Protein–RNA interactions for Protein: P38799

YHR078W, Uncharacterized protein YHR078W, yeastyeast

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR078WP38799 YDL196WYDL196W 330 nt2.11□□□□□ -2.07
YHR078WP38799 YPR097WYPR097W 3222 nt2.11□□□□□ -2.07
YHR078WP38799 PIG1YLR273C 1947 nt2.11□□□□□ -2.07
YHR078WP38799 DGR2YKL121W 2559 nt2.1□□□□□ -2.07
YHR078WP38799 NCA2YPR155C 1851 nt2.1□□□□□ -2.07
YHR078WP38799 YHR210CYHR210C 1026 nt2.1□□□□□ -2.07
YHR078WP38799 TFC3YAL001C 3483 nt2.1□□□□□ -2.07
YHR078WP38799 PET309YLR067C 2898 nt2.1□□□□□ -2.07
YHR078WP38799 GYP5YPL249C 2685 nt2.09□□□□□ -2.07
YHR078WP38799 AGC1YPR021C 2709 nt2.09□□□□□ -2.07
YHR078WP38799 CTR9YOL145C 3234 nt2.09□□□□□ -2.07
YHR078WP38799 PTP2YOR208W 2253 nt2.09□□□□□ -2.07
YHR078WP38799 AHC1YOR023C 1701 nt2.08□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 COY1YKL179C 2040 nt2.08□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.08□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 HMI1YOL095C 2121 nt2.08□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 RTT101YJL047C 2529 nt2.08□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 PIP2YOR363C 2991 nt2.07□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 FIG4YNL325C 2640 nt2.07□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 AIM44YPL158C 2277 nt2.07□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.07□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.07□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 BUD2YKL092C 3315 nt2.06□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 HAL9YOL089C 3093 nt2.06□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 YMR045CYMR045C 5268 nt2.06□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt2.05□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 DGR1YNL130C-A 147 nt2.05□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 YNL205CYNL205C 423 nt2.05□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 PRP42YDR235W 1635 nt2.05□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 IRE1YHR079C 3348 nt2.04□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 GCN2YDR283C 4980 nt2.04□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 SIR4YDR227W 4077 nt2.04□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 YDR521WYDR521W 336 nt2.04□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.04□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 HIR3YJR140C 4947 nt2.03□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 IFH1YLR223C 3258 nt2.03□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 ALK1YGL021W 2283 nt2.03□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 BRE1YDL074C 2103 nt2.03□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 SLD3YGL113W 2007 nt2.03□□□□□ -2.08
YHR078WP38799 IST2YBR086C 2841 nt2.03□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.02□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 YBL053WYBL053W 375 nt2.02□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 YNL144CYNL144C 2223 nt2.01□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 snR85snR85 171 nt2□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 YBR206WYBR206W 324 nt2□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 snR48snR48 113 nt2□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 MGA2YIR033W 3342 nt1.99□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 FRK1YPL141C 2598 nt1.99□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 YDL118WYDL118W 381 nt1.99□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 SNU13YEL026W 381 nt1.99□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.99□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 PBY1YBR094W 2262 nt1.99□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 TDA9YML081W 3756 nt1.99□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 COG4YPR105C 2586 nt1.99□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 PKH2YOL100W 3246 nt1.98□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 SLI15YBR156C 2097 nt1.97□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 FAB1YFR019W 6837 nt1.97□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 HSL1YKL101W 4557 nt1.97□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 KIP1YBL063W 3336 nt1.97□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 SBE22YHR103W 2559 nt1.97□□□□□ -2.09
YHR078WP38799 SEY1YOR165W 2331 nt1.96□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.96□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 INO80YGL150C 4470 nt1.96□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.96□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 UBP2YOR124C 3819 nt1.96□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.95□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 UFD4YKL010C 4452 nt1.95□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.95□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.95□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 FKS1YLR342W 5631 nt1.95□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 HER1YOR227W 3741 nt1.94□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 SEC31YDL195W 3822 nt1.94□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 YPL044CYPL044C 549 nt1.94□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 SEC63YOR254C 1992 nt1.94□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 SFB2YNL049C 2631 nt1.93□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.93□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 YOR093CYOR093C 4947 nt1.93□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 RGA1YOR127W 3024 nt1.93□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 UBR2YLR024C 5619 nt1.92□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 RPS30BYOR182C 192 nt1.92□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 ANS1YHR126C 480 nt1.91□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 SPO24YPR036W-A 204 nt1.91□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 UTP21YLR409C 2820 nt1.9□□□□□ -2.1
YHR078WP38799 PAA1YDR071C 576 nt1.9□□□□□ -2.11
YHR078WP38799 COX12YLR038C 252 nt1.9□□□□□ -2.11
YHR078WP38799 ADR1YDR216W 3972 nt1.9□□□□□ -2.11
YHR078WP38799 MSH6YDR097C 3729 nt1.89□□□□□ -2.11
YHR078WP38799 IRC20YLR247C 4671 nt1.89□□□□□ -2.11
YHR078WP38799 NUT1YGL151W 3399 nt1.89□□□□□ -2.11
YHR078WP38799 MDS3YGL197W 4464 nt1.88□□□□□ -2.11
YHR078WP38799 YOR102WYOR102W 351 nt1.88□□□□□ -2.11
YHR078WP38799 TRM3YDL112W 4311 nt1.87□□□□□ -2.11
YHR078WP38799 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.87□□□□□ -2.11
YHR078WP38799 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.87□□□□□ -2.11
YHR078WP38799 ATG9YDL149W 2994 nt1.86□□□□□ -2.11
YHR078WP38799 BPH1YCR032W 6504 nt1.86□□□□□ -2.11
YHR078WP38799 TBS1YBR150C 3285 nt1.86□□□□□ -2.11
YHR078WP38799 TTI1YKL033W 3117 nt1.86□□□□□ -2.11
YHR078WP38799 APL1YJR005W 2103 nt1.86□□□□□ -2.11
YHR078WP38799 MYO4YAL029C 4416 nt1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72.1 ms