Protein–RNA interactions for Protein: Q12402

YOP1, Protein YOP1, yeastyeast

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOP1Q12402 SEC3YER008C 4011 nt1.07□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 TAR1YLR154W-C 375 nt1.07□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.07□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 LAA1YJL207C 6045 nt1.06□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 VAM6YDL077C 3150 nt1.06□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.06□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 YLL007CYLL007C 1998 nt1.06□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 OST1YJL002C 1431 nt1.06□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 TRM3YDL112W 4311 nt1.06□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 YLR422WYLR422W 5799 nt1.05□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 YAR009CYAR009C 3591 nt1.05□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 FIG2YCR089W 4830 nt1.05□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 PAN2YGL094C 3348 nt1.05□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.05□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 YDR048CYDR048C 315 nt1.05□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 YDR102CYDR102C 333 nt1.05□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 YDR521WYDR521W 336 nt1.05□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 APL1YJR005W 2103 nt1.05□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 PTP2YOR208W 2253 nt1.04□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 YCK3YER123W 1575 nt1.04□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 CDC25YLR310C 4770 nt1.03□□□□□ -2.24
YOP1Q12402 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.02□□□□□ -2.25
YOP1Q12402 RPL33BYOR234C 324 nt1.02□□□□□ -2.25
YOP1Q12402 YBR206WYBR206W 324 nt1.02□□□□□ -2.25
YOP1Q12402 WAR1YML076C 2835 nt1.01□□□□□ -2.25
YOP1Q12402 NUP157YER105C 4176 nt1.01□□□□□ -2.25
YOP1Q12402 ATP6Q0085 780 nt1.01□□□□□ -2.25
YOP1Q12402 CLU1YMR012W 3834 nt1.01□□□□□ -2.25
YOP1Q12402 HMRA2YCR096C 360 nt1□□□□□ -2.25
YOP1Q12402 YHL042WYHL042W 453 nt1□□□□□ -2.25
YOP1Q12402 CDC31YOR257W 486 nt1□□□□□ -2.25
YOP1Q12402 YPL225WYPL225W 441 nt1□□□□□ -2.25
YOP1Q12402 SPO75YLL005C 2607 nt0.99□□□□□ -2.25
YOP1Q12402 SSS1YDR086C 243 nt0.98□□□□□ -2.25
YOP1Q12402 YBR064WYBR064W 429 nt0.98□□□□□ -2.25
YOP1Q12402 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.97□□□□□ -2.25
YOP1Q12402 YJL120WYJL120W 324 nt0.97□□□□□ -2.25
YOP1Q12402 snR36snR36 182 nt0.97□□□□□ -2.25
YOP1Q12402 ROM2YLR371W 4071 nt0.96□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 HTL1YCR020W-B 237 nt0.96□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.96□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 RPS25BYLR333C 327 nt0.96□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 GEA2YEL022W 4380 nt0.95□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 DBP6YNR038W 1890 nt0.95□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.95□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 SCC2YDR180W 4482 nt0.94□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 SPT7YBR081C 3999 nt0.94□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 SPO21YOL091W 1830 nt0.94□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 NHP2YDL208W 471 nt0.93□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 YFL032WYFL032W 321 nt0.93□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 YKL118WYKL118W 312 nt0.93□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.93□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 YPP1YGR198W 2454 nt0.93□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 DOP1YDR141C 5097 nt0.93□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 BEM2YER155C 6504 nt0.92□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt0.92□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 YDR344CYDR344C 444 nt0.92□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt0.92□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 MSH3YCR092C 3057 nt0.92□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 SMC1YFL008W 3678 nt0.92□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 YDL196WYDL196W 330 nt0.91□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 YDR413CYDR413C 576 nt0.91□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 YFL063WYFL063W 456 nt0.91□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 OLI1Q0130 231 nt0.91□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 ECM12YHR021W-A 456 nt0.91□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 INA22YIR024C 651 nt0.91□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 YKL136WYKL136W 399 nt0.91□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 YMR321CYMR321C 318 nt0.91□□□□□ -2.26
YOP1Q12402 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.9□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.9□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.9□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.9□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.9□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.9□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.9□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 YER097WYER097W 330 nt0.9□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 YIL032CYIL032C 357 nt0.9□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 KAP120YPL125W 3099 nt0.9□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 MCM10YIL150C 1716 nt0.89□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 snR60snR60 104 nt0.89□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.89□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 YCL023CYCL023C 348 nt0.89□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 COG8YML071C 1824 nt0.89□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 REV3YPL167C 4515 nt0.88□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 ISD11YER048W-A 285 nt0.88□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 YGL149WYGL149W 306 nt0.88□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 NUP192YJL039C 5052 nt0.87□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 VIK1YPL253C 1944 nt0.87□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 RPS27BYHR021C 249 nt0.86□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 ALG13YGL047W 609 nt0.85□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 NOP9YJL010C 2001 nt0.85□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 RPL39YJL189W 156 nt0.85□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 CMC4YMR194C-B 222 nt0.85□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt0.85□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 YPL044CYPL044C 549 nt0.85□□□□□ -2.27
YOP1Q12402 SGF11YPL047W 300 nt0.85□□□□□ -2.27
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