Protein–RNA interactions for Protein: P40072

SLX8, E3 ubiquitin-protein ligase complex SLX5-SLX8 subunit SLX8, yeastyeast

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX8P40072 HMI1YOL095C 2121 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 ESC1YMR219W 4977 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YER138CYER138C 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YER160CYER160C 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YJR027WYJR027W 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YML039WYML039W 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YML045WYML045W 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YMR050CYMR050C 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.81□□□□□ -1.96
SLX8P40072 MSH6YDR097C 3729 nt2.8□□□□□ -1.96
SLX8P40072 IFH1YLR223C 3258 nt2.8□□□□□ -1.96
SLX8P40072 YDL118WYDL118W 381 nt2.8□□□□□ -1.96
SLX8P40072 ECM29YHL030W 5607 nt2.8□□□□□ -1.96
SLX8P40072 SAP185YJL098W 3177 nt2.8□□□□□ -1.96
SLX8P40072 MLH3YPL164C 2148 nt2.8□□□□□ -1.96
SLX8P40072 SEY1YOR165W 2331 nt2.79□□□□□ -1.96
SLX8P40072 IRE1YHR079C 3348 nt2.78□□□□□ -1.96
SLX8P40072 SGS1YMR190C 4344 nt2.78□□□□□ -1.96
SLX8P40072 HER1YOR227W 3741 nt2.78□□□□□ -1.96
SLX8P40072 SAP190YKR028W 3102 nt2.78□□□□□ -1.96
SLX8P40072 CHS6YJL099W 2241 nt2.78□□□□□ -1.96
SLX8P40072 TOM1YDR457W 9807 nt2.78□□□□□ -1.96
SLX8P40072 STF2YGR008C 255 nt2.77□□□□□ -1.97
SLX8P40072 LCL1YPL056C 306 nt2.77□□□□□ -1.97
SLX8P40072 AGC1YPR021C 2709 nt2.77□□□□□ -1.97
SLX8P40072 UBP15YMR304W 3693 nt2.76□□□□□ -1.97
SLX8P40072 PNC1YGL037C 651 nt2.76□□□□□ -1.97
SLX8P40072 ALK1YGL021W 2283 nt2.76□□□□□ -1.97
SLX8P40072 YNL144CYNL144C 2223 nt2.76□□□□□ -1.97
SLX8P40072 YDR521WYDR521W 336 nt2.75□□□□□ -1.97
SLX8P40072 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.75□□□□□ -1.97
SLX8P40072 TTI1YKL033W 3117 nt2.75□□□□□ -1.97
SLX8P40072 SEC63YOR254C 1992 nt2.74□□□□□ -1.97
SLX8P40072 YLR278CYLR278C 4026 nt2.74□□□□□ -1.97
SLX8P40072 SEC31YDL195W 3822 nt2.74□□□□□ -1.97
SLX8P40072 SLN1YIL147C 3663 nt2.73□□□□□ -1.97
SLX8P40072 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.73□□□□□ -1.97
SLX8P40072 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.73□□□□□ -1.97
SLX8P40072 ESL1YIL151C 3357 nt2.73□□□□□ -1.97
SLX8P40072 SEC26YDR238C 2922 nt2.72□□□□□ -1.97
SLX8P40072 PDR3YBL005W 2931 nt2.72□□□□□ -1.97
SLX8P40072 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
SLX8P40072 ATG9YDL149W 2994 nt2.71□□□□□ -1.98
SLX8P40072 HSL1YKL101W 4557 nt2.7□□□□□ -1.98
SLX8P40072 YLL054CYLL054C 2532 nt2.7□□□□□ -1.98
SLX8P40072 FRK1YPL141C 2598 nt2.69□□□□□ -1.98
SLX8P40072 BNR1YIL159W 4128 nt2.69□□□□□ -1.98
SLX8P40072 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.69□□□□□ -1.98
SLX8P40072 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.69□□□□□ -1.98
SLX8P40072 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.69□□□□□ -1.98
SLX8P40072 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.69□□□□□ -1.98
SLX8P40072 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.69□□□□□ -1.98
SLX8P40072 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.69□□□□□ -1.98
SLX8P40072 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt2.69□□□□□ -1.98
SLX8P40072 NEW1YPL226W 3591 nt2.69□□□□□ -1.98
SLX8P40072 YEF3YLR249W 3135 nt2.69□□□□□ -1.98
SLX8P40072 APL1YJR005W 2103 nt2.69□□□□□ -1.98
SLX8P40072 REV3YPL167C 4515 nt2.68□□□□□ -1.98
SLX8P40072 snR70snR70 164 nt2.68□□□□□ -1.98
SLX8P40072 PKH2YOL100W 3246 nt2.68□□□□□ -1.98
SLX8P40072 AXL1YPR122W 3627 nt2.67□□□□□ -1.98
SLX8P40072 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.67□□□□□ -1.98
SLX8P40072 IRC8YJL051W 2469 nt2.66□□□□□ -1.98
SLX8P40072 STE11YLR362W 2154 nt2.66□□□□□ -1.98
SLX8P40072 YGL182CYGL182C 324 nt2.66□□□□□ -1.98
SLX8P40072 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.63□□□□□ -1.99
SLX8P40072 CHC1YGL206C 4962 nt2.63□□□□□ -1.99
SLX8P40072 COG4YPR105C 2586 nt2.63□□□□□ -1.99
SLX8P40072 PDR8YLR266C 2106 nt2.63□□□□□ -1.99
SLX8P40072 RGA1YOR127W 3024 nt2.63□□□□□ -1.99
SLX8P40072 FKS3YMR306W 5358 nt2.62□□□□□ -1.99
SLX8P40072 LHS1YKL073W 2646 nt2.62□□□□□ -1.99
SLX8P40072 QCR9YGR183C 201 nt2.62□□□□□ -1.99
SLX8P40072 UTP8YGR128C 2142 nt2.62□□□□□ -1.99
SLX8P40072 SLI15YBR156C 2097 nt2.61□□□□□ -1.99
SLX8P40072 snR45snR45 172 nt2.61□□□□□ -1.99
SLX8P40072 HIR3YJR140C 4947 nt2.6□□□□□ -1.99
SLX8P40072 SFB2YNL049C 2631 nt2.6□□□□□ -1.99
SLX8P40072 YLL020CYLL020C 306 nt2.6□□□□□ -1.99
SLX8P40072 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.6□□□□□ -1.99
SLX8P40072 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.6□□□□□ -1.99
SLX8P40072 MGA2YIR033W 3342 nt2.6□□□□□ -1.99
SLX8P40072 SEC16YPL085W 6588 nt2.59□□□□□ -1.99
SLX8P40072 UTP21YLR409C 2820 nt2.59□□□□□ -1.99
SLX8P40072 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.59□□□□□ -1.99
SLX8P40072 NUP170YBL079W 4509 nt2.59□□□□□ -1.99
SLX8P40072 PDR1YGL013C 3207 nt2.59□□□□□ -2
SLX8P40072 TRM3YDL112W 4311 nt2.58□□□□□ -2
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