Protein–RNA interactions for Protein: Q12387

MDM20, N-terminal acetyltransferase B complex subunit MDM20, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDM20Q12387 SPT21YMR179W 2277 nt2.19□□□□□ -2.06
MDM20Q12387 COS111YBR203W 2775 nt2.18□□□□□ -2.06
MDM20Q12387 NIP100YPL174C 2607 nt2.18□□□□□ -2.06
MDM20Q12387 RRT15YLR162W-A 189 nt2.18□□□□□ -2.06
MDM20Q12387 NOP14YDL148C 2433 nt2.18□□□□□ -2.06
MDM20Q12387 RFX1YLR176C 2436 nt2.18□□□□□ -2.06
MDM20Q12387 SFB2YNL049C 2631 nt2.17□□□□□ -2.06
MDM20Q12387 DCP2YNL118C 2913 nt2.17□□□□□ -2.06
MDM20Q12387 RPS17AYML024W 411 nt2.17□□□□□ -2.06
MDM20Q12387 YNL338WYNL338W 159 nt2.17□□□□□ -2.06
MDM20Q12387 CTF4YPR135W 2784 nt2.17□□□□□ -2.06
MDM20Q12387 ZRG8YER033C 3231 nt2.16□□□□□ -2.06
MDM20Q12387 SWI6YLR182W 2412 nt2.16□□□□□ -2.06
MDM20Q12387 YCR043CYCR043C 384 nt2.16□□□□□ -2.06
MDM20Q12387 ATP8Q0080 147 nt2.16□□□□□ -2.06
MDM20Q12387 SLM1YIL105C 2061 nt2.16□□□□□ -2.06
MDM20Q12387 SPP41YDR464W 4308 nt2.15□□□□□ -2.06
MDM20Q12387 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt2.15□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 snR72snR72 98 nt2.15□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 PAU18YLL064C 363 nt2.15□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt2.15□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 PAU6YNR076W 363 nt2.15□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 MET18YIL128W 3099 nt2.14□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 BRE1YDL074C 2103 nt2.14□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 SWI5YDR146C 2130 nt2.14□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 OLI1Q0130 231 nt2.14□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.14□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 YPR092WYPR092W 306 nt2.14□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 TRS65YGR166W 1683 nt2.14□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 SEC31YDL195W 3822 nt2.14□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 LYS14YDR034C 2373 nt2.14□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 PRP39YML046W 1890 nt2.14□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 UBR1YGR184C 5853 nt2.13□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 VPS8YAL002W 3825 nt2.13□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 YLR140WYLR140W 327 nt2.13□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 NUP192YJL039C 5052 nt2.13□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 RAV1YJR033C 4074 nt2.12□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 SAC3YDR159W 3906 nt2.12□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 SPC98YNL126W 2541 nt2.12□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 snR74snR74 88 nt2.12□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.12□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.12□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 RPB10YOR210W 213 nt2.12□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 SPO75YLL005C 2607 nt2.11□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 YEL014CYEL014C 306 nt2.11□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 YOR376WYOR376W 369 nt2.11□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.11□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 USO1YDL058W 5373 nt2.11□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 TOR2YKL203C 7425 nt2.11□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 SEC5YDR166C 2916 nt2.11□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.1□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 IST2YBR086C 2841 nt2.1□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 SLY1YDR189W 2001 nt2.1□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.1□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 HUG1YML058W-A 207 nt2.09□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 SGF11YPL047W 300 nt2.09□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 YCL046WYCL046W 324 nt2.09□□□□□ -2.07
MDM20Q12387 YKU70YMR284W 1809 nt2.09□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 RGA1YOR127W 3024 nt2.08□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 NEO1YIL048W 3456 nt2.08□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 MNE1YOR350C 1992 nt2.07□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 RPS27BYHR021C 249 nt2.07□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 ZRG17YNR039C 1818 nt2.06□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 TRM3YDL112W 4311 nt2.06□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 YDL118WYDL118W 381 nt2.06□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.06□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 STF2YGR008C 255 nt2.06□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 YGL217CYGL217C 342 nt2.05□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 YBL012CYBL012C 402 nt2.05□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 YOR170WYOR170W 306 nt2.05□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 snR46snR46 197 nt2.05□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 SBE22YHR103W 2559 nt2.05□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 HER1YOR227W 3741 nt2.05□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 SRP14YDL092W 441 nt2.04□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 ENV11YGR071C 2583 nt2.04□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 BUD2YKL092C 3315 nt2.04□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.04□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.03□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 YOR218CYOR218C 420 nt2.03□□□□□ -2.08
MDM20Q12387 SPO21YOL091W 1830 nt2.03□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 RTT101YJL047C 2529 nt2.02□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 YJL120WYJL120W 324 nt2.02□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 ELG1YOR144C 2376 nt2.02□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 NAM7YMR080C 2916 nt2.02□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 YHR210CYHR210C 1026 nt2.01□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 YNL170WYNL170W 396 nt2.01□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 YBR174CYBR174C 315 nt2.01□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 CAT2YML042W 2013 nt2□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 SEY1YOR165W 2331 nt2□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 RPL34BYIL052C 366 nt2□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 GCN2YDR283C 4980 nt1.99□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 PIP2YOR363C 2991 nt1.99□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 RAD34YDR314C 2079 nt1.99□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 MSC6YOR354C 2079 nt1.99□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.99□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 ECM12YHR021W-A 456 nt1.99□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.99□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 TRL1YJL087C 2484 nt1.99□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 SXM1YDR395W 2835 nt1.99□□□□□ -2.09
MDM20Q12387 FKS1YLR342W 5631 nt1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 80 ms