Protein–RNA interactions for Protein: Q12025

YDR056C, Uncharacterized protein YDR056C, yeastyeast

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDR056CQ12025 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.34□□□□□ -2.19
YDR056CQ12025 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.34□□□□□ -2.19
YDR056CQ12025 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.34□□□□□ -2.19
YDR056CQ12025 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.34□□□□□ -2.19
YDR056CQ12025 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.34□□□□□ -2.19
YDR056CQ12025 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.34□□□□□ -2.19
YDR056CQ12025 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.34□□□□□ -2.19
YDR056CQ12025 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.34□□□□□ -2.19
YDR056CQ12025 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.34□□□□□ -2.19
YDR056CQ12025 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.34□□□□□ -2.19
YDR056CQ12025 PBY1YBR094W 2262 nt1.34□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.33□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 RPL34BYIL052C 366 nt1.33□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 EAF1YDR359C 2949 nt1.33□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 FYV8YGR196C 2454 nt1.33□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 TRM732YMR259C 4263 nt1.32□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 HMRA2YCR096C 360 nt1.32□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 GIM4YEL003W 336 nt1.32□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 YAR029WYAR029W 225 nt1.32□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 TAR1YLR154W-C 375 nt1.32□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 CDC36YDL165W 576 nt1.31□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 YJR011CYJR011C 786 nt1.3□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 STB6YKL072W 2301 nt1.3□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 YAR009CYAR009C 3591 nt1.3□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 NUP157YER105C 4176 nt1.29□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.29□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 WAR1YML076C 2835 nt1.28□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.28□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 SLD3YGL113W 2007 nt1.28□□□□□ -2.2
YDR056CQ12025 YCK3YER123W 1575 nt1.26□□□□□ -2.21
YDR056CQ12025 YDR521WYDR521W 336 nt1.26□□□□□ -2.21
YDR056CQ12025 SMC1YFL008W 3678 nt1.26□□□□□ -2.21
YDR056CQ12025 MDS3YGL197W 4464 nt1.26□□□□□ -2.21
YDR056CQ12025 NST1YNL091W 3723 nt1.26□□□□□ -2.21
YDR056CQ12025 YHL042WYHL042W 453 nt1.25□□□□□ -2.21
YDR056CQ12025 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.25□□□□□ -2.21
YDR056CQ12025 YDR048CYDR048C 315 nt1.24□□□□□ -2.21
YDR056CQ12025 YDR102CYDR102C 333 nt1.23□□□□□ -2.21
YDR056CQ12025 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.23□□□□□ -2.21
YDR056CQ12025 YAF9YNL107W 681 nt1.22□□□□□ -2.21
YDR056CQ12025 RPL33BYOR234C 324 nt1.22□□□□□ -2.21
YDR056CQ12025 SPO75YLL005C 2607 nt1.2□□□□□ -2.22
YDR056CQ12025 AHC1YOR023C 1701 nt1.2□□□□□ -2.22
YDR056CQ12025 YGR130CYGR130C 2451 nt1.2□□□□□ -2.22
YDR056CQ12025 CDC39YCR093W 6327 nt1.19□□□□□ -2.22
YDR056CQ12025 HTL1YCR020W-B 237 nt1.19□□□□□ -2.22
YDR056CQ12025 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.19□□□□□ -2.22
YDR056CQ12025 RPS25BYLR333C 327 nt1.19□□□□□ -2.22
YDR056CQ12025 YMR321CYMR321C 318 nt1.19□□□□□ -2.22
YDR056CQ12025 TTI1YKL033W 3117 nt1.18□□□□□ -2.22
YDR056CQ12025 IML1YJR138W 4755 nt1.18□□□□□ -2.22
YDR056CQ12025 ISD11YER048W-A 285 nt1.17□□□□□ -2.22
YDR056CQ12025 YBR206WYBR206W 324 nt1.17□□□□□ -2.22
YDR056CQ12025 ATP6Q0085 780 nt1.16□□□□□ -2.22
YDR056CQ12025 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.16□□□□□ -2.22
YDR056CQ12025 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.16□□□□□ -2.22
YDR056CQ12025 APL1YJR005W 2103 nt1.15□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 YJL120WYJL120W 324 nt1.14□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 YKL118WYKL118W 312 nt1.14□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 YKL136WYKL136W 399 nt1.14□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 YOR282WYOR282W 321 nt1.14□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 snR36snR36 182 nt1.14□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 SPO21YOL091W 1830 nt1.14□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 SPT7YBR081C 3999 nt1.13□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 YGL149WYGL149W 306 nt1.13□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 RPL39YJL189W 156 nt1.13□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.13□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 DBP6YNR038W 1890 nt1.12□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 PAA1YDR071C 576 nt1.12□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 SSS1YDR086C 243 nt1.12□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 OLI1Q0130 231 nt1.12□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 YBR064WYBR064W 429 nt1.12□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 KAP120YPL125W 3099 nt1.12□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 SCC2YDR180W 4482 nt1.12□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.12□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 YPL044CYPL044C 549 nt1.11□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 SIP4YJL089W 2490 nt1.1□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 CSE2YNR010W 450 nt1.1□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 YOR218CYOR218C 420 nt1.1□□□□□ -2.23
YDR056CQ12025 ALG13YGL047W 609 nt1.08□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 RPS27BYHR021C 249 nt1.08□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 YIL032CYIL032C 357 nt1.08□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 NOP9YJL010C 2001 nt1.07□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 YDL196WYDL196W 330 nt1.07□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 NHP2YDL208W 471 nt1.07□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 YFL063WYFL063W 456 nt1.07□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.07□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 YPL225WYPL225W 441 nt1.07□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 GEA2YEL022W 4380 nt1.07□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt1.06□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 YFL032WYFL032W 321 nt1.06□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.06□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 IES4YOR189W 351 nt1.06□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 ECM12YHR021W-A 456 nt1.05□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 VIK1YPL253C 1944 nt1.05□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 YPR117WYPR117W 7470 nt1.05□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 snR60snR60 104 nt1.04□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 YDR413CYDR413C 576 nt1.04□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 CMC4YMR194C-B 222 nt1.04□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 YDR344CYDR344C 444 nt1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.8 ms