Protein–RNA interactions for Protein: P25037

UBP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP1P25037 PMP2YEL017C-A 132 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP1P25037 BNI1YNL271C 5862 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP1P25037 PTP2YOR208W 2253 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP1P25037 MAK10YEL053C 2202 nt2.79□□□□□ -1.96
UBP1P25037 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt2.79□□□□□ -1.96
UBP1P25037 MMS22YLR320W 4365 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP1P25037 UTP22YGR090W 3714 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP1P25037 ENV11YGR071C 2583 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP1P25037 TRS130YMR218C 3309 nt2.78□□□□□ -1.97
UBP1P25037 APL2YKL135C 2181 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP1P25037 TRA1YHR099W 11235 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP1P25037 YHR217CYHR217C 462 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP1P25037 UBR1YGR184C 5853 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP1P25037 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP1P25037 HUG1YML058W-A 207 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP1P25037 CTF4YPR135W 2784 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP1P25037 IRC8YJL051W 2469 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP1P25037 RTT107YHR154W 3213 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP1P25037 YBR099CYBR099C 384 nt2.75□□□□□ -1.97
UBP1P25037 FAR11YNL127W 2862 nt2.75□□□□□ -1.97
UBP1P25037 CSF1YLR087C 8877 nt2.75□□□□□ -1.97
UBP1P25037 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP1P25037 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP1P25037 RPS29AYLR388W 171 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP1P25037 RPS30BYOR182C 192 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP1P25037 SXM1YDR395W 2835 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP1P25037 MLH3YPL164C 2148 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP1P25037 SEC16YPL085W 6588 nt2.73□□□□□ -1.97
UBP1P25037 IRC20YLR247C 4671 nt2.73□□□□□ -1.97
UBP1P25037 VPS13YLL040C 9435 nt2.73□□□□□ -1.97
UBP1P25037 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP1P25037 MET18YIL128W 3099 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP1P25037 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP1P25037 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP1P25037 CHC1YGL206C 4962 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP1P25037 PAA1YDR071C 576 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP1P25037 VPS8YAL002W 3825 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP1P25037 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt2.69□□□□□ -1.98
UBP1P25037 STF2YGR008C 255 nt2.69□□□□□ -1.98
UBP1P25037 COX12YLR038C 252 nt2.69□□□□□ -1.98
UBP1P25037 SEC31YDL195W 3822 nt2.69□□□□□ -1.98
UBP1P25037 ALK1YGL021W 2283 nt2.68□□□□□ -1.98
UBP1P25037 KOG1YHR186C 4674 nt2.68□□□□□ -1.98
UBP1P25037 CDC31YOR257W 486 nt2.68□□□□□ -1.98
UBP1P25037 RAV1YJR033C 4074 nt2.67□□□□□ -1.98
UBP1P25037 MSH5YDL154W 2706 nt2.67□□□□□ -1.98
UBP1P25037 YDR521WYDR521W 336 nt2.67□□□□□ -1.98
UBP1P25037 CMC4YMR194C-B 222 nt2.67□□□□□ -1.98
UBP1P25037 HMI1YOL095C 2121 nt2.67□□□□□ -1.98
UBP1P25037 SFB2YNL049C 2631 nt2.66□□□□□ -1.98
UBP1P25037 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt2.66□□□□□ -1.98
UBP1P25037 SPF1YEL031W 3648 nt2.66□□□□□ -1.98
UBP1P25037 IFH1YLR223C 3258 nt2.66□□□□□ -1.98
UBP1P25037 FAB1YFR019W 6837 nt2.65□□□□□ -1.98
UBP1P25037 snR61snR61 90 nt2.65□□□□□ -1.99
UBP1P25037 BUD2YKL092C 3315 nt2.65□□□□□ -1.99
UBP1P25037 MLH1YMR167W 2310 nt2.65□□□□□ -1.99
UBP1P25037 TOR2YKL203C 7425 nt2.65□□□□□ -1.99
UBP1P25037 YOR019WYOR019W 2193 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP1P25037 YBR206WYBR206W 324 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP1P25037 AGC1YPR021C 2709 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP1P25037 TRL1YJL087C 2484 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP1P25037 PKH2YOL100W 3246 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP1P25037 CDC60YPL160W 3273 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP1P25037 NUP192YJL039C 5052 nt2.64□□□□□ -1.99
UBP1P25037 PRP5YBR237W 2550 nt2.63□□□□□ -1.99
UBP1P25037 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.63□□□□□ -1.99
UBP1P25037 PET309YLR067C 2898 nt2.62□□□□□ -1.99
UBP1P25037 YNL211CYNL211C 261 nt2.62□□□□□ -1.99
UBP1P25037 SVL3YPL032C 2478 nt2.61□□□□□ -1.99
UBP1P25037 OST4YDL232W 111 nt2.61□□□□□ -1.99
UBP1P25037 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.61□□□□□ -1.99
UBP1P25037 INO80YGL150C 4470 nt2.61□□□□□ -1.99
UBP1P25037 CTR9YOL145C 3234 nt2.6□□□□□ -1.99
UBP1P25037 IRE1YHR079C 3348 nt2.6□□□□□ -1.99
UBP1P25037 TTI1YKL033W 3117 nt2.59□□□□□ -1.99
UBP1P25037 SYH1YPL105C 2550 nt2.59□□□□□ -1.99
UBP1P25037 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.59□□□□□ -1.99
UBP1P25037 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.59□□□□□ -1.99
UBP1P25037 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.59□□□□□ -1.99
UBP1P25037 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.58□□□□□ -2
UBP1P25037 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt2.58□□□□□ -2
UBP1P25037 COG4YPR105C 2586 nt2.58□□□□□ -2
UBP1P25037 YOL098CYOL098C 3114 nt2.57□□□□□ -2
UBP1P25037 RPL37BYDR500C 267 nt2.57□□□□□ -2
UBP1P25037 YLR282CYLR282C 342 nt2.57□□□□□ -2
UBP1P25037 PEP1YBL017C 4740 nt2.57□□□□□ -2
UBP1P25037 PMD1YER132C 5262 nt2.56□□□□□ -2
UBP1P25037 SSD1YDR293C 3753 nt2.56□□□□□ -2
UBP1P25037 APL1YJR005W 2103 nt2.56□□□□□ -2
UBP1P25037 SBH1YER087C-B 249 nt2.56□□□□□ -2
UBP1P25037 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.56□□□□□ -2
UBP1P25037 SLI15YBR156C 2097 nt2.56□□□□□ -2
UBP1P25037 YNL144CYNL144C 2223 nt2.56□□□□□ -2
UBP1P25037 FRK1YPL141C 2598 nt2.55□□□□□ -2
UBP1P25037 TIM9YEL020W-A 264 nt2.55□□□□□ -2
UBP1P25037 SOM1YEL059C-A 225 nt2.55□□□□□ -2
UBP1P25037 CHS6YJL099W 2241 nt2.55□□□□□ -2
UBP1P25037 YLL054CYLL054C 2532 nt2.55□□□□□ -2
UBP1P25037 YLR422WYLR422W 5799 nt2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 66.6 ms