Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YHR130CYHR130C 336 nt0.79□□□□□ -2.28
USB1Q12208 YBL071CYBL071C 309 nt0.79□□□□□ -2.28
USB1Q12208 LOA1YPR139C 903 nt0.79□□□□□ -2.28
USB1Q12208 PAC1YOR269W 1485 nt0.79□□□□□ -2.28
USB1Q12208 MPT5YGL178W 2580 nt0.78□□□□□ -2.28
USB1Q12208 UBP3YER151C 2739 nt0.78□□□□□ -2.28
USB1Q12208 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.78□□□□□ -2.28
USB1Q12208 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.78□□□□□ -2.28
USB1Q12208 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.78□□□□□ -2.28
USB1Q12208 SWI6YLR182W 2412 nt0.78□□□□□ -2.28
USB1Q12208 NUT1YGL151W 3399 nt0.77□□□□□ -2.29
USB1Q12208 SMC1YFL008W 3678 nt0.77□□□□□ -2.29
USB1Q12208 ERP4YOR016C 624 nt0.77□□□□□ -2.29
USB1Q12208 RIM20YOR275C 1986 nt0.77□□□□□ -2.29
USB1Q12208 FIG4YNL325C 2640 nt0.76□□□□□ -2.29
USB1Q12208 SET3YKR029C 2256 nt0.76□□□□□ -2.29
USB1Q12208 YDR269CYDR269C 324 nt0.76□□□□□ -2.29
USB1Q12208 YLR171WYLR171W 390 nt0.76□□□□□ -2.29
USB1Q12208 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.76□□□□□ -2.29
USB1Q12208 IRC23YOR044W 474 nt0.76□□□□□ -2.29
USB1Q12208 PAU24YBR301W 363 nt0.76□□□□□ -2.29
USB1Q12208 STO1YMR125W 2586 nt0.75□□□□□ -2.29
USB1Q12208 DOP1YDR141C 5097 nt0.75□□□□□ -2.29
USB1Q12208 TIM13YGR181W 318 nt0.75□□□□□ -2.29
USB1Q12208 YLR101CYLR101C 396 nt0.75□□□□□ -2.29
USB1Q12208 UPS1YLR193C 528 nt0.75□□□□□ -2.29
USB1Q12208 YLR287CYLR287C 1068 nt0.75□□□□□ -2.29
USB1Q12208 UBC7YMR022W 498 nt0.75□□□□□ -2.29
USB1Q12208 ATP19YOL077W-A 207 nt0.75□□□□□ -2.29
USB1Q12208 YPL182CYPL182C 384 nt0.75□□□□□ -2.29
USB1Q12208 snR54snR54 86 nt0.75□□□□□ -2.29
USB1Q12208 YPR117WYPR117W 7470 nt0.75□□□□□ -2.29
USB1Q12208 AIM9YER080W 1884 nt0.75□□□□□ -2.29
USB1Q12208 YAR009CYAR009C 3591 nt0.75□□□□□ -2.29
USB1Q12208 YIL059CYIL059C 366 nt0.74□□□□□ -2.29
USB1Q12208 YBR012CYBR012C 420 nt0.74□□□□□ -2.29
USB1Q12208 MYO1YHR023W 5787 nt0.74□□□□□ -2.29
USB1Q12208 LCD1YDR499W 2244 nt0.73□□□□□ -2.29
USB1Q12208 CBS1YDL069C 690 nt0.73□□□□□ -2.29
USB1Q12208 YHL041WYHL041W 450 nt0.73□□□□□ -2.29
USB1Q12208 EFR3YMR212C 2349 nt0.73□□□□□ -2.29
USB1Q12208 RKR1YMR247C 4689 nt0.73□□□□□ -2.29
USB1Q12208 GEA2YEL022W 4380 nt0.73□□□□□ -2.29
USB1Q12208 YDL011CYDL011C 324 nt0.72□□□□□ -2.29
USB1Q12208 snR72snR72 98 nt0.72□□□□□ -2.29
USB1Q12208 NPC2YDL046W 522 nt0.72□□□□□ -2.29
USB1Q12208 YGR042WYGR042W 816 nt0.72□□□□□ -2.29
USB1Q12208 ECL1YGR146C 636 nt0.72□□□□□ -2.29
USB1Q12208 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.72□□□□□ -2.29
USB1Q12208 RPS27AYKL156W 249 nt0.72□□□□□ -2.29
USB1Q12208 RRT1YBL048W 312 nt0.72□□□□□ -2.29
USB1Q12208 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.72□□□□□ -2.29
USB1Q12208 COG4YPR105C 2586 nt0.71□□□□□ -2.3
USB1Q12208 YJL135WYJL135W 318 nt0.71□□□□□ -2.3
USB1Q12208 RPL26AYLR344W 384 nt0.71□□□□□ -2.3
USB1Q12208 RPB10YOR210W 213 nt0.71□□□□□ -2.3
USB1Q12208 SLY1YDR189W 2001 nt0.71□□□□□ -2.3
USB1Q12208 ZIP2YGL249W 2115 nt0.7□□□□□ -2.3
USB1Q12208 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.7□□□□□ -2.3
USB1Q12208 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.7□□□□□ -2.3
USB1Q12208 DIE2YGR227W 1578 nt0.7□□□□□ -2.3
USB1Q12208 YJR003CYJR003C 1560 nt0.7□□□□□ -2.3
USB1Q12208 YAP6YDR259C 1152 nt0.69□□□□□ -2.3
USB1Q12208 RPS30BYOR182C 192 nt0.69□□□□□ -2.3
USB1Q12208 snR51snR51 107 nt0.68□□□□□ -2.3
USB1Q12208 YDL206WYDL206W 2289 nt0.68□□□□□ -2.3
USB1Q12208 SLI15YBR156C 2097 nt0.68□□□□□ -2.3
USB1Q12208 PDE2YOR360C 1581 nt0.67□□□□□ -2.3
USB1Q12208 NUP157YER105C 4176 nt0.67□□□□□ -2.3
USB1Q12208 YKL083WYKL083W 615 nt0.67□□□□□ -2.3
USB1Q12208 YOR199WYOR199W 330 nt0.67□□□□□ -2.3
USB1Q12208 SDH7YDR511W 402 nt0.66□□□□□ -2.3
USB1Q12208 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.66□□□□□ -2.3
USB1Q12208 PCF11YDR228C 1881 nt0.66□□□□□ -2.3
USB1Q12208 INA22YIR024C 651 nt0.65□□□□□ -2.31
USB1Q12208 YKL202WYKL202W 582 nt0.65□□□□□ -2.31
USB1Q12208 YLR456WYLR456W 615 nt0.65□□□□□ -2.31
USB1Q12208 ISF1YMR081C 1017 nt0.65□□□□□ -2.31
USB1Q12208 MRPL50YNR022C 420 nt0.65□□□□□ -2.31
USB1Q12208 YOL160WYOL160W 342 nt0.65□□□□□ -2.31
USB1Q12208 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.65□□□□□ -2.31
USB1Q12208 MMS4YBR098W 2076 nt0.65□□□□□ -2.31
USB1Q12208 WAR1YML076C 2835 nt0.64□□□□□ -2.31
USB1Q12208 YDL196WYDL196W 330 nt0.64□□□□□ -2.31
USB1Q12208 SWF1YDR126W 1011 nt0.64□□□□□ -2.31
USB1Q12208 YAR047CYAR047C 321 nt0.64□□□□□ -2.31
USB1Q12208 OST1YJL002C 1431 nt0.64□□□□□ -2.31
USB1Q12208 SEC1YDR164C 2175 nt0.63□□□□□ -2.31
USB1Q12208 NHP2YDL208W 471 nt0.63□□□□□ -2.31
USB1Q12208 YDR521WYDR521W 336 nt0.63□□□□□ -2.31
USB1Q12208 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.63□□□□□ -2.31
USB1Q12208 CMC4YMR194C-B 222 nt0.63□□□□□ -2.31
USB1Q12208 YPL229WYPL229W 621 nt0.63□□□□□ -2.31
USB1Q12208 ALY2YJL084C 3141 nt0.63□□□□□ -2.31
USB1Q12208 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.62□□□□□ -2.31
USB1Q12208 PKH2YOL100W 3246 nt0.62□□□□□ -2.31
USB1Q12208 RAD34YDR314C 2079 nt0.61□□□□□ -2.31
USB1Q12208 RPS24BYIL069C 408 nt0.6□□□□□ -2.31
USB1Q12208 IES4YOR189W 351 nt0.6□□□□□ -2.31
USB1Q12208 BFR2YDR299W 1605 nt0.6□□□□□ -2.31
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