Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 CYR1YJL005W 6081 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 ILS1YBL076C 3219 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 PAU11YGL261C 363 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 MSB2YGR014W 3921 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 YEF3YLR249W 3135 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 ESC1YMR219W 4977 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 COX5BYIL111W 456 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 COP1YDL145C 3606 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 TRL1YJL087C 2484 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 IES6YEL044W 501 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 AXL1YPR122W 3627 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 KAP120YPL125W 3099 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 TRA1YHR099W 11235 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 AKR1YDR264C 2295 nt2.4□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 SLX4YLR135W 2247 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 SYH1YPL105C 2550 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 UBR1YGR184C 5853 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 SEC1YDR164C 2175 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 PDR8YLR266C 2106 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 EAF1YDR359C 2949 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YML002WYML002W 2214 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 SMC1YFL008W 3678 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 RPS29AYLR388W 171 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 MDS3YGL197W 4464 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 SGM1YJR134C 2124 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YDR210WYDR210W 228 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YER138CYER138C 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YER160CYER160C 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YJR027WYJR027W 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YML039WYML039W 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YML045WYML045W 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YMR050CYMR050C 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 TRM3YDL112W 4311 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YIL169CYIL169C 2988 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 RPA190YOR341W 4995 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 COA6YMR244C-A 315 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 SET3YKR029C 2256 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 GEA1YJR031C 4227 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 COG6YNL041C 2520 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 STE6YKL209C 3873 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 FAR11YNL127W 2862 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 YLR232WYLR232W 348 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1A-DR3Q12441 CHC1YGL206C 4962 nt2.34□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 SEC21YNL287W 2808 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 GIP3YPL137C 3831 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 RTP1YMR185W 2946 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 POL5YEL055C 3069 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 ESL2YKR096W 3588 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 YJR039WYJR039W 3366 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 SEY1YOR165W 2331 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 TCB2YNL087W 3537 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 TOF1YNL273W 3717 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 SFB2YNL049C 2631 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 SPO24YPR036W-A 204 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 NUM1YDR150W 8247 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 SSD1YDR293C 3753 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 TOP2YNL088W 4287 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 RTT107YHR154W 3213 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 GYP5YPL249C 2685 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1A-DR3Q12441 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 RTT101YJL047C 2529 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 MYO2YOR326W 4725 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 MMS4YBR098W 2076 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 UFD4YKL010C 4452 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 FYV10YIL097W 1551 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1A-DR3Q12441 ARP8YOR141C 2646 nt2.25□□□□□ -2.05
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