Protein–RNA interactions for Protein: Q12407

YDL199C, Putative metabolite transport protein YDL199C, yeastyeast

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL199CQ12407 YCS4YLR272C 3531 nt1.12□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 YIR044CYIR044C 186 nt1.12□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.12□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 snR36snR36 182 nt1.12□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 SWI4YER111C 3282 nt1.12□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 PKH2YOL100W 3246 nt1.11□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 CUL3YGR003W 2235 nt1.11□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 YJR011CYJR011C 786 nt1.11□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 YKL118WYKL118W 312 nt1.11□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 YKL136WYKL136W 399 nt1.11□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 OST1YJL002C 1431 nt1.11□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 NST1YNL091W 3723 nt1.11□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 ALY2YJL084C 3141 nt1.11□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 NHP2YDL208W 471 nt1.1□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 RPL34BYIL052C 366 nt1.1□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 YLL020CYLL020C 306 nt1.1□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 RRT15YLR162W-A 189 nt1.1□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 MMS4YBR098W 2076 nt1.1□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 FIG4YNL325C 2640 nt1.1□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.09□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 GPG1YGL121C 381 nt1.09□□□□□ -2.23
YDL199CQ12407 IFH1YLR223C 3258 nt1.09□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 SLD3YGL113W 2007 nt1.08□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.08□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 YDR413CYDR413C 576 nt1.08□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 YFL032WYFL032W 321 nt1.08□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.08□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 YLL007CYLL007C 1998 nt1.08□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 APL3YBL037W 3078 nt1.08□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 YCK3YER123W 1575 nt1.08□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 YDL206WYDL206W 2289 nt1.08□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 SET3YKR029C 2256 nt1.08□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 RAD9YDR217C 3930 nt1.07□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 YPR063CYPR063C 423 nt1.07□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 DBP6YNR038W 1890 nt1.07□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 PTP2YOR208W 2253 nt1.06□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 STO1YMR125W 2586 nt1.06□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 YER097WYER097W 330 nt1.06□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 SPO75YLL005C 2607 nt1.06□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 NUP145YGL092W 3954 nt1.05□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 BEM2YER155C 6504 nt1.05□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 HTL1YCR020W-B 237 nt1.05□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 SSS1YDR086C 243 nt1.05□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 PDE2YOR360C 1581 nt1.04□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 YLR422WYLR422W 5799 nt1.04□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 YDR521WYDR521W 336 nt1.04□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 YFL063WYFL063W 456 nt1.04□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 SPT7YBR081C 3999 nt1.04□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 EAF1YDR359C 2949 nt1.03□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 HMRA2YCR096C 360 nt1.03□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 YGL149WYGL149W 306 nt1.03□□□□□ -2.24
YDL199CQ12407 YAR009CYAR009C 3591 nt1.03□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 SEC3YER008C 4011 nt1.03□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 SIP4YJL089W 2490 nt1.03□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 PAN2YGL094C 3348 nt1.02□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 VAM6YDL077C 3150 nt1.02□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.02□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 RPL39YJL189W 156 nt1.02□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 STB6YKL072W 2301 nt1.02□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 ROM2YLR371W 4071 nt1.02□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.02□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.02□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 YBR206WYBR206W 324 nt1.02□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 CDC39YCR093W 6327 nt1.02□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 YIL032CYIL032C 357 nt1.01□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 RPS25BYLR333C 327 nt1.01□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 STE5YDR103W 2754 nt1.01□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 APL1YJR005W 2103 nt1□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 snR60snR60 104 nt1□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 YDR344CYDR344C 444 nt1□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 WAR1YML076C 2835 nt0.99□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 YJL120WYJL120W 324 nt0.99□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 YJR029WYJR029W 5268 nt0.99□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.99□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 INA22YIR024C 651 nt0.98□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 SPO21YOL091W 1830 nt0.98□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 IML1YJR138W 4755 nt0.98□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 YBR064WYBR064W 429 nt0.97□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 SCC2YDR180W 4482 nt0.97□□□□□ -2.25
YDL199CQ12407 VIK1YPL253C 1944 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 ALG13YGL047W 609 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 YHL042WYHL042W 453 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 ANS1YHR126C 480 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 YMR321CYMR321C 318 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 NUP157YER105C 4176 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 SMC1YFL008W 3678 nt0.95□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 COG8YML071C 1824 nt0.95□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 GEA2YEL022W 4380 nt0.95□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 ECM12YHR021W-A 456 nt0.95□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.95□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 YGR130CYGR130C 2451 nt0.95□□□□□ -2.26
YDL199CQ12407 CLU1YMR012W 3834 nt0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54 ms