Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 YHR210CYHR210C 1026 nt2.28□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.28□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 GIP3YPL137C 3831 nt2.28□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 CTR9YOL145C 3234 nt2.28□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 AIM44YPL158C 2277 nt2.28□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 RTT107YHR154W 3213 nt2.27□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 TOF1YNL273W 3717 nt2.27□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 DGR2YKL121W 2559 nt2.27□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 RPL31AYDL075W 342 nt2.27□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.27□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 PIP2YOR363C 2991 nt2.26□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 YDL196WYDL196W 330 nt2.26□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.26□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 IRE1YHR079C 3348 nt2.25□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 RTT101YJL047C 2529 nt2.25□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 PAU3YCR104W 375 nt2.25□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 RPL37BYDR500C 267 nt2.25□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.25□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 AGC1YPR021C 2709 nt2.25□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 CSF1YLR087C 8877 nt2.25□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 PMP1YCR024C-A 123 nt2.24□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 snR85snR85 171 nt2.24□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 TIM9YEL020W-A 264 nt2.24□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 SNU13YEL026W 381 nt2.24□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.24□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 FIG4YNL325C 2640 nt2.24□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 KOG1YHR186C 4674 nt2.24□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 PIG1YLR273C 1947 nt2.23□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt2.23□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 TOR2YKL203C 7425 nt2.22□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 COY1YKL179C 2040 nt2.22□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.22□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 SBE22YHR103W 2559 nt2.22□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 YPR097WYPR097W 3222 nt2.22□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 SLD3YGL113W 2007 nt2.22□□□□□ -2.05
HRQ1Q05549 snR48snR48 113 nt2.21□□□□□ -2.06
HRQ1Q05549 PRP42YDR235W 1635 nt2.2□□□□□ -2.06
HRQ1Q05549 AHC1YOR023C 1701 nt2.2□□□□□ -2.06
HRQ1Q05549 CHC1YGL206C 4962 nt2.2□□□□□ -2.06
HRQ1Q05549 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.2□□□□□ -2.06
HRQ1Q05549 FKS1YLR342W 5631 nt2.2□□□□□ -2.06
HRQ1Q05549 FRK1YPL141C 2598 nt2.2□□□□□ -2.06
HRQ1Q05549 GYP5YPL249C 2685 nt2.2□□□□□ -2.06
HRQ1Q05549 PBY1YBR094W 2262 nt2.19□□□□□ -2.06
HRQ1Q05549 HAL9YOL089C 3093 nt2.19□□□□□ -2.06
HRQ1Q05549 USO1YDL058W 5373 nt2.18□□□□□ -2.06
HRQ1Q05549 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.17□□□□□ -2.06
HRQ1Q05549 ALK1YGL021W 2283 nt2.17□□□□□ -2.06
HRQ1Q05549 IST2YBR086C 2841 nt2.17□□□□□ -2.06
HRQ1Q05549 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt2.15□□□□□ -2.07
HRQ1Q05549 PKH2YOL100W 3246 nt2.15□□□□□ -2.07
HRQ1Q05549 TDA9YML081W 3756 nt2.14□□□□□ -2.07
HRQ1Q05549 YDR521WYDR521W 336 nt2.14□□□□□ -2.07
HRQ1Q05549 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.14□□□□□ -2.07
HRQ1Q05549 SEY1YOR165W 2331 nt2.14□□□□□ -2.07
HRQ1Q05549 SLI15YBR156C 2097 nt2.13□□□□□ -2.07
HRQ1Q05549 IFH1YLR223C 3258 nt2.13□□□□□ -2.07
HRQ1Q05549 HER1YOR227W 3741 nt2.13□□□□□ -2.07
HRQ1Q05549 COG4YPR105C 2586 nt2.12□□□□□ -2.07
HRQ1Q05549 RTP1YMR185W 2946 nt2.12□□□□□ -2.07
HRQ1Q05549 YNL144CYNL144C 2223 nt2.12□□□□□ -2.07
HRQ1Q05549 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.11□□□□□ -2.07
HRQ1Q05549 YBL053WYBL053W 375 nt2.1□□□□□ -2.07
HRQ1Q05549 PEP1YBL017C 4740 nt2.1□□□□□ -2.07
HRQ1Q05549 RGA1YOR127W 3024 nt2.1□□□□□ -2.07
HRQ1Q05549 SEC63YOR254C 1992 nt2.1□□□□□ -2.07
HRQ1Q05549 SFB2YNL049C 2631 nt2.08□□□□□ -2.08
HRQ1Q05549 HIR3YJR140C 4947 nt2.08□□□□□ -2.08
HRQ1Q05549 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.08□□□□□ -2.08
HRQ1Q05549 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt2.08□□□□□ -2.08
HRQ1Q05549 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.08□□□□□ -2.08
HRQ1Q05549 YBR206WYBR206W 324 nt2.08□□□□□ -2.08
HRQ1Q05549 FIG2YCR089W 4830 nt2.06□□□□□ -2.08
HRQ1Q05549 ADR1YDR216W 3972 nt2.06□□□□□ -2.08
HRQ1Q05549 YOR102WYOR102W 351 nt2.06□□□□□ -2.08
HRQ1Q05549 YPL044CYPL044C 549 nt2.06□□□□□ -2.08
HRQ1Q05549 UTP21YLR409C 2820 nt2.05□□□□□ -2.08
HRQ1Q05549 FAB1YFR019W 6837 nt2.05□□□□□ -2.08
HRQ1Q05549 RPS30BYOR182C 192 nt2.05□□□□□ -2.08
HRQ1Q05549 GCN2YDR283C 4980 nt2.05□□□□□ -2.08
HRQ1Q05549 MSH6YDR097C 3729 nt2.04□□□□□ -2.08
HRQ1Q05549 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.03□□□□□ -2.08
HRQ1Q05549 APL1YJR005W 2103 nt2.03□□□□□ -2.08
HRQ1Q05549 CTF4YPR135W 2784 nt2.02□□□□□ -2.09
HRQ1Q05549 PAA1YDR071C 576 nt2.02□□□□□ -2.09
HRQ1Q05549 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.02□□□□□ -2.09
HRQ1Q05549 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt2.02□□□□□ -2.09
HRQ1Q05549 SPO24YPR036W-A 204 nt2.02□□□□□ -2.09
HRQ1Q05549 TTI1YKL033W 3117 nt2.02□□□□□ -2.09
HRQ1Q05549 TRM3YDL112W 4311 nt2.02□□□□□ -2.09
HRQ1Q05549 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.02□□□□□ -2.09
HRQ1Q05549 KIP1YBL063W 3336 nt2.01□□□□□ -2.09
HRQ1Q05549 MYO4YAL029C 4416 nt2.01□□□□□ -2.09
HRQ1Q05549 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.01□□□□□ -2.09
HRQ1Q05549 COX12YLR038C 252 nt2.01□□□□□ -2.09
HRQ1Q05549 BRR2YER172C 6492 nt2□□□□□ -2.09
HRQ1Q05549 YJL022WYJL022W 309 nt1.99□□□□□ -2.09
HRQ1Q05549 YNL211CYNL211C 261 nt1.98□□□□□ -2.09
HRQ1Q05549 YJR039WYJR039W 3366 nt1.98□□□□□ -2.09
HRQ1Q05549 YDL206WYDL206W 2289 nt1.98□□□□□ -2.09
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