Protein–RNA interactions for Protein: Q06629

HDA2, HDA1 complex subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA2Q06629 PTP2YOR208W 2253 nt2.45□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 RCO1YMR075W 2055 nt2.45□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.45□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 KTI11YBL071W-A 249 nt2.45□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 BNR1YIL159W 4128 nt2.45□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 AXL1YPR122W 3627 nt2.45□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 IRA2YOL081W 9240 nt2.44□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 HMI1YOL095C 2121 nt2.44□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 YPL150WYPL150W 2706 nt2.43□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 BUD2YKL092C 3315 nt2.43□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 DNA2YHR164C 4569 nt2.43□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 snR70snR70 164 nt2.43□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 RPS30BYOR182C 192 nt2.43□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 GIP3YPL137C 3831 nt2.43□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 DGR2YKL121W 2559 nt2.43□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 SYH1YPL105C 2550 nt2.43□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 PIP2YOR363C 2991 nt2.43□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 snR81snR81 201 nt2.42□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 MSH5YDL154W 2706 nt2.42□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 ATG11YPR049C 3537 nt2.41□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 RTT107YHR154W 3213 nt2.41□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 CTR9YOL145C 3234 nt2.41□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 PHO91YNR013C 2685 nt2.41□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 PSD2YGR170W 3417 nt2.4□□□□□ -2.02
HDA2Q06629 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt2.4□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.4□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.4□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.4□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.4□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.4□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.4□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.4□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.4□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 RAV1YJR033C 4074 nt2.4□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 IRE1YHR079C 3348 nt2.4□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.4□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 AGC1YPR021C 2709 nt2.39□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 RPL37BYDR500C 267 nt2.39□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.39□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 CHS6YJL099W 2241 nt2.39□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 UBP1YDL122W 2430 nt2.39□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 RTT101YJL047C 2529 nt2.38□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 SLX4YLR135W 2247 nt2.38□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 TIM9YEL020W-A 264 nt2.37□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 STF2YGR008C 255 nt2.37□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 SBE22YHR103W 2559 nt2.37□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 SLD3YGL113W 2007 nt2.36□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 SSD1YDR293C 3753 nt2.36□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 YLL054CYLL054C 2532 nt2.36□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 MLH1YMR167W 2310 nt2.36□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 PRP5YBR237W 2550 nt2.36□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 SEC63YOR254C 1992 nt2.36□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 PDR1YGL013C 3207 nt2.36□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt2.35□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 FRK1YPL141C 2598 nt2.35□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 HSL1YKL101W 4557 nt2.35□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 FKS3YMR306W 5358 nt2.34□□□□□ -2.03
HDA2Q06629 CHC1YGL206C 4962 nt2.34□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 SAP190YKR028W 3102 nt2.33□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.33□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 COX12YLR038C 252 nt2.33□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 SET3YKR029C 2256 nt2.32□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 QCR9YGR183C 201 nt2.32□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 SPF1YEL031W 3648 nt2.32□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 YEF3YLR249W 3135 nt2.31□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 PDR3YBL005W 2931 nt2.31□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 ALK1YGL021W 2283 nt2.31□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 SGS1YMR190C 4344 nt2.3□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 YDR521WYDR521W 336 nt2.3□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 BPH1YCR032W 6504 nt2.3□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 NEW1YPL226W 3591 nt2.29□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 YPR097WYPR097W 3222 nt2.29□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 IST2YBR086C 2841 nt2.29□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 snR39BsnR39B 96 nt2.29□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 PKH2YOL100W 3246 nt2.29□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.29□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 VPS13YLL040C 9435 nt2.28□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 SEY1YOR165W 2331 nt2.28□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 STE11YLR362W 2154 nt2.28□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.28□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 SLN1YIL147C 3663 nt2.28□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 ARP8YOR141C 2646 nt2.28□□□□□ -2.04
HDA2Q06629 SLI15YBR156C 2097 nt2.27□□□□□ -2.05
HDA2Q06629 NUP157YER105C 4176 nt2.27□□□□□ -2.05
HDA2Q06629 PDR8YLR266C 2106 nt2.27□□□□□ -2.05
HDA2Q06629 IFH1YLR223C 3258 nt2.27□□□□□ -2.05
HDA2Q06629 HER1YOR227W 3741 nt2.26□□□□□ -2.05
HDA2Q06629 SCP160YJL080C 3669 nt2.26□□□□□ -2.05
HDA2Q06629 YGL182CYGL182C 324 nt2.26□□□□□ -2.05
HDA2Q06629 TDA9YML081W 3756 nt2.25□□□□□ -2.05
HDA2Q06629 COG4YPR105C 2586 nt2.25□□□□□ -2.05
HDA2Q06629 IRC8YJL051W 2469 nt2.25□□□□□ -2.05
HDA2Q06629 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt2.24□□□□□ -2.05
HDA2Q06629 YOR055WYOR055W 435 nt2.24□□□□□ -2.05
HDA2Q06629 STB6YKL072W 2301 nt2.23□□□□□ -2.05
HDA2Q06629 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt2.23□□□□□ -2.05
HDA2Q06629 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.23□□□□□ -2.05
HDA2Q06629 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt2.23□□□□□ -2.05
HDA2Q06629 MDS3YGL197W 4464 nt2.23□□□□□ -2.05
HDA2Q06629 SFB2YNL049C 2631 nt2.21□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.5 ms