25YLR310C 4770 nt1.38□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 AZF1YOR113W 2745 nt1.38□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 snR55snR55 98 nt1.38□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 IES4YOR189W 351 nt1.38□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 COG4YPR105C 2586 nt1.38□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 SPO21YOL091W 1830 nt1.38□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 YLL007CYLL007C 1998 nt1.38□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.37□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 RPS25BYLR333C 327 nt1.37□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 HKR1YDR420W 5409 nt1.37□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 PKH2YOL100W 3246 nt1.36□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 PTP2YOR208W 2253 nt1.36□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 YJL120WYJL120W 324 nt1.36□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 PET127YOR017W 2403 nt1.36□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 SWI4YER111C 3282 nt1.35□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 CDC36YDL165W 576 nt1.35□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.35□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.35□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 YPR092WYPR092W 306 nt1.35□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 IML1YJR138W 4755 nt1.34□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 SEC21YNL287W 2808 nt1.34□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 SPG3YDR504C 384 nt1.34□□□□□ -2.19
CTF3Q12748 BUD3YCL014W 4911 nt1.33□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 RRT15YLR162W-A 189 nt1.33□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 FYV8YGR196C 2454 nt1.33□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 PBY1YBR094W 2262 nt1.33□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 ALY2YJL084C 3141 nt1.33□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 NPR2YEL062W 1848 nt1.32□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 RSM22YKL155C 1887 nt1.31□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 YDR521WYDR521W 336 nt1.31□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 GPG1YGL121C 381 nt1.31□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 JLP2YMR132C 627 nt1.31□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 snR14snR14 160 nt1.31□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 MCM10YIL150C 1716 nt1.31□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 SEC3YER008C 4011 nt1.31□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 snR74snR74 88 nt1.3□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.3□□□□□ -2.2
CTF3Q12748 TTI1YKL033W 3117 nt1.3□□□□□ -2.2
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