Protein–RNA interactions for Protein: Q12220

DIP2, U3 small nucleolar RNA-associated protein 12, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 943 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DIP2Q12220 RPO31YOR116C 4383 nt4.25□□□□□ -1.73
DIP2Q12220 MDS3YGL197W 4464 nt4.25□□□□□ -1.73
DIP2Q12220 MRD1YPR112C 2664 nt4.25□□□□□ -1.73
DIP2Q12220 SPO71YDR104C 3738 nt4.24□□□□□ -1.73
DIP2Q12220 OSH3YHR073W 2991 nt4.24□□□□□ -1.73
DIP2Q12220 CTR9YOL145C 3234 nt4.21□□□□□ -1.73
DIP2Q12220 AMS1YGL156W 3252 nt4.21□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 YLR041WYLR041W 321 nt4.21□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 MYO2YOR326W 4725 nt4.21□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 AKR1YDR264C 2295 nt4.21□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 SWH1YAR042W 3567 nt4.21□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 RPB2YOR151C 3675 nt4.2□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 NOP9YJL010C 2001 nt4.2□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 NMD2YHR077C 3270 nt4.2□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt4.19□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt4.19□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt4.19□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 NUP100YKL068W 2880 nt4.19□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 YER172C-AYER172C-A 381 nt4.19□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 SEC21YNL287W 2808 nt4.19□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 NCR1YPL006W 3513 nt4.18□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 RAD26YJR035W 3258 nt4.17□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 MBB1YJL199C 327 nt4.17□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 ALY2YJL084C 3141 nt4.16□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt4.16□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 SEY1YOR165W 2331 nt4.16□□□□□ -1.74
DIP2Q12220 LCL1YPL056C 306 nt4.15□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 RAX2YLR084C 3663 nt4.15□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 TAF1YGR274C 3201 nt4.15□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 NAB6YML117W 3405 nt4.14□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 TRS130YMR218C 3309 nt4.13□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 RSE1YML049C 4086 nt4.13□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt4.13□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 COA6YMR244C-A 315 nt4.13□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 PDR3YBL005W 2931 nt4.12□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 SLN1YIL147C 3663 nt4.12□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 ROM2YLR371W 4071 nt4.12□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 YPR097WYPR097W 3222 nt4.11□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt4.11□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt4.11□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 TIM9YEL020W-A 264 nt4.11□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 SEC10YLR166C 2616 nt4.11□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 SSD1YDR293C 3753 nt4.11□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 SPT6YGR116W 4356 nt4.1□□□□□ -1.75
DIP2Q12220 PAN2YGL094C 3348 nt4.09□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 YKL225WYKL225W 348 nt4.08□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 MMS4YBR098W 2076 nt4.07□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 BMS1YPL217C 3552 nt4.07□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 POL3YDL102W 3294 nt4.07□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 RPN1YHR027C 2982 nt4.07□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 UBP3YER151C 2739 nt4.06□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 TAO3YIL129C 7131 nt4.06□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt4.06□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt4.06□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt4.06□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt4.06□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt4.06□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt4.06□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt4.06□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 RPS29AYLR388W 171 nt4.06□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 TDA9YML081W 3756 nt4.06□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 IRE1YHR079C 3348 nt4.05□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 ARO1YDR127W 4767 nt4.05□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 RGA1YOR127W 3024 nt4.04□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 UFD4YKL010C 4452 nt4.04□□□□□ -1.76
DIP2Q12220 RPS21AYKR057W 264 nt4.02□□□□□ -1.77
DIP2Q12220 WAR1YML076C 2835 nt4□□□□□ -1.77
DIP2Q12220 YDL073WYDL073W 2955 nt3.99□□□□□ -1.77
DIP2Q12220 FLO1YAR050W 4614 nt3.99□□□□□ -1.77
DIP2Q12220 TRL1YJL087C 2484 nt3.99□□□□□ -1.77
DIP2Q12220 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.98□□□□□ -1.77
DIP2Q12220 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.98□□□□□ -1.77
DIP2Q12220 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt3.98□□□□□ -1.77
DIP2Q12220 TRS120YDR407C 3870 nt3.97□□□□□ -1.77
DIP2Q12220 TOF1YNL273W 3717 nt3.96□□□□□ -1.78
DIP2Q12220 SYH1YPL105C 2550 nt3.96□□□□□ -1.78
DIP2Q12220 NUT1YGL151W 3399 nt3.96□□□□□ -1.78
DIP2Q12220 PET309YLR067C 2898 nt3.95□□□□□ -1.78
DIP2Q12220 SPO24YPR036W-A 204 nt3.95□□□□□ -1.78
DIP2Q12220 NUP157YER105C 4176 nt3.95□□□□□ -1.78
DIP2Q12220 TCB2YNL087W 3537 nt3.94□□□□□ -1.78
DIP2Q12220 SMC1YFL008W 3678 nt3.94□□□□□ -1.78
DIP2Q12220 CSR2YPR030W 3366 nt3.93□□□□□ -1.78
DIP2Q12220 AZF1YOR113W 2745 nt3.93□□□□□ -1.78
DIP2Q12220 RPL26BYGR034W 384 nt3.93□□□□□ -1.78
DIP2Q12220 YEF3YLR249W 3135 nt3.91□□□□□ -1.78
DIP2Q12220 RRP5YMR229C 5190 nt3.91□□□□□ -1.78
DIP2Q12220 ESL1YIL151C 3357 nt3.91□□□□□ -1.78
DIP2Q12220 GYP5YPL249C 2685 nt3.91□□□□□ -1.78
DIP2Q12220 SFB2YNL049C 2631 nt3.9□□□□□ -1.79
DIP2Q12220 YOR296WYOR296W 3870 nt3.89□□□□□ -1.79
DIP2Q12220 STU1YBL034C 4542 nt3.87□□□□□ -1.79
DIP2Q12220 ILS1YBL076C 3219 nt3.87□□□□□ -1.79
DIP2Q12220 URA2YJL130C 6645 nt3.87□□□□□ -1.79
DIP2Q12220 snR190snR190 190 nt3.84□□□□□ -1.79
DIP2Q12220 YAR009CYAR009C 3591 nt3.84□□□□□ -1.8
DIP2Q12220 UBR1YGR184C 5853 nt3.84□□□□□ -1.8
DIP2Q12220 STT4YLR305C 5703 nt3.82□□□□□ -1.8
DIP2Q12220 GEA1YJR031C 4227 nt3.82□□□□□ -1.8
DIP2Q12220 CHS1YNL192W 3396 nt3.81□□□□□ -1.8
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