Protein–RNA interactions for Protein: Q06063

DUS4, tRNA-dihydrouridine(20a/20b) synthase [NAD(P)+], yeastyeast

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DUS4Q06063 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.32□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.32□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 INP51YIL002C 2841 nt2.32□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 PSD2YGR170W 3417 nt2.32□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 CAT2YML042W 2013 nt2.32□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 YPR097WYPR097W 3222 nt2.32□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 snR61snR61 90 nt2.31□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 NOP14YDL148C 2433 nt2.31□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 SLD3YGL113W 2007 nt2.3□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 DGR2YKL121W 2559 nt2.3□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 NAM7YMR080C 2916 nt2.29□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 CBF2YGR140W 2871 nt2.29□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 MAD1YGL086W 2250 nt2.29□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 CMC4YMR194C-B 222 nt2.29□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 AMS1YGL156W 3252 nt2.29□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 CTF4YPR135W 2784 nt2.28□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 PAA1YDR071C 576 nt2.28□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.28□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 YFR016CYFR016C 3702 nt2.28□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 SAP185YJL098W 3177 nt2.27□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt2.27□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 RPS30BYOR182C 192 nt2.27□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 SPF1YEL031W 3648 nt2.27□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 UFD4YKL010C 4452 nt2.27□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.26□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt2.26□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt2.26□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.26□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 CDC31YOR257W 486 nt2.26□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 PTP2YOR208W 2253 nt2.26□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 HSH155YMR288W 2916 nt2.24□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 IRC8YJL051W 2469 nt2.24□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 KOG1YHR186C 4674 nt2.24□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 YNL018CYNL018C 1839 nt2.24□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 TUS1YLR425W 3924 nt2.23□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 MMS22YLR320W 4365 nt2.23□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 SBH1YER087C-B 249 nt2.23□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 YLR282CYLR282C 342 nt2.23□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 DGR1YNL130C-A 147 nt2.23□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 YOR019WYOR019W 2193 nt2.23□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 MAK10YEL053C 2202 nt2.22□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 OST4YDL232W 111 nt2.22□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 YNL211CYNL211C 261 nt2.22□□□□□ -2.05
DUS4Q06063 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.21□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 APL2YKL135C 2181 nt2.21□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.21□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 NUP100YKL068W 2880 nt2.2□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 SSD1YDR293C 3753 nt2.2□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 ENV11YGR071C 2583 nt2.19□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 PRP5YBR237W 2550 nt2.19□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 RGA1YOR127W 3024 nt2.19□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 BRE1YDL074C 2103 nt2.19□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 UBR1YGR184C 5853 nt2.19□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 STH1YIL126W 4080 nt2.18□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 CHC1YGL206C 4962 nt2.18□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 MGA2YIR033W 3342 nt2.18□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 SPP41YDR464W 4308 nt2.18□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 SOM1YEL059C-A 225 nt2.18□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.18□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt2.18□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 COX12YLR038C 252 nt2.18□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 YBR206WYBR206W 324 nt2.18□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 MLH3YPL164C 2148 nt2.18□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 GIP3YPL137C 3831 nt2.18□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 ALK1YGL021W 2283 nt2.17□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 BNI1YNL271C 5862 nt2.16□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 SEC31YDL195W 3822 nt2.16□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 YOL098CYOL098C 3114 nt2.16□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 TOF1YNL273W 3717 nt2.15□□□□□ -2.06
DUS4Q06063 CHS6YJL099W 2241 nt2.15□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 HMI1YOL095C 2121 nt2.15□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 YDR521WYDR521W 336 nt2.14□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 TIM9YEL020W-A 264 nt2.14□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 PKH2YOL100W 3246 nt2.14□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 RAV1YJR033C 4074 nt2.13□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 SEC16YPL085W 6588 nt2.13□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 YDL118WYDL118W 381 nt2.13□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 TTI1YKL033W 3117 nt2.12□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 PEP1YBL017C 4740 nt2.12□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 YLL054CYLL054C 2532 nt2.12□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 BUD2YKL092C 3315 nt2.12□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.12□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.12□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 IFH1YLR223C 3258 nt2.12□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 YNL144CYNL144C 2223 nt2.11□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.11□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.11□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 RTT107YHR154W 3213 nt2.1□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 MSH5YDL154W 2706 nt2.1□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.1□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 PET309YLR067C 2898 nt2.1□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 TRL1YJL087C 2484 nt2.1□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 AGC1YPR021C 2709 nt2.1□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 MET18YIL128W 3099 nt2.09□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 CDC60YPL160W 3273 nt2.09□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.09□□□□□ -2.07
DUS4Q06063 COG4YPR105C 2586 nt2.08□□□□□ -2.08
DUS4Q06063 APL1YJR005W 2103 nt2.08□□□□□ -2.08
DUS4Q06063 IRC20YLR247C 4671 nt2.08□□□□□ -2.08
DUS4Q06063 IRE1YHR079C 3348 nt2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.3 ms