Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 LCD1YDR499W 2244 nt0.84□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 ALY2YJL084C 3141 nt0.84□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.84□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 RPS27AYKL156W 249 nt0.84□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 YPR153WYPR153W 423 nt0.84□□□□□ -2.27
SNF8Q12483 EFR3YMR212C 2349 nt0.84□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 SLY1YDR189W 2001 nt0.83□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 YHR125WYHR125W 306 nt0.83□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 YPL182CYPL182C 384 nt0.83□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 NPC2YDL046W 522 nt0.82□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 YGR290WYGR290W 444 nt0.82□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 RRT1YBL048W 312 nt0.82□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.82□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 RIM20YOR275C 1986 nt0.82□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 MMS4YBR098W 2076 nt0.82□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 YDL206WYDL206W 2289 nt0.81□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 BUD3YCL014W 4911 nt0.81□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.81□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 SLI15YBR156C 2097 nt0.8□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 PDE2YOR360C 1581 nt0.8□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 WIP1YDR374W-A 270 nt0.8□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 TIM13YGR181W 318 nt0.8□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 YOR199WYOR199W 330 nt0.8□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 ZIP2YGL249W 2115 nt0.8□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 GEA2YEL022W 4380 nt0.8□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 YHR130CYHR130C 336 nt0.79□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.79□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 FYV7YLR068W 456 nt0.79□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 YBL071CYBL071C 309 nt0.79□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 YNL122CYNL122C 348 nt0.79□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 ZEO1YOL109W 342 nt0.79□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 RPB10YOR210W 213 nt0.79□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 BI2Q0110 1272 nt0.78□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 COG4YPR105C 2586 nt0.78□□□□□ -2.28
SNF8Q12483 YJR003CYJR003C 1560 nt0.78□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 RKR1YMR247C 4689 nt0.77□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 WAR1YML076C 2835 nt0.76□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 YGR042WYGR042W 816 nt0.76□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 SEC1YDR164C 2175 nt0.76□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 snR72snR72 98 nt0.75□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 YDL196WYDL196W 330 nt0.75□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 YLR287CYLR287C 1068 nt0.75□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.74□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.74□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 snR54snR54 86 nt0.74□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 YDL011CYDL011C 324 nt0.73□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 YJL135WYJL135W 318 nt0.73□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 YKL202WYKL202W 582 nt0.73□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 TOM22YNL131W 459 nt0.73□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 ECL1YGR146C 636 nt0.72□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 YLR171WYLR171W 390 nt0.72□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.72□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 snR41snR41 95 nt0.72□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 YAR009CYAR009C 3591 nt0.72□□□□□ -2.29
SNF8Q12483 NHP2YDL208W 471 nt0.71□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 SWF1YDR126W 1011 nt0.71□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 GPG1YGL121C 381 nt0.71□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 YNL303WYNL303W 348 nt0.71□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 IES4YOR189W 351 nt0.71□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 snR189snR189 189 nt0.71□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 snR51snR51 107 nt0.71□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 DIE2YGR227W 1578 nt0.7□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 PKH2YOL100W 3246 nt0.7□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 PAN2YGL094C 3348 nt0.7□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 YHL041WYHL041W 450 nt0.7□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 CBS1YDL069C 690 nt0.69□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 PAM16YJL104W 450 nt0.69□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.69□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 YDL073WYDL073W 2955 nt0.68□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 SDH7YDR511W 402 nt0.68□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 YDR521WYDR521W 336 nt0.68□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 ALG13YGL047W 609 nt0.68□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 YKL083WYKL083W 615 nt0.68□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 YLR101CYLR101C 396 nt0.68□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.68□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.68□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 YOL160WYOL160W 342 nt0.68□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 CMC4YMR194C-B 222 nt0.67□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 YPL229WYPL229W 621 nt0.67□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 DBP6YNR038W 1890 nt0.67□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.66□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 ISD11YER048W-A 285 nt0.66□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 LOA1YPR139C 903 nt0.66□□□□□ -2.3
SNF8Q12483 PRP16YKR086W 3216 nt0.65□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 YAP6YDR259C 1152 nt0.65□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 RPL26AYLR344W 384 nt0.65□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 UBC7YMR022W 498 nt0.65□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.65□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.65□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 PAC1YOR269W 1485 nt0.65□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 RAD34YDR314C 2079 nt0.65□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 BFR2YDR299W 1605 nt0.64□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 UBP3YER151C 2739 nt0.64□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 YAR047CYAR047C 321 nt0.64□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 PCF11YDR228C 1881 nt0.64□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 YDR344CYDR344C 444 nt0.63□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.63□□□□□ -2.31
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