Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

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Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 MPT5YGL178W 2580 nt1.01□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 snR56snR56 88 nt1.01□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 YDR426CYDR426C 378 nt1.01□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.01□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 YNL058CYNL058C 951 nt1.01□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.01□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 INP2YMR163C 2118 nt1.01□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 NUP157YER105C 4176 nt1□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 SLY1YDR189W 2001 nt1□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 NPC2YDL046W 522 nt1□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 RPL35AYDL191W 363 nt1□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 RPS30BYOR182C 192 nt1□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 SAS3YBL052C 2496 nt1□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 BUD3YCL014W 4911 nt1□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 ALY2YJL084C 3141 nt1□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.99□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.99□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt0.99□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt0.99□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 PAM16YJL104W 450 nt0.99□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.99□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 YPL225WYPL225W 441 nt0.99□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 NIP100YPL174C 2607 nt0.99□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 AIM44YPL158C 2277 nt0.98□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 YJR011CYJR011C 786 nt0.98□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 RAD34YDR314C 2079 nt0.98□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.97□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 YAF9YNL107W 681 nt0.97□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 LCD1YDR499W 2244 nt0.97□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 NHP2YDL208W 471 nt0.96□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 RPL38YLR325C 237 nt0.96□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 YOR029WYOR029W 336 nt0.96□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 COG4YPR105C 2586 nt0.96□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 MAM33YIL070C 801 nt0.95□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 BIL1YOR304C-A 231 nt0.95□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 YPR197CYPR197C 564 nt0.95□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 SET3YKR029C 2256 nt0.95□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 INA22YIR024C 651 nt0.94□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.94□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.94□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 STO1YMR125W 2586 nt0.93□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 YDR521WYDR521W 336 nt0.93□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 YAR029WYAR029W 225 nt0.93□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 HTB2YBL002W 396 nt0.93□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 FIG4YNL325C 2640 nt0.92□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 IFH1YLR223C 3258 nt0.92□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 SLI15YBR156C 2097 nt0.92□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 YDR048CYDR048C 315 nt0.92□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 YDR102CYDR102C 333 nt0.92□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 YBR206WYBR206W 324 nt0.92□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 RIM20YOR275C 1986 nt0.92□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.91□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.91□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 MYO1YHR023W 5787 nt0.91□□□□□ -2.26
CSI1Q04368 PCC1YKR095W-A 267 nt0.9□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 CMC4YMR194C-B 222 nt0.9□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 YCK3YER123W 1575 nt0.9□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 PDE2YOR360C 1581 nt0.9□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 MMS4YBR098W 2076 nt0.9□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 SEC1YDR164C 2175 nt0.9□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 PKH2YOL100W 3246 nt0.89□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 SSS1YDR086C 243 nt0.89□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 ATP6Q0085 780 nt0.89□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 YDL206WYDL206W 2289 nt0.89□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.88□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 YBR064WYBR064W 429 nt0.88□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 SMC1YFL008W 3678 nt0.87□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 GEA2YEL022W 4380 nt0.87□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 PRP16YKR086W 3216 nt0.86□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.86□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 TAR1YLR154W-C 375 nt0.86□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 YDL073WYDL073W 2955 nt0.86□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.85□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 GPG1YGL121C 381 nt0.85□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.85□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 YDR344CYDR344C 444 nt0.84□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 snR36snR36 182 nt0.84□□□□□ -2.27
CSI1Q04368 YLL007CYLL007C 1998 nt0.84□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 YFL032WYFL032W 321 nt0.83□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 YJL120WYJL120W 324 nt0.83□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 DBP6YNR038W 1890 nt0.83□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 PAN2YGL094C 3348 nt0.83□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 CUL3YGR003W 2235 nt0.83□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 SPO21YOL091W 1830 nt0.82□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 UBP3YER151C 2739 nt0.82□□□□□ -2.28
CSI1Q04368 RKR1YMR247C 4689 nt0.82□□□□□ -2.28
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