Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.29□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 PAU18YLL064C 363 nt2.29□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 YNL338WYNL338W 159 nt2.29□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 PAU6YNR076W 363 nt2.29□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 CHC1YGL206C 4962 nt2.29□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.29□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 INP2YMR163C 2118 nt2.29□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 PDE2YOR360C 1581 nt2.28□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.28□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 VPS8YAL002W 3825 nt2.28□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.28□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 DGR1YNL130C-A 147 nt2.28□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 NOP14YDL148C 2433 nt2.28□□□□□ -2.04
CLF1Q12309 SPT21YMR179W 2277 nt2.28□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 VPS54YDR027C 2670 nt2.27□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 snR74snR74 88 nt2.27□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.27□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 YCL046WYCL046W 324 nt2.27□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 MNL2YLR057W 2550 nt2.27□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 IRR1YIL026C 3453 nt2.26□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 YDR341CYDR341C 1824 nt2.26□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 SWI5YDR146C 2130 nt2.26□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 SAC3YDR159W 3906 nt2.25□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 YCR043CYCR043C 384 nt2.25□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.25□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 SNF5YBR289W 2718 nt2.25□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 RFX1YLR176C 2436 nt2.25□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.24□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 SYH1YPL105C 2550 nt2.24□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 MUK1YPL070W 1839 nt2.24□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 NAM7YMR080C 2916 nt2.24□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 TMA7YLR262C-A 195 nt2.24□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 UBP2YOR124C 3819 nt2.24□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 KIP1YBL063W 3336 nt2.24□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 PET309YLR067C 2898 nt2.24□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 NIP100YPL174C 2607 nt2.23□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 BPH1YCR032W 6504 nt2.23□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 SLM1YIL105C 2061 nt2.23□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 TRS65YGR166W 1683 nt2.23□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 RPL37BYDR500C 267 nt2.23□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt2.23□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 RPB10YOR210W 213 nt2.23□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 YPR092WYPR092W 306 nt2.23□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 ATG9YDL149W 2994 nt2.23□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 NEO1YIL048W 3456 nt2.23□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 SPC98YNL126W 2541 nt2.23□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 HER1YOR227W 3741 nt2.22□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 YMR045CYMR045C 5268 nt2.22□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 CAT2YML042W 2013 nt2.22□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 LYS14YDR034C 2373 nt2.22□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt2.22□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 YLR419WYLR419W 4308 nt2.22□□□□□ -2.05
CLF1Q12309 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.21□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 YBL012CYBL012C 402 nt2.21□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 SPO75YLL005C 2607 nt2.21□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 MGA2YIR033W 3342 nt2.2□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 PRP39YML046W 1890 nt2.2□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 PDR8YLR266C 2106 nt2.2□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 SEC31YDL195W 3822 nt2.2□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.2□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 SPP41YDR464W 4308 nt2.19□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 OLI1Q0130 231 nt2.19□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 VPS55YJR044C 423 nt2.19□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 BUD2YKL092C 3315 nt2.19□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 SWI6YLR182W 2412 nt2.18□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.18□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 YGL217CYGL217C 342 nt2.18□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 RRT15YLR162W-A 189 nt2.18□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.18□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 GCN2YDR283C 4980 nt2.18□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 SEC5YDR166C 2916 nt2.17□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 SRP14YDL092W 441 nt2.17□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 ATP8Q0080 147 nt2.17□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.17□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 YLR140WYLR140W 327 nt2.17□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.16□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 SGF11YPL047W 300 nt2.16□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 UBR2YLR024C 5619 nt2.15□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 AGC1YPR021C 2709 nt2.15□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 YKU70YMR284W 1809 nt2.15□□□□□ -2.06
CLF1Q12309 ZRG8YER033C 3231 nt2.15□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 YEL014CYEL014C 306 nt2.15□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 YOR376WYOR376W 369 nt2.15□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.15□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 HSH155YMR288W 2916 nt2.14□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 MYO2YOR326W 4725 nt2.14□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 ZRG17YNR039C 1818 nt2.14□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 SPO21YOL091W 1830 nt2.14□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 LHS1YKL073W 2646 nt2.14□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 RPS27BYHR021C 249 nt2.13□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 YDL118WYDL118W 381 nt2.12□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 ENV11YGR071C 2583 nt2.12□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt2.11□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 SLY1YDR189W 2001 nt2.11□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.1□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2.1□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 LRE1YCL051W 1752 nt2.1□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 YJL120WYJL120W 324 nt2.09□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.09□□□□□ -2.07
CLF1Q12309 RPL31AYDL075W 342 nt2.08□□□□□ -2.08
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