Protein–RNA interactions for Protein: Q12143

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1, yeastyeast

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSL1Q12143 YLR252WYLR252W 306 nt0.12□□□□□ -2.39
NSL1Q12143 YHL042WYHL042W 453 nt0.11□□□□□ -2.39
NSL1Q12143 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.11□□□□□ -2.39
NSL1Q12143 BIR1YJR089W 2865 nt0.11□□□□□ -2.39
NSL1Q12143 IQG1YPL242C 4488 nt0.11□□□□□ -2.39
NSL1Q12143 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.1□□□□□ -2.39
NSL1Q12143 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.1□□□□□ -2.39
NSL1Q12143 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.1□□□□□ -2.39
NSL1Q12143 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.1□□□□□ -2.39
NSL1Q12143 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.1□□□□□ -2.39
NSL1Q12143 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.1□□□□□ -2.39
NSL1Q12143 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.1□□□□□ -2.39
NSL1Q12143 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.1□□□□□ -2.39
NSL1Q12143 CDC33YOL139C 642 nt0.1□□□□□ -2.39
NSL1Q12143 CSM4YPL200W 471 nt0.1□□□□□ -2.39
NSL1Q12143 LOA1YPR139C 903 nt0.1□□□□□ -2.39
NSL1Q12143 ESP1YGR098C 4893 nt0.1□□□□□ -2.39
NSL1Q12143 YGR115CYGR115C 780 nt0.09□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.09□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 YCK3YER123W 1575 nt0.09□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 PET111YMR257C 2403 nt0.08□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 YJR079WYJR079W 330 nt0.08□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 SDS22YKL193C 1017 nt0.08□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 YOR248WYOR248W 303 nt0.08□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 ZIP2YGL249W 2115 nt0.08□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 MLP1YKR095W 5628 nt0.07□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 SPO13YHR014W 876 nt0.07□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.07□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.06□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 BSC3YLR465C 309 nt0.06□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 UBC7YMR022W 498 nt0.06□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 YDR269CYDR269C 324 nt0.05□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 WIP1YDR374W-A 270 nt0.05□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.05□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 POP7YBR167C 423 nt0.05□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 YPT6YLR262C 648 nt0.04□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 RCN2YOR220W 798 nt0.04□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 YPL044CYPL044C 549 nt0.04□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 PKH2YOL100W 3246 nt0.04□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 VIK1YPL253C 1944 nt0.03□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 ILM1YJR118C 612 nt0.03□□□□□ -2.4
NSL1Q12143 STE5YDR103W 2754 nt0.03□□□□□ -2.41
NSL1Q12143 AFR1YDR085C 1863 nt0.03□□□□□ -2.41
NSL1Q12143 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.03□□□□□ -2.41
NSL1Q12143 COX12YLR038C 252 nt0.02□□□□□ -2.41
NSL1Q12143 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.02□□□□□ -2.41
NSL1Q12143 YGL230CYGL230C 444 nt0.01□□□□□ -2.41
NSL1Q12143 BIG1YHR101C 1008 nt0.01□□□□□ -2.41
NSL1Q12143 FYV10YIL097W 1551 nt0.01□□□□□ -2.41
NSL1Q12143 MLP2YIL149C 5040 nt0.01□□□□□ -2.41
NSL1Q12143 VMA21YGR105W 234 nt-0.01□□□□□ -2.41
NSL1Q12143 UBS1YBR165W 834 nt-0.01□□□□□ -2.41
NSL1Q12143 YCL002CYCL002C 792 nt-0.01□□□□□ -2.41
NSL1Q12143 snR9snR9 187 nt-0.02□□□□□ -2.41
NSL1Q12143 YJL135WYJL135W 318 nt-0.02□□□□□ -2.41
NSL1Q12143 YMR254CYMR254C 309 nt-0.02□□□□□ -2.41
NSL1Q12143 YBR063CYBR063C 1215 nt-0.02□□□□□ -2.41
NSL1Q12143 INP2YMR163C 2118 nt-0.03□□□□□ -2.41
NSL1Q12143 IRC16YPR038W 360 nt-0.04□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 YPR039WYPR039W 336 nt-0.04□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 EFR3YMR212C 2349 nt-0.04□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 SEC8YPR055W 3198 nt-0.05□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 SLX9YGR081C 633 nt-0.05□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 PHS1YJL097W 654 nt-0.05□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 YNL050CYNL050C 813 nt-0.05□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 AFB1YLR040C 675 nt-0.06□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 snR13snR13 124 nt-0.06□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 CUL3YGR003W 2235 nt-0.07□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 YGL239CYGL239C 315 nt-0.07□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 SCEIQ0160 708 nt-0.07□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 YOL014WYOL014W 375 nt-0.07□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 MND1YGL183C 660 nt-0.08□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 APQ13YJL075C 417 nt-0.08□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 RPB10YOR210W 213 nt-0.08□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 PRP42YDR235W 1635 nt-0.09□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 MCM10YIL150C 1716 nt-0.09□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 YOR053WYOR053W 342 nt-0.09□□□□□ -2.42
NSL1Q12143 MRPL32YCR003W 552 nt-0.1□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 OLI1Q0130 231 nt-0.1□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 YBR064WYBR064W 429 nt-0.1□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.11□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 YOL160WYOL160W 342 nt-0.11□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 PRP5YBR237W 2550 nt-0.11□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 YDL187CYDL187C 330 nt-0.12□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 PRP21YJL203W 843 nt-0.12□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 ECM9YKR004C 1134 nt-0.12□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.12□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 YPL185WYPL185W 396 nt-0.12□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.12□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 YDR029WYDR029W 315 nt-0.13□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 RPS27AYKL156W 249 nt-0.13□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 YLR198CYLR198C 360 nt-0.13□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 COG8YML071C 1824 nt-0.14□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.14□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 MRPS8YMR158W 468 nt-0.14□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 RAD34YDR314C 2079 nt-0.14□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 QCR9YGR183C 201 nt-0.15□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 YPL261CYPL261C 309 nt-0.15□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 snR190snR190 190 nt-0.15□□□□□ -2.43
NSL1Q12143 COX5BYIL111W 456 nt-0.16□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.8 ms