Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMC4	Q12267	YDR114C	YDR114C	303 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	YFR057W	YFR057W	456 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	MAM33	YIL070C	801 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	RPM2	YML091C	3609 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	COX5B	YIL111W	456 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	SMD2	YLR275W	333 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	CSM4	YPL200W	471 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	NUP82	YJL061W	2142 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	ASE1	YOR058C	2658 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	OST4	YDL232W	111 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	OLI1	Q0130	231 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	GIM5	YML094W	492 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	YNL162W-A	YNL162W-A	219 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	YKU70	YMR284W	1809 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	COY1	YKL179C	2040 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	NFU1	YKL040C	771 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	ARV1	YLR242C	966 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	YNL146W	YNL146W	303 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
SMC4	Q12267	YPL044C	YPL044C	549 nt		-0.72	□□□□□ -2.53
SMC4	Q12267	GPG1	YGL121C	381 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
SMC4	Q12267	ECM9	YKR004C	1134 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
SMC4	Q12267	MCM10	YIL150C	1716 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
SMC4	Q12267	YDL068W	YDL068W	330 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
SMC4	Q12267	YCR022C	YCR022C	345 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
SMC4	Q12267	VPS28	YPL065W	729 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
SMC4	Q12267	RFX1	YLR176C	2436 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
SMC4	Q12267	MMS21	YEL019C	804 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
SMC4	Q12267	YDL152W	YDL152W	366 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
SMC4	Q12267	PRP21	YJL203W	843 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
SMC4	Q12267	RPS7B	YNL096C	573 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
SMC4	Q12267	YMR141W-A	YMR141W-A	225 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	MFA2	YNL145W	117 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	YAL067W-A	YAL067W-A	228 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	AFB1	YLR040C	675 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	HTB2	YBL002W	396 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	YPR160W-A	YPR160W-A	81 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	RPL29	YFR032C-A	180 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	YKL023C-A	YKL023C-A	228 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	NIP1	YMR309C	2439 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	HTB1	YDR224C	396 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	RMD6	YEL072W	696 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	YER038W-A	YER038W-A	381 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	YLL032C	YLL032C	2478 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	COG6	YNL041C	2520 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	YMR158C-A	YMR158C-A	138 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	YPR142C	YPR142C	564 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	DIE2	YGR227W	1578 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	BI3	Q0115	1554 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
SMC4	Q12267	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	MRPL31	YKL138C	396 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	YOR345C	YOR345C	351 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	YPL205C	YPL205C	345 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	YGL204C	YGL204C	306 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	ATP20	YPR020W	348 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	YDR008C	YDR008C	351 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	YGL042C	YGL042C	306 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	YJR079W	YJR079W	330 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	YMR153C-A	YMR153C-A	336 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	TFB6	YOR352W	1032 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	PET20	YPL159C	762 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	YPL185W	YPL185W	396 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	YBR064W	YBR064W	429 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	snR24	snR24	89 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	YPL119C-A	YPL119C-A	264 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	YFR012W-A	YFR012W-A	87 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	PFS1	YHR185C	714 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	YDR290W	YDR290W	330 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	TDA2	YER071C	381 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	BI4	Q0120	1917 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	snR36	snR36	182 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	PAN3	YKL025C	2040 nt		-0.91	□□□□□ -2.55
SMC4	Q12267	RUB1	YDR139C	234 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	YJR141W	YJR141W	1044 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	YLR399W-A	YLR399W-A	105 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	snR79	snR79	84 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	RSM18	YER050C	417 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	YPR099C	YPR099C	357 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	snR44	snR44	211 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	YLR198C	YLR198C	360 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	snR33	snR33	183 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	YER076W-A	YER076W-A	348 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	ZIP2	YGL249W	2115 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	15S_rRNA	15S_rRNA	1649 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	YPR096C	YPR096C	303 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	YJL086C	YJL086C	369 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	CMS1	YLR003C	876 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	YLR146W-A	YLR146W-A	189 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	YMR075C-A	YMR075C-A	366 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	QCR7	YDR529C	384 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	YBR121C-A	YBR121C-A	159 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
SMC4	Q12267	LSM4	YER112W	564 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	YLR271W	YLR271W	825 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	PAA1	YDR071C	576 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	ATC1	YDR184C	885 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	GSP1	YLR293C	660 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	SNU56	YDR240C	1479 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	YER158W-A	YER158W-A	216 nt		-0.99	□□□□□ -2.57

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.9 ms