Protein–RNA interactions for Protein: Q12116

TMS1, Membrane protein TMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMS1Q12116 MPT5YGL178W 2580 nt1.41□□□□□ -2.18
TMS1Q12116 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.41□□□□□ -2.18
TMS1Q12116 MON2YNL297C 4911 nt1.41□□□□□ -2.18
TMS1Q12116 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.4□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 PAU2YEL049W 363 nt1.4□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.4□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 RPL34BYIL052C 366 nt1.4□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 PFD1YJL179W 330 nt1.4□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.4□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.4□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.4□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 YMR321CYMR321C 318 nt1.4□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 YOR015WYOR015W 360 nt1.4□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 YOR218CYOR218C 420 nt1.4□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 PIG1YLR273C 1947 nt1.4□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 MAD1YGL086W 2250 nt1.4□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 APL2YKL135C 2181 nt1.4□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 RAD34YDR314C 2079 nt1.39□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 NIP100YPL174C 2607 nt1.39□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 BLI1YKL061W 342 nt1.39□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 VPS54YDR027C 2670 nt1.38□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 SPC110YDR356W 2835 nt1.38□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.38□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 RPS27BYHR021C 249 nt1.38□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 YBR174CYBR174C 315 nt1.38□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 YLR419WYLR419W 4308 nt1.38□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 CCH1YGR217W 6120 nt1.38□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 ENV11YGR071C 2583 nt1.38□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 YCS4YLR272C 3531 nt1.37□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 GPG1YGL121C 381 nt1.37□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 IES4YOR189W 351 nt1.37□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 YPR092WYPR092W 306 nt1.37□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 YLL007CYLL007C 1998 nt1.36□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 SEC5YDR166C 2916 nt1.36□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.36□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 POL5YEL055C 3069 nt1.36□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 CUL3YGR003W 2235 nt1.35□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 PET127YOR017W 2403 nt1.35□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.35□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.35□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.35□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 NOC3YLR002C 1992 nt1.35□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 NPR2YEL062W 1848 nt1.35□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 BST1YFL025C 3090 nt1.34□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 EMC5YIL027C 426 nt1.34□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 RPS25BYLR333C 327 nt1.34□□□□□ -2.19
TMS1Q12116 CLU1YMR012W 3834 nt1.33□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 RAD50YNL250W 3939 nt1.33□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 LAA1YJL207C 6045 nt1.33□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 MCM10YIL150C 1716 nt1.33□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 YIR044CYIR044C 186 nt1.33□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 YNL337WYNL337W 255 nt1.33□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 PTP2YOR208W 2253 nt1.32□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 PIK1YNL267W 3201 nt1.32□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 PKH2YOL100W 3246 nt1.32□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 SPO21YOL091W 1830 nt1.32□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.32□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 VPS55YJR044C 423 nt1.32□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 KAP122YGL016W 3246 nt1.32□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 SLI15YBR156C 2097 nt1.31□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 COG4YPR105C 2586 nt1.31□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 MSN5YDR335W 3675 nt1.31□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.31□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 SPO75YLL005C 2607 nt1.31□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 PBY1YBR094W 2262 nt1.31□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 IML1YJR138W 4755 nt1.31□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 SMC4YLR086W 4257 nt1.3□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 snR74snR74 88 nt1.3□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 PAU12YGR294W 363 nt1.3□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 YJL022WYJL022W 309 nt1.3□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.3□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 YOR302WYOR302W 78 nt1.3□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 PAU24YBR301W 363 nt1.3□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 SEC21YNL287W 2808 nt1.3□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 FYV8YGR196C 2454 nt1.3□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 HKR1YDR420W 5409 nt1.29□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 NCA2YPR155C 1851 nt1.29□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 YJL120WYJL120W 324 nt1.29□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 COF1YLL050C 432 nt1.29□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 RRT15YLR162W-A 189 nt1.29□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 ALK1YGL021W 2283 nt1.28□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 APQ12YIL040W 417 nt1.28□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 YLR140WYLR140W 327 nt1.28□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.28□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.28□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 UFD2YDL190C 2886 nt1.28□□□□□ -2.2
TMS1Q12116 SGF11YPL047W 300 nt1.27□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 NUT1YGL151W 3399 nt1.27□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 YKU70YMR284W 1809 nt1.26□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 YGL217CYGL217C 342 nt1.26□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 PAM16YJL104W 450 nt1.26□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 EST2YLR318W 2655 nt1.26□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 SLX4YLR135W 2247 nt1.25□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.25□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 YEL014CYEL014C 306 nt1.25□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.25□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.25□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.25□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.25□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.4 ms